二维蛋白质分子的热力学性质研究  

Study on the thermodynamic properties of two-dimensional proteins.

作　　者：王向红[1] 陶前[2] 夏阿根[2] 支义英 

机构地区：[1]温州师范学院物理系,浙江温州325000 [2]浙江大学物理系,浙江杭州310028

出　　处：《浙江大学学报（理学版）》2002年第4期400-403,共4页Journal of Zhejiang University（Science Edition）

基　　金：国家自然科学基金资助项目 (2 98740 12;2 0 1740 36 ) ;国家攀登计划"高分子凝聚态基本物理问题研究"项目 (95 -预- 12 );浙江省自然科学基金资助项目 (10 10 0 2 );浙江省教委科研资助项目 (2 0 0 0 - 114)

摘　　要：采用二维正方形格点模型 ,用完全计算法研究了蛋白质分子的热力学性质 .发现体系的配分函数 Z与链长 N存在关系 :ln Z=a N + b,其中 a,b仅与温度、相互作用有关 .总简并度 g0 (m)与链长 N存在关系 :g0 (m) =a· γN ,其中 a=0 .0 9,γ=2 .72 .同时计算了蛋白质分子在自然状态构象间的平均距离 ,发现当链长 N较大时 ,平均距离趋于 1.6 7.Using square lattice model and an enumeration calculation method, the thermodynamic properties of two-dimensional proteins is investigated.It is found that the relationship between partition function Z and chain length N can be expressed as lnZ=aN+b, where a and b depend only on temperature and interaction. The total degeneracy g 0(m) can be described by g 0(m)=a·γ N, where a=0.09, γ= 2.72. The average distance d between two natural conformations is measured and it is found that d is close to 1.67. Thus, it provides a method to study the thermodynamic properties of real protein chains.

关 键 词：蛋白质分子 热力学性质 完全计算法 简并度 构象间平均距离 氨基酸 分子结构 

分 类 号：Q518.102[生物学—生物化学]