基于FP树的蛋白质功能预测算法研究  

Research on the Protein Function Prediction Algorithm Based on FP Tree

作　　者：葛凌霄 GE Ling-xiao(College of Computer Science,Sichuan University,Chengdu 610065)

机构地区：[1]四川大学计算机学院,成都610065

出　　处：《现代计算机》2018年第6期17-19,共3页Modern Computer

摘　　要：研究在蛋白质相互作用网络里对未注释蛋白质的功能预测,以String DB的酵母细胞的相互作用网络为基础数据集,使用复杂网络的接近中心度对网络去边,最后使用FP-growth的算法对网络内的蛋白质进行功能预测。进行实验与验证,结果证明将关联分析运用于蛋白质相互作用网络有良好效果。Digs in protein interaction networks for annotation of protein function prediction.With StringDB yeast cell interaction network on the basis of data sets.Uses complex network closeness center degree to delete edge,finally uses the FP-growth algorithm for protein function predic?tion.Carries on the experiment and verification results show that the correlation analysis used in protein interaction network has a good ef?fect.

关 键 词：关联分析 蛋白质相互作用网络 蛋白质功能预测 

分 类 号：Q51[生物学—生物化学] Q811.4