云南高校图书馆联盟文献共享服务平台- AUTODOCK

AUTODOCK: 作品数：40被引量：133H指数：7; 导出分析报告; 相关领域：医药卫生更多>>; 相关作者：吴智华曾勇张艳孟宪丽黄勇更多>>; 相关机构：成都中医药大学南京邮电大学厦门大学同济大学更多>>; 相关期刊：更多>>; 相关基金：国家自然科学基金福建省高等学校新世纪优秀人才支持计划国家重点实验室开放基金艾滋病和病毒性肝炎等重大传染病防治专项更多>>

基于Autodock软件的槲皮素与诱导性一氧化氮合酶分子对接实验教学: 《化学教育（中英文）》2024年第22期104-109,共6页吴俊勇闫华金燕仙余彬彬陈浩钟爱国; 教育部产学合作协同育人项目(201902072022);浙江省一流课程(浙教办函[2021]195号);台州学院专升本物理化学及实验课程教学改革项目(82023169)。; 主要详细介绍了Autodock软件在分子对接教学中的使用流程,设计了槲皮素与诱导性一氧化氮合酶的分子对接实验,并对对接结果进行分析与研究。学生通过分子对接技术,能够从三维结构可视化掌握药物小分子与蛋白大分子作用的机理,为以后与药...; 关键词：Autodock软件槲皮素分子对接药物设计

烟草甲气味结合蛋白与驱避配体的分子对接被引量：3: 《南京农业大学学报》2023年第4期688-697,共10页常延斌王桂瑶奚家勤杨萌萌郭建华李玉娥梁伟宋纪真; 河南省自然科学基金资助项目(212300410313);吉林烟草工业有限责任公司科技项目(D2019102);广西中烟工业有限责任公司科技项目(122021DG0290)。; [目的]本文旨在利用分子对接技术研究烟草甲气味结合蛋白与驱避配体的分子对接,以研发烟草甲新型驱避剂。[方法]利用AlphaFold2软件预测11个烟草甲气味结合蛋白(LserOBP)的三维结构,并以11个LserOBP为受体和文献报道的对烟草甲具有驱避...; 关键词：烟草甲气味结合蛋白 AlphaFold2 Autodock Vina 分子对接

基于Auto Dock Vina软件的药物化学虚拟仿真实验构建与应用被引量：1: 《广东化工》2023年第16期237-240,共4页李爱杰姚祖福刘建新马洁瑶赵峰蒲洪; 湖南省自然科学基金项目(2022JJ50294);湖南省教育厅科学研究项目(22B1036);湖南省高等学校教学改革研究项目(HNJG-2021-1225,HNJG-2022-1316);湖南医药学院教学改革研究项目(2021JG17,2022JG13)。; 目前药物化学实验偏有机合成技能的培养,忽视了药物化学课程的主要内容。因此我们尝试在药物化学实验课程中构建Oseltamivir carboxylate与神经氨酸酶的分子对接虚拟仿真实验,帮助学生理解药物与靶蛋白的作用方式,提高学习兴趣。本研究...; 关键词：药物化学 AutoDock vina 分子对接 Oseltamivir carboxylate 神经氨酸酶

基于AutoDock Vina筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶有效组分的研究被引量：2: 《蛇志》2023年第2期137-143,共7页陈千姿王晨黄旺香陈曦雅和七一余晓东; 目的基于分子对接方法筛选徐长卿抑制尖吻蝮蛇毒金属蛋白酶的有效组分。方法使用AutoDock Vina软件对徐长卿[Cynanchum paniculatum(Bunge)Kitag]中化合物与尖吻蝮蛇(Deinagkistrodon acutus)蛇毒金属蛋白酶进行分子对接,采用ADMET对较...; 关键词：尖吻蝮蛇蛇毒徐长卿穿心莲内酯 AutoDock Vina 金属蛋白酶

药物设计软件AutoDock概述及其虚拟筛选被引量：1: 《化工管理》2023年第12期89-93,共5页梁柏强; AutoDock是一款开源的分子模拟软件,并可在多平台运行,因此适用性非常广泛。通过对AutoDock软件的用途,结合十款包含商业和学术软件的性能打分评估,以及目前存在的不足,结合Python代码块功能进行可行性优化改进,使可以利用其良好的核心...; 关键词：药物设计 AUTODOCK 虚拟筛选

基于AutoDock vina软件的药物设计学课程教学案例设计——以虚拟筛选细菌RNA聚合酶抑制剂为例被引量：8: 《广东化工》2022年第11期222-224,共3页谭相端吕良; 2020年度广西职业教育教学改革研究项目(GXGZJG2020B163)。; 在药学本科生的药物设计学课程中,以细菌RNA聚合酶抑制剂的虚拟筛选为例,利用AutoDock vina软件对小分子化合物库进行分子对接虚拟筛选,用PyMOL和LigPlot软件进行结果分析。该教学案例的设计可以帮助学生理解基于分子对接的药物虚拟筛...; 关键词：教学改革分子对接 AutoDock vina软件虚拟筛选药物化学

Molecular docking of amphetamine,cathine and cathinone with dihydrofolate reductase:a computational analysis of inhibition of dihydrofolate reductase by khat alkaloids: 《Toxicology Communications》2022年第2期23-28,共6页Siddig Ibrahim Abdelwahab Abdullah Farasani Ahmed Jerah Manal Mohamed Elhassan Taha Anil Bidwai; Interaction of amphetamine,cathine and cathinone with the enzyme dihydrofolate reductase was studied by molecular docking using AutoDock 4.2 as the docking software application.AutoDock 4.2 software serves as a valid ...; 关键词：AMPHETAMINE cathine CATHINONE methotrexate docking AUTODOCK DHFR khat alkaloids

An Investigation of Molecular Targeting of MMP-9 for Endometriosis Using Algal Bioactive Molecules: 《Phyton-International Journal of Experimental Botany》2022年第3期569-582,共14页Farnaz Nabiya Anchana Devi Chenniappan Rajamiriyam Marichamy MubarakAli Davoodbasha Jung-Wan Kim; Endometriosis is a chronic inflammatory disease that occurs due to the presence of endometrial tissue outside the uterine cavity.It affects from 5%to 10%of women of reproductive age.High levels of matrix metalloprotei...; 关键词：ENDOMETRIOSIS matrix metalloproteinase ANTI-INFLAMMATORY PubChem AutoDock 4.2.6 LigPlot v.2.2 eckol

基于分子对接研究小分子对冰核蛋白的微观抑制机理被引量：1: 《华东理工大学学报（自然科学版）》2022年第1期1-7,共7页胡响响丁雅丽冯玄张然石彤非卫来; 国家自然科学基金(21674114)。; 使用分子模拟软件AutoDock研究了甘油和三聚甘油分子与北方假单胞菌的冰核蛋白(PbINP)模型之间的相互作用,以期阐释聚甘油对冰核细菌丁香假单胞菌冰核蛋白(INP)冰成核抑制行为的分子机理,以及该机理是否在INP类结构中具有普适性。模拟...; 关键词：冰核蛋白分子建模 AUTODOCK 聚甘油北方假单胞菌

基于分子对接研究甜菊醇、异甜菊醇对赤霉素受体GID1的作用机制: 《中州大学学报》2021年第6期117-121,共5页张军王杭于宁康张珂韩文龙; 河南省高等学校重点科研项目计划(20B550009);郑州工程技术学院高层次人才项目(22077)。; 开发安全的类赤霉素分子,用分子对接的方法分析甜菊醇、异甜菊醇与赤霉素受体GID1作用分子机制,阐明其结合自由能和相互作用关系,为进一步开发利用提供理论依据。通过检索文献确定赤霉素受体为GID1蛋白,以GA_(3)为对照物,利用AutoDock v...; 关键词：赤霉素GA_(3) 甜菊醇异甜菊醇 GID1蛋白 AutoDock vina

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