三个猪品种Myf5基因的克隆及序列分析  

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作  者:袁恬[1] 冉雪琴[1] 王芳[1] 

机构地区:[1]贵州大学生命科学学院,贵阳550025

出  处:《中国畜牧兽医文摘》2014年第6期102-102,共1页

摘  要:为明确猪Myf5基因的蛋白结构及功能位点,从香猪、大自猪和大白×长白杂交猪背最长肌提取总RNA,采用RT-PCR技术克隆Myf5基因,其cDNA长893bp,包括完整的开放阅读框768bp,编码255个氨基酸。将所测序列与GenBank上已知猪种序列进行相似性比较,结果表明:香猪Myf5基因中有3个碱基变异,其中2个突变不改变编码的氨基酸为无义突变,1个突变使其编码的氨基酸由甲硫氨酸(M)变为亮氨酸(L)。大白猪没有碱基变化;大白×长白杂交猪Myf5基因中的1个突变,使其编码氨基酸由甘氨酸(E)变为谷氨酸(G)。将香猪与其他物种进行核苷酸和氨基酸编码区序列的相似性分析及生物信息学分析。相似性分析表明,香猪Myf5基因氨基酸编码区序列与绵羊、牛、马、兔、黑猩猩、非洲象和小鼠的相似性较高,均在88%以上,推测Myf5基因在哺乳动物具有一定的保守性;Myf5蛋白二级结构以无规则卷曲为主,其次为a螺旋,偶有B转角。预测Myf5蛋白不含信号肽序列,有29个磷酸化位点。

关 键 词:序列分析 猪品种 基因 克隆 相似性分析 RT-PCR技术 GENBANK 蛋白二级结构 

分 类 号:S828.2[农业科学—畜牧学]

 

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