安徽省优秀青年科技基金(06042088)

作品数:21被引量:79H指数:6
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全错位排列问题的一种改进的表面DNA计算模型被引量:1
《生物数学学报》2012年第2期297-301,共5页孙侠 殷志祥 许进 
国家自然科学基金(60873144;61170172;61073102;60973050);安徽省优秀青年基金(06042088);安徽省教育厅自然科学基金项目(KJ2009B071Z;KJ2009B174Z);安徽省高等学校省级优秀青年人才基金(2009SQRZ059;2011SQRL035)资助
文章提出全错位排列问题的一种改进的表面计算模型,通过巧妙的编码,不但继承了表面计算的诸多优点,而且摆脱了以往模型难以推广的不足.同时,设计中采用了荧光淬灭的有关技术,利用观察荧光淬灭来确定问题的非解,这种读解方法简单有效,算...
关键词:表面DNA计算 全错位排列问题 荧光淬灭 
基于三链DNA结构的全错位排列问题算法被引量:4
《滁州学院学报》2012年第2期18-20,共3页孙侠 殷志祥 赵前进 许峰 
国家自然科学基金(60873144;61170172;61073102;60973050);安徽省优秀青年基金(06042088);安徽省教育厅自然科学基金项目(KJ2009B071Z;KJ2009B174Z);安徽省高等学校省级优秀青年人才基金(2009SQRZ059;2011SQRL035)
目前,一种新型的DNA计算模型——三链DNA计算模式正越来越受到人们的关注。已经证实,DNA单链能在RecA蛋白的介导下与同源的双链DNA匹配成稳定的三链DNA结构,利用此三链核酸提取目的DNA序列是完全可行的。文章提出了全错位排列问题的基...
关键词:三链DNA结构 抗原中介 全错位排列问题 
全错位排列问题的基于芯片的DNA计算模型被引量:10
《大学数学》2010年第5期79-82,共4页孙侠 殷志祥 李勇 许峰 
国家自然科学基金(30570431);安徽省优秀青年基金(06042088);安徽省教育厅自然科学基金项目(2006kj068A;KJ2007B173;KJ2009B071Z;KJ2009B174Z);安徽省优秀人才基金;教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-06-0555);国家863高技术研究发展计划项目基金(2006AA01Z104);安徽理工大学青年科学研究基金(QN200836)
全错位排列问题作为组合数学中一个重要的问题,到目前为止还没有好的算法.应用DNA芯片技术,提出了全错位排列问题的基于芯片的DNA计算模型,并对模型进行了简要分析.
关键词:DNA芯片 DNA计算 全错位排列问题 
全错位排列问题的基于表面的DNA计算模型被引量:10
《生物数学学报》2009年第3期513-517,共5页孙侠 殷志祥 张家秀 
国家自然科学基金(30570431);安徽省优秀青年基金(06042088);安徽省教育厅自然科学基金项目(2006KJ068A;KJ2007B173;KJ2009B071Z;KJ2009B174Z);安徽省高等学校省级优秀青年人才基金(2009QRZ059);安徽省优秀人才基金;教育部新世纪优秀人才支持计划(NCET-06-0555);国家863高技术研究发展计划项目基金(2006AA01Z104)资助
生物表面技术是DNA计算的一种实现方式,是近年来生命科学的新兴研究领域。而全错位排列问题作为组合数学中一个重要的问题,到目前为止还没有好的算法。在DNA表面技术的基础上,首次提出了全错位排列问题的基于表面的DNA计算模型,并对模...
关键词:表面计算 DNA计算 全错位排列问题 
支持向量机的蛋白质远程同源检测方法分析
《安徽理工大学学报(自然科学版)》2009年第3期64-68,共5页杨静 殷志祥 崔健中 
国家自然科学基金资助项目(60274026;30570431;60873144);安徽省优秀青年基金资助项目(06042088);安徽省教育厅自然科学重点资助项目(2006kj068A);安徽省人才基金资助项目
支持向量机是目前蛋白质远程同源检测应用最成功的方法。在介绍这些基于支持向量机核方法的原理之后,比较这些检测方法的不同之处;再从复杂性角度对比分析不同方法的计算效率;最后指出核方法中核函数的选取也决定支持向量机的分类能力。
关键词:蛋白质远程同源检测 支持向量机 核函数 
与非门(NAND)的DNA计算模型被引量:2
《生物数学学报》2008年第2期357-363,共7页刘文斌 
国家自然科学基金(60403002);中国博士后科学基金(2004036130);浙江省自然科学基金(Y106654;Y405553);安徽省优秀青年基金(06042088)
近年来,随着DNA计算研究的深入,基于DNA的布尔电路的模拟成为其中一个热门的研究方向.分子信标是一种特殊的探针分子,广泛应用于各种生物技术的检测方面,具有结果稳定,特异性强的优点,本文提出了一种基于诱导"发夹"形式的DNA与非门模型...
关键词:DNA计算 发夹结构 逻辑与非门 
基于模拟退火算法的可逃逸粒子群算法被引量:6
《计算机应用研究》2008年第5期1326-1327,1339,共3页王伟 殷志祥 
国家自然科学基金资助项目(60274026,30570431);安徽省优秀青年基金资助项目(06042088);安徽省教育厅自然科学重点资助项目(2006kj068A);安徽省优秀人才基金资助项目;中国博士后科学基金资助项目(2004035196);新世纪人才支持计划资助项目
通过引入模拟退火算法来保证PSO的全局收敛性,在群体最优信息陷入停滞时引入位置逃逸机制保持前期搜索速度快的特性。仿真结果表明本算法不但具有好的全局收敛性,而且有好的收敛速度。
关键词:微粒群优化 模拟退火算法 逃逸位置 
基于抗原中介三链DNA结构的0-1整数规划被引量:11
《计算机工程与应用》2008年第2期76-79,共4页杨静 殷志祥 
国家自然科学基金( the National Natural Science Foundation of China under Grant No.30570431);国家高技术研究发展计划( 863)( the National High-Tech Research and Development Plan of China under Grant No.2006AA01Z104);国家教育部新世纪人才支持计划( the New Century Excellent Talent Foundation from MOE of China under Grant No.NCET- 06- 555);安徽省优秀青年基金( No.06042088);安徽省教育厅自然科学( No.2006kj068A; No.KJ2007B173);安徽省人才基金资助。
利用同源的存在抗原蛋白质的脱氧核苷酸定位于双链DNA中很容易形成三螺旋结构的DNA链,可以利用这种独特的结构来研究一些可能的或可行的的计算模型。尝试了用三螺旋结构的DNA链来解决简单的0-1整数规划问题。而对于整数规划和可满足问...
关键词:三链DNA 0-1整数规划 DNA计算 
基于粘贴系统的有向哈密顿路问题分析
《计算机工程与应用》2007年第26期76-78,共3页王伟 殷志祥 
国家自然科学基金( the National Natural Science Foundation of China under Grant No60274026; No30570431) ;安徽省优秀青年基金( No06042088) ;安徽省教育厅自然科学重点项目( No2006kj068A) ;安徽省优秀人才基金;中国博士后科学基金( No2004035196) ;新纪人才支持计划资助
通过构造粘贴模型模拟解决有向哈密顿路问题,然后用此粘贴系统所产生语言的性质对有向哈密顿路问题进行分析,继而给出了有向哈密顿路的充要条件。对于规模为n有向哈密顿路问题,构造的粘贴系统至多运行n-1步。
关键词:DNA计算 粘贴模型 有向哈密顿路问题 
基于颜色Petri网和Lookahead的数据分发管理研究
《计算机工程与应用》2007年第24期97-99,215,共4页方贤文 许志才 殷志祥 
国家自然科学基金(the National Natural Science Foundation of China under Grant No.30570431);安徽省教育厅青年教师基金资助项目(No.2006jq1077);安徽省优秀青年基金(No.06042088)
对高层体系结构(HLA)中数据分发管理(DDM)的研究,主要目标是在符合HLA标准的前提下,提高数据的过滤效率,同时减少计算量,并提供较好的可扩展性适应于各种规模的分布式仿真应用。Lookahead是分布式模拟时间管理协议中的一个重要概念,各...
关键词:颜色Petri网Lookahead数据分发管理高层体系结构 
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