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作 者:李治华[1,2] 黄驰[2] 王自鹏[2] 姚英政[2] 董琳[2] 谢江[2] 李浦[2] 陈福生[1]
机构地区:[1]华中农业大学食品科技学院,湖北武汉430070 [2]四川省农业科学院加工所,四川成都610066
出 处:《西南农业学报》2013年第6期2663-2665,共3页Southwest China Journal of Agricultural Sciences
基 金:四川省农业科学院青年基金项目(2012QNJJ-024);国家自然科学基金项目(31201192);国家自然科学基金补助项目(2013KXJJ-026);四川省财政基因工程专项资金项目(2011JYGC12-037)
摘 要:宏基因组DNA提取是免培养方法研究微生物菌落多样性的基础。本研究对常用的几种微生物宏基因组DNA提取方法进行比较研究,并结合郫县发酵豆瓣酱的特点,开发出适合发酵豆瓣酱微生物宏基因组DNA提取的方法。结果表明,使用磷酸缓冲溶液(pH7.2)+溶菌酶+(蛋白酶K-SDS)+(CTAB-NaCl)提取的方法能有效提高发酵豆瓣酱微生物群落宏基因组DNA的质量和产率,宏基因组DNA能满足后续研究的要求。本研究对其他发酵食品宏基因组DNA提取也具有参考价值。Metagenomic DNA extraction was a key technology to explore the DNAs from culture-independent microbial community. In this study, several common methods of extraction metagenomic DNA of microbial community were compared, and a specific method for fermented bean paste microbial DNA extraction was developed. The results showed that utilizing of phosphate buffer solution ( PBS pH7.2 ) + lysozyme + (proteinase K and SDS) + (CTAB-NaCl) extraction method could effectively improve the quality and field of the metagenomic DNA of microbial fermentation bean paste and could meet the requirements of further study. This method also provided a reference for similar fermentation microbial DNA extraction.
关 键 词:免培养 发酵豆瓣酱 微生物菌落 宏基因组DNA 提取
分 类 号:S37[农业科学—农产品加工]
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