健康和患病克氏原螯虾肠道微生物群落结构和多样性分析  

Characterizing the Composition and Biodiversity of Intestinal Microbiota between Healthy and Sick Procambarus clarkii

作　　者：张立强 李媛[3] 邓平 魏朝辉 丁桂珍[1,2] 罗杨志 喻运珍[1,2] 艾桃山 Zhang Li-qiang;Li Yuan;Deng Ping

机构地区：[1]武汉市农业科学院水产科学研究所,湖北武汉430223 [2]武汉中博水产生物技术有限公司,湖北武汉430223 [3]武汉市环境检测中心,湖北武汉430023

出　　处：《水产科技情报》2020年第1期37-40,共4页Fisheries Science & Technology Information

基　　金：国家特色淡水鱼产业技术体系(CARS—46)

摘　　要：为探索健康克氏原螯虾(Procambarus clarkii)与患病克氏原螯虾在肠道微生物菌群结构和多样性方面的差异,采集健康虾(对照组)和患病虾(患病组)样品,通过Illumina高通量测序技术测定样品虾的肠道微生物组成,并利用Simpson指数评估样品中微生物的多样性。结果显示:所有样品共检出400个种水平上的OTUs(operational taxonomic units),归属于25个门(phylum);对照组肠道微生物的优势菌为厚壁菌门(Firmicutes),而患病组的优势菌为变形菌门(Proteobacteria)。进一步分析表明,患病组变形菌门的占比显著高于对照组,Simpson指数提示,患病组的生物多样性较对照组显著下降(P<0.05)。结果表明,患病克氏原螯虾肠道微生物中变形菌门的占比显著上升,生物多样性显著下降(P<0.05)。

关 键 词：克氏原螯虾 肠道微生物 优势菌 生物多样性 变形菌门 

分 类 号：S945.4[农业科学—水产养殖]