北京黑猪与杜洛克猪肌内脂肪沉积相关基因的筛选  

作　　者：白云华 王立贤[2] 陈华林 麻柱[1] 杨超[1] 路永强 王楚端[4] 黄全奎 邢凯[4] 王朝军 薛振华 

机构地区：[1]北京奶牛中心,北京100101 [2]中国农业科学院北京畜牧兽医研究所,北京100193 [3]北京市畜牧总站,北京100101 [4]中国农业大学动物科学技术学院,北京100193 [5]广西里建桂宁种猪有限公司,广西南宁530105 [6]北京中育种猪有限责任公司,北京100194

出　　处：《中国畜牧杂志》2024年第9期118-124,共7页Chinese Journal of Animal Science

基　　金：科技创新2030重大项目(2023ZD04046)。

摘　　要：本研究旨在鉴定北京黑猪与杜洛克猪背最长肌(LDM)组织中的差异表达基因(DEGs),筛选影响猪肌内脂肪(Intramuscular Fat,IMF)沉积的关键基因及通路。研究选取北京黑猪和杜洛克猪各6头,采集其背最长肌组织,提取RNA并进行转录组测序。将测序数据进行比对、定量后,利用DESeq2筛选差异表达基因(|log2FC|≥1,P<0.05)并进行GO分析和KEGG分析。结果表明:2个品种猪背最长肌组织中共检测到206个差异表达基因,其中,100个基因在北京黑猪肌肉组织中高表达,106个基因在杜洛克猪肌肉组织中高表达。差异表达基因显著富集在24条通路,其中AMPK信号通路、PPAR信号通路、Wnt信号通路、不饱和脂肪酸的生物合成、脂质和动脉粥样硬化和脂肪酸代谢等通路参与了脂肪生成和代谢的过程。经进一步分析,ELOVL6、FASN、SCD、SQLE和NR4A1等基因在肌内脂肪生成的过程中发挥关键作用。该研究结果为猪肌内脂肪沉积的分子调控机制提供了参考。

关 键 词：北京黑猪 杜洛克猪 背最长肌 肌内脂肪 转录组 

分 类 号：S828.2[农业科学—畜牧学]