基因本体论的蟾蜍bHLH转录因子功能富集分布  

Investigation of molecular function enrichment of bHLH transcription factors in frog genomes based on gene ontology analysis

作　　者：刘武艺[1] 

机构地区：[1]阜阳师范学院生物系,安徽阜阳236041

出　　处：《生物信息学》2011年第4期292-298,302,共8页Chinese Journal of Bioinformatics

基　　金：国家自然科学基金(31071310);安徽省教育厅自然科学基金(2006KJ224B);安徽高校优秀青年教师基金(2006jql222);阜阳师院自然科学基金(2005QL11)联合资助

摘　　要：基因本体论是国际上标准的基因和蛋白质功能知识词汇。利用基因本体论的功能富集分布比较和分析了两种蟾蜍bHLH基因分子功能分布特点。结果发现,两种蟾蜍的bHLH基因均有显著富集分布的GO注释语句,其中转录调控活性(GO:0030528)、转录调控(GO:0045449)、DNA结合(GO:0003677)、RNA代谢过程调控(GO:0051252)、DNA依赖的转录调控(GO:0006355)、转录(GO:0006350)和转录因子活性(GO:0003700)等频率很高,表明这些GO注释是蟾蜍bHLH基因常见的功能;此外,蟾蜍bHLH基因在肌肉器官发育、神经管和眼发育等一些重要的发育或生理过程的基因表达调控中发挥着重要的作用。The Gene ontology is a major bioinformatics initiative to unify the representation of gene and gene product attributes across all species.The molecular functions of bHLH transcription factors identified from two frog＇s genomes were compared and analyzed based on molecular function enrichment of Gene Ontology.The results indicated that these bHLH genes tend to be related to transcription regulator activity （GO：0030528）,regulation of transcription （GO：0045449）,DNA binding （GO：0003677）,regulation of RNA metabolic process（GO：0051252）,DNA-dependent regulation of transcription （GO：0006355）,transcription （GO：0006350）,and transcription factor activity（GO：0003700）,expected from the common GO categories of transcriptional factors.A number of bHLH genes play regulation significant role in special development or physiology processes,such as muscle organ,neural tube,and eye development.

关 键 词：蟾蜍 BHLH 基因本体论 功能注释 

分 类 号：Q343[生物学—遗传学]