HIV-1整合酶四聚体的模建及结构基础研究  

作　　者：左柯 胡建平[1,2] 杜文义[1] 梁立[1] 刘嵬[1] 苟小军[1] 

机构地区：[1]药食同源植物资源开发四川省高校重点实验室/四川抗菌素工业研究所/成都大学,四川成都610106 [2]乐山师范学院化学学院,四川乐山614004

出　　处：《江苏农业科学》2017年第22期32-37,共6页Jiangsu Agricultural Sciences

基　　金：国家自然科学基金(编号:11247018;11147175);四川省教育厅科研重点项目(编号:12ZA066);乐山市科技计划(编号:14SZD018)

摘　　要：HIV-1整合酶(HIV-1 IN)是目前开发抗艾滋病药中最具潜力的药物靶点之一,四聚体是该蛋白发挥生物学功能的主要聚集体形式。为了得到IN四聚体与病毒DNA的复合物,并研究其运动性与生物学功能的关系,采用同源模建、结构优化及叠落等方法,在Tn5转座酶的基础上建立了IN-DNA的复合物模型,并采用高斯网络模型和各向异性网络模型研究四聚体的运动模式。Ramachandran Plot分布和Profile-3D结果验证了复合物模型的合理性。运动模式结果表明,四聚体的N-端、C-端的运动有利于螯合DNA,而核心区的稳定状态是IN发挥整合作用的前提。分子对接结果表明,IN抑制剂更偏向于结合在四聚体中间CCD与病毒DNA结合的区域。

关 键 词：HIV-1整合酶四聚体 病毒DNA 高斯网络模型 各向异性网络模型 分子对接 

分 类 号：R918-39[医药卫生—药学]