一株罗非鱼无乳链球菌Streptococcus agalactiae CS2108的全基因组测序及功能分析  

Whole-genome sequencing and functional analysis of a tilapia strain of Streptococcus agalactiae CS2108

作　　者：施金谷 马振花 王志强 韩书煜 罗福广 文衍红 易弋[2] 苏在权 佀再勇 SHI Jingu;MA Zhenhua;WANG Zhiqiang;HAN Shuyu;LUO Fuguang;WEN Yanhong;YI Yi;SU Zaiquan;SI Zaiyong

机构地区：[1]广西壮族自治区水产技术推广站,广西南宁530199 [2]广西科技大学生物与化学工程学院,广西柳州545006 [3]柳州市渔业技术推广站,广西柳州545006

出　　处：《南方农业》2024年第5期1-7,F0003,共8页South China Agriculture

基　　金：柳州市科学技术局科技攻关与新产品试制项目“基于养殖水体中痕量无乳链球菌检测策略的罗非鱼链球菌病防治新技术研究”(2020NACB0802);广西壮族自治区农业农村厅广西农业科技自筹经费项目“淡水鱼病害诊治APP推广应用”(Z2022168);广西壮族自治区农业农村厅广西农业科技自筹经费项目“稻虾螺共生稻田生态养殖新模式创建与示范”(Z2022171)。

摘　　要：无乳链球菌是罗非鱼的主要病原菌,给水产养殖业带来严重的经济损失。实验室前期从罗非鱼肝脏组织中分离到1株罗非鱼无乳链球菌,命名为Sreptococcus agalactiae CS2108。深入研究罗非鱼无乳链球菌S.agalactiae CS2108的致病机制,为有效防治无乳链球菌病提供理论支撑。采用Illumina Hiseq+PacBio的测序方法获得S.agalactiae CS2108基因组完成图,进一步对测序数据进行基因组组装、预测与功能注释,并在相应数据库预测毒力因子和耐药基因。S.agalactiae CS2108基因组包含1条染色体和1个质粒,染色体大小为2189951 bp,质粒大小为4440 bp;序列已提交至GenBank数据库,登录号分别为CP123969、CP123970;含有8个基因组岛,2个前噬菌体和6个CRISPR-Cas序列;得到248个毒力因子和141个耐药基因。报道这株罗非鱼无乳链球菌的全基因组序列,分析其基因功能,为后续罗非鱼无乳链球病的防治提供理论基础。

关 键 词：罗非鱼 无乳链球菌 全基因组测序 基因组功能 

分 类 号：Q789[生物学—分子生物学]