基于同源建模的蛋白质结构预测方法的研究  被引量:3

Prediction-Methods Researqch of Protein Structure Based on Homologous Modelling

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作  者:陈红梅[1] 周俊祥[1] 

机构地区:[1]商丘师范学院计算机科学系,河南商丘476000

出  处:《河南科学》2009年第9期1108-1110,共3页Henan Science

基  金:国家自然科学基金项目(50323001)

摘  要:针对profile-profile方法中profile中出现的数据稀疏问题所采用的数据平滑技术以及对于生成排列过程中对于新的计分体系所采用的动态规划算法,并且在HOMSTRAD数据库上进行的排列精度实验,结果证明采用profile-profile方法并结合数据平滑和动态规划技术可以有效地提高查询序列和目标序列的排列精度.Data smooth we use in order to solve data sparseness in profile of profile-profile method and dynamic programming algorithm of new scoring system in the process of alignment. And the experiment of alignment precision tested in database HOMSTRAD. We improve the precision of alignment between query sequence and target sequence effectively by profile-profile.

关 键 词:蛋白质结构预测 同源建模 数据平滑 

分 类 号:O24[理学—计算数学]

 

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