细胞周期素依赖性激酶活性中心残基与其抑制剂相互作用机制研究  被引量:2

Study on the Interaction Mechanism Between Cyclin-dependent Kinase Active Center Residues and Cyclin-dependent Kinase Inhibitors

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作  者:徐焱 刘中婷 华炳乾 庄文昌[1] 朱文友 Xu Yan;Liu Zhong-ting;Hua Bing-qian;Zhuang Wen-chang;Zhu Wen-you

机构地区:[1]徐州工程学院化学化工学院

出  处:《化工设计通讯》2019年第10期140-142,共3页Chemical Engineering Design Communications

基  金:国家自然科学基金(21703194);徐州市科技创新专项基金(KC17080);江苏高校“青蓝工程”

摘  要:以16个2-氨基噻唑衍生物抑制剂为研究对象,利用AutoDock4.2软件进行了分子对接,分析抑制剂分子和细胞周期素依赖性激酶(CDK2)的结合情况。研究结果显示,活性中心残基Leu83主干上的羰基和氨基分别与抑制剂分子C9原子上的氨基和噻唑环上的N原子形成氢键,Glu81主干上的羰基和抑制剂分子C8上的氨基形成氢键,Phe80侧链上苯基和抑制剂母体分子上的苯基形成了π-π堆积作用,CDK2通过与抑制剂分子之间形成的氢键网络和π-π堆积作用将小分子固定在CDK2的活性中心。Cyclin dependent kinases(CDK2)are a group of serine and threonine protein kinases,which mainly regulate the phosphorylation process of cyclin during the cell cycle and help to solve the disorder of cell cycle regulation.In this paper,2-aminothiazole derivative inhibitors were docked into the active site of CDK2 by using AutoDock4.2 software.The results showed that Leu83,Glu81 and Phe80 played a key role in immobilization of inhibitors in the active centers of CDK2 through forming hydrogen bonding network and π-π accumulation effect with inhibitors.

关 键 词:2-氨基噻唑 抑制剂 AUTODOCK 分子对接 细胞周期素依赖性激酶 

分 类 号:O643[理学—物理化学]

 

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