PPBP基因是非小细胞肺癌治疗的一个新的潜在靶标  

作　　者：黄河 彭燕 卢娜[2] 姜洪波[3] 李成长[2] 

机构地区：[1]新乡医学院第四临床学院新乡市中心医院呼吸与危重症医学科一,河南新乡453000 [2]新乡医学院生理学与神经生物学教研室 [3]新乡医学院第三附属医院营养科

出　　处：《中国老年学杂志》2019年第18期4448-4452,共5页Chinese Journal of Gerontology

基　　金：新乡市科技攻关项目(XGG17034,CXGG17002)

摘　　要：目的利用生物信息学方法对非小细胞肺癌(NSCLC)的基因表达谱进行研究,筛选出与该病发生发展有关的关键基因。方法从GEO数据库中检索女性非吸烟肺癌患者的基因芯片数据,利用美国国立卫生研究院(NCBI)提供的GEO2R在线分析工具进行差异表达基因分析,用数据库DAVID对差异基因进行GO功能富集分析,将差异富集的基因输入string数据库进行KEGG通路富集分析并构建蛋白互作网络,将互作数据导入到Cytoscape软件并利用插件cytohubba分析网络拓扑结构,基于MCC算法选择排名前十位的关键基因,对关键基因进行Kaplan Meier生存分析。结果在NSCLC发病过程中,共鉴定出268个差异表达基因,其中有216个下调,52个上调。MCC算法所选取排名前十位的关键基因分别是:IL6、COL1A1、TIMP1、PPBP、MMP1、SPP1、CXCR2、CXCL2、CXCL13、COL11A1,其中PPBP在NSCLC患者发病过程中的作用尚未有报道,其余基因高表达的患者有较差的预后。结论利用生物信息学方法可有效选取NSCLC发病的关键基因,PPBP可能是NSCLC治疗的一个新靶标。

关 键 词：PPBP 非小细胞肺癌 关键基因 基因表达谱 

分 类 号：R73[医药卫生—肿瘤]