Vif-APO相关的HIV-1病毒模型  

作　　者：王懿[1,2] 来鲁华[1,3] 

机构地区：[1]北京大学理论生物学中心,北京100871 [2]北京大学物理学院,北京100871 [3]北京分子科学国家实验室,分子动态与稳态结构国家重点实验室,北京大学化学与分子工程学院,北京100871

出　　处：《科学通报》2010年第14期1310-1321,共12页Chinese Science Bulletin

基　　金：国家自然科学基金(10721403);国家重点基础研究发展计划(2009CB918500);国家高技术研究发展计划(2006AA020400)资助项目

摘　　要：病毒感染因子Vif对控制HIV-1病毒的感染能力非常重要,它通过和细胞抗病毒蛋白APOBEC家族(简写成APO)的相互作用,引发APO的快速降解从而阻止APO被包装到新生的病毒粒子中.在本论文中,我们提出一个数学模型来定量地描述这种典型的病毒-宿主相互作用.为检验该模型,我们将计算模拟结果和4组已发表的实验数据进行了对比.在此基础上进行了系统的参数敏感性分析和扰动分析,表明与APO相关的参数对于新生HIV-1病毒粒子的感染能力非常重要.我们发现病毒结构蛋白Gag的生成速率以及单位新生病毒粒子所需的Gag蛋白分子数目呈现出对高病毒粒子产生速率和低APO包装入新生病毒粒子程度的优化现象,并且模型中的许多参数只在较小的取值范围内对病毒才是有益的.我们还发现针对激活病毒RNA合成的调控蛋白Tat的小扰动会导致Vif和APO包装入新生病毒粒子的量呈现开关效应.这些发现将有助于理解HIV-1病毒的高突变率和潜伏现象,并为药物设计定位关键的靶标提供帮助.

关 键 词：生化网络模型 病毒宿主相互关系 HIV-1病毒 VIF APO GAG TAT 

分 类 号：R-332[医药卫生]