牛分枝杆菌Spoligotyping和VNTR-MIRU的基因分型研究  

Application of Spoligotyping and VNTR-MIRU in genotype studies of Mycobacterium bovis in China

作　　者：杜艳芬[1] 林靖凯[1] 刘思国[1] 王春来[1] 刘慧芳[1] 司微[1] 王聃[1] 赵海玲[1] 

机构地区：[1]中国农业科学院哈尔滨兽医研究所兽医生物技术国家重点实验室细菌病研究室,黑龙江哈尔滨150001

出　　处：《中国预防兽医学报》2009年第2期114-116,126,共4页Chinese Journal of Preventive Veterinary Medicine

基　　金：973项目(2006CB504400)

摘　　要：为了探讨间隔区寡核苷酸分型(Spoligotyping)和数目可变串联重复序列-结核分枝杆菌散在分布重复单元(VNTR-MIRU)基因分型法用于国内牛分枝杆菌的基因分型研究,初步了解我国牛分枝杆菌基因型种类、分布以及2种方法在我国应用的可行性。本研究收集东北、西北、华北、华南4个地区分离的10株牛分枝杆菌分离株,分别采用Spoligotyping和VNTR-MIRU对这些分离株进行基因分型,比较两种方法的分型效果,评价其在牛分枝杆菌基因分型中的应用。结果表明,使用Spoligotyping方法,10株牛分枝杆菌呈现出4种基因型,使用VNTR-MIRU方法,10株分离株也呈现4种基因型;当两种方法联合使用时,可以分为5种基因型,其中的2个菌株具有独特的基因型,显示来自不同地区的牛分枝杆菌存在主要的流行型为BCG家族。将Spoligotyping和VNTR-MIRU联合使用,可有效提高牛结核病的分子流行病学调查和病原学的监测效果。To investigate the application of spacer oligotyping （Spoligotyping） and variable number tandem repeatsmycobacterial interspersed repetitive unit （VNTR-MIRU） in epidemiological studies of Mycobacterium bovis, 10 strains of M. bovis were analyzed by Spoligotyping and VNTR-MIRU and compared. Four genotypes could be detected by Spoligotyping and VNTR-MIRU, respectively. However, 5 genotypes were detected by combination of Spoligotyping and VNTR-MIRU, including a genotype represented by 2 unique isolates. The results suggested that there may exist epidemic strain clusters in M.bovis from different provinces. The combination of Spoligotyping and VNTR-MIRU would improve the effectiveness of epidemiological investigation and pathological detection of bovine tuberculosis.

关 键 词：牛分枝杆菌 SPOLIGOTYPING VNTR MIRU 基因分型 

分 类 号：S852.618[农业科学—基础兽医学]