基于傅里叶功率谱的H1N1病毒血凝素蛋白质序列的比较分析  

Comparison and Analysis of H1N1 Hemagglutinin Protein Sequences Based on Fourier Power Spectrum

作　　者：王华[1] 白凤兰[1] 刘立伟[1] 

机构地区：[1]大连交通大学理学院,辽宁大连

出　　处：《计算生物学》2018年第1期15-23,共9页Hans Journal of Computational Biology

基　　金：辽宁省教育厅科学研究一般项目(No.L2015093).

摘　　要：基于经典的HP模型,将不同特征下的H1N1病毒血凝素蛋白质序列转换为数字序列并且用离散傅里叶变换求出相应序列的功率谱。根据这些功率谱建立数学矩函数,并将数字序列转换为多维的矩向量,得到蛋白质序列对应的特征向量。再利用特征向量之间的中间距离对蛋白质序列进行聚类比较分析,得到了较好的结果。这一方法将不同长度的蛋白质序列通过功率谱和力矩将其转化为相同维数的向量,使我们更加容易比较分析生物序列。

关 键 词：蛋白质序列 傅里叶变换 功率谱 聚类 

分 类 号：Q5[生物学—生物化学]