国家自然科学基金(30600329)

作品数:5被引量:12H指数:2
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相关机构:重庆邮电大学重庆邮电学院中国科学院陕西警官职业学院更多>>
相关期刊:《中国生物化学与分子生物学报》《毒理学杂志》《计算机工程》《价值工程》更多>>
相关主题:MOTIF转录因子结合位点遍历算法遍历DNA计算机更多>>
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一种基于贪心EM的改进预测算法
《价值工程》2011年第17期141-142,共2页张斐 
国家自然科学基金资助项目(30600329)
本文主要研究了Motif预测算法,在贪心EM预测算法基础上进行分析优化,并形成新的预测方法。工作重点是在参数的初始化,对参数模型的重新划分并引入Kd-树的层次聚类的方法,建立新的PKG算法。预测结果表明,在预测较大数据集方面新算法有一...
关键词:Motif预测 贪心EM算法 PKG算法 
基于不同算法的Motif预测比较分析与优化被引量:6
《计算机工程》2009年第22期94-96,99,共4页张斐 谭军 谢竞博 
国家自然科学基金资助项目(30600329)
研究转录因子结合位点(TFBs)的主要预测模型及其预测的算法,通过基于调控元件预测的3种代表性的算法MEME、Gibbs采样和Weeder预测拟南芥基因组。比较结果表明,Gibbs采样算法和Weeder算法预测长、短motif效率较高。重点分析MEME算法,提...
关键词:转录因子结合位点 motif预测 算法比较 
DNA计算机中图的深度优先搜索遍历算法被引量:5
《计算机工程》2008年第15期234-235,258,共3页魏国辉 杨春德 谭军 
国家自然科学基金资助项目(30600329)
提出DNA计算机中图数据结构的一种设计方法,给出具体的存储结构以及深度优先搜索遍历的算法。该算法实现了在DNA计算机下图元素的遍历。为证明其可行性,给出一个具体的算法实例,描述了DNA计算机上的运行机制。依据分子生物学的理论,证...
关键词:DNA计算机  深度优先搜索 遍历 
反向重复序列法构建神经病靶标酯酶RNA干涉表达质粒
《毒理学杂志》2007年第1期4-8,共5页常平安 伍一军 
国家自然科学基金资助项目(30600329);重庆市自然科学基金资助项目(CSTC2005BB5072)
目的构建基于通用真核表达载体的人神经病靶标酯酶双链RNA的稳定表达载体。方法在正义和反义引物两端分别加上EcoRⅠ和BamHⅠ的识别位点扩增得到神经病靶标酯酶活力域序列,构建含有目标基因的倒置重复序列的双链RNA表达载体pcDNA.NTE.ds...
关键词:神经病靶标酯酶 RNA干涉 表达载体 反向重复序列 
卵磷脂与细胞周期被引量:1
《中国生物化学与分子生物学报》2006年第12期947-952,共6页常平安 秦文珍 魏进民 
国家自然科学基金项目(No.30600329);重庆市自然科学基金项目(No.CSTC2005BB5072)资助~~
卵磷脂作为哺乳动物细胞膜结构组成的重要成分,在细胞增殖过程中表现出周期性的变化.卵磷脂生物合成和分解代谢中关键酶的共同作用调节卵磷脂的变化规律,尤其是CTP:磷酸胆碱胞苷转移酶和非钙依赖的磷脂酶A2在其中起着非常重要的调节作用...
关键词:卵磷脂 细胞周期 CTP-磷酸胆碱胞苷转移酶 非钙依赖的磷脂酶A2 神经病靶标酯酶 
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