人精子特异性乳酸脱氢酶结构和功能的计算生物学分析  

Computational Analysis on Structure and Function of Human Sperm-specific Lactate Dehydrogenase

作　　者：汤莹[1] 颜水堤[1] 郑德柱[1] 张朵[1] 林宇翔[1] 兰风华[1] 

机构地区：[1]南京军区福州总医院全军计划生育优生优育研究所,福州350025

出　　处：《中国生物化学与分子生物学报》2013年第11期1088-1096,共9页Chinese Journal of Biochemistry and Molecular Biology

基　　金：国家自然科学基金(No.81170562);福建省自然科学基金(No.26111058)~~

摘　　要：精子特异性乳酸脱氢酶(lactate dehydrogenase,LDH),又称乳酸脱氢酶C4(lactate dehydrogenase C4,LDH-C4),特异性地存在于哺乳动物发育成熟的睾丸组织中,与精子的生成、代谢、获能等有密切关系.根据GenBank数据库中人LDH-C4氨基酸序列(P07864),利用PROSITE数据库预测人LDH-C4的功能基序;利用Clustalw2、TreeView1.6.6进行LDH-C4进化树的构建;利用I-TASSER软件预测人LDH-C4的二、三、四级结构以及功能位点.结果表明:在190!196位有1个LDH活性位点,该位点为脊椎动物各亚型乳酸脱氢酶共有的催化位点,为进化中的1个保守序列;从进化树来看,LDHC和LDHB的亲缘关系比较近;人LDH-C4与小鼠LDH-C4的二级、三级结构具有很高的相似性;LDH-C4属乳酸脱氢酶-苹果酸脱氢酶(LDH-MDH)超家族中的LDH-1(cd05293)家族的成员,属于NAD依赖性酶,拥有LDH-1家族具备的基本结构特点.以上结果为研究LDH-C4基因突变对其功能的影响打下基础.

关 键 词：乳酸脱氢酶C4 精子特异性乳酸脱氢酶 计算生物学 

分 类 号：R394.3[医药卫生—医学遗传学]