蛋白质序列混沌游戏表示模拟效果的优化  

Optimization of Simulation for Chaos Game Representation of Protein Sequence

作　　者：肖前军[1] 周金玉[1] 邓总纲[1] 

机构地区：[1]湖南理工职业技术学院,湖南湘潭411104

出　　处：《汕头大学学报（自然科学版）》2010年第1期35-41,共7页Journal of Shantou University：Natural Science Edition

基　　金：2008年湖南省教育厅项目(08C882)

摘　　要：蛋白质序列的可视化表示——混沌游戏表示呈现出明显的分形特征.根据分形的产生机理,可以用递归迭代函数系统很好地模拟蛋白质序列的混沌游戏表示.在实验中发现,其模拟效果可以进一步优化,可能有助于更准确地进行物种亲缘关系的分析.A fractal pattern is apparent in visual representation of a prolein sequence： Chaos Came Representation（CGR）. Aeeording to the mechanism of lractal forming, Chaos Game Representation（CGR）of protein sequences can be simulated by Recurrent Iterated Function Syslem（RIFS）. In experiments, a close approximation of CGFI is obtained by the method. The results of simulation can be further optimized and the phylogenetic tree can be correctly worked out.

关 键 词：递归迭代函数系统 混沌游戏表示 模拟 蛋白质序列 优化 

分 类 号：O29[理学—应用数学] O811.4[理学—数学]