极端嗜盐古菌代谢网络研究  

Research on metabolic network of extremely halophilic archaea

作　　者：丁德武[1] 

机构地区：[1]池州学院数学与计算机科学系,安徽池州247000

出　　处：《计算机与应用化学》2012年第2期200-202,206,共4页Computers and Applied Chemistry

基　　金：安徽省教育厅自然科学项目(KJ2010B133)

摘　　要：极端嗜盐古菌(extreInely thermophilic archaea)属于广域古菌界盐杆菌科,是古菌域中的典型生理类群,也是重要的极端微生物资源。文章主要对一种极端嗜盐古菌——盐沼盐杆菌(Halobacterium salinarum R1)——代谢网络的结构与功能进行了分析。对高质量盐沼盐杆菌代谢网络数据进行整理,构建了其中所有的代谢反应列表,并用代谢物图来表示。分析了该网络的功能模块和关键节点,并讨论了它们的生物学功能意义。Extremely halophilic archaea belonging to the euryarchaeota halobium branch,it is a typical population in archaea,and very important to microbial resources.In this article,we mainly study the structure and function of metabolic network about one extremely halophilic archaea：Halobacterium salinarum Rl.We obtain a list of all metabolic reactions in Halobacterium salinarum R1 from published high-quality metabolic models,and represent it with metabolite graph.We analyze functional modules and hubs of the network,and discussed their biological signification.

关 键 词：复杂网络 代谢网络 模块性 系统生物学 

分 类 号：TP339[自动化与计算机技术—计算机系统结构]