北京林业大学生物科学与技术学院计算生物学中心

作品数:17被引量:12H指数:2
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发文领域:生物学农业科学更多>>
发文主题:转录因子QTL幼苗生长生物学功能愈伤组织更多>>
发文期刊:《北京林业大学学报》《中国生物工程杂志》《分子植物育种》《植物生理学报》更多>>
所获基金:国家自然科学基金国家级大学生创新创业训练计划中国博士后科学基金国家林业公益性行业科研专项更多>>
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盐胁迫下胡杨根系发育与遗传调控
《北京林业大学学报》2025年第1期72-84,共13页张波 卢凯燕 张晓宇 邬荣领 
国家自然科学基金项目(32070601)。
【目的】探究胡杨主根分别在正常和盐胁迫条件下的生长适应性模式,有效定位影响胡杨根系表型性状的显著数量性状座位(QTL),将遗传调控网络可视化,进一步探究胡杨根系表型性状在盐胁迫下的遗传调控机制。【方法】基于胡杨在正常和盐胁迫...
关键词:胡杨 盐胁迫 功能作图 遗传效应 遗传网络 数量性状基因座位 主根性状 
利用系统作图解析藏川杨邻株互作遗传调控机理
《北京林业大学学报》2024年第10期63-73,共11页丁孟东 危学达 王玉 祝绪礼 
北京林业大学科技创新计划新教工启动项目(BLX201912)。
【目的】植株之间的互作对生态系统的形成具有重要意义,本研究在邻株互作这一最小的种内互作单元水平上,研究植物间相互作用的遗传调控机制。【方法】以不同系号的藏川杨自然群体作为研究材料,两两随机配对扦插于花盆中,调查其生长季的...
关键词:系统作图 邻株互作 调控网络 QTL 藏川杨 
KNOX2转录因子研究进展
《植物生理学报》2024年第9期1367-1374,共8页王聪 侯思佳 张倩倩 陈静 杜俊红 梁丹 邬荣领 郭允倩 
国家自然科学基金(31370669)。
KNOX (KNOTTED1-like homeobox)是植物中一类具有重要功能的转录因子,属于同源异形盒基因超家族中TALE (three amino-acid loop extension)的亚族。研究表明该家族成员广泛参与植物生长发育和形态建成。本文主要对KNOX2基因的结构、分...
关键词:KNOX2 次生细胞壁 珠被 结瘤 
功能作图的混合效应模型开发
《北京林业大学学报》2024年第5期163-172,共10页王子健 叶梅霞 张涵 邬荣领 
国家自然科学基金项目(32071796)。
【目的】以大肠杆菌菌株丰度和功能作图模型为研究基础,通过在功能作图模型中引入群体的固定效应和个体间亲缘关系造成的随机效应,探究混合效应对功能作图模型性能的影响。【方法】本研究在功能定位框架基础上,使用大肠杆菌动态培养的...
关键词:功能作图 关联分析 混合效应 限制性最大似然估计 数量性状位点 
拟南芥株高性状全基因组上位互作网络构建
《北京林业大学学报》2023年第9期21-32,共12页杨镇宇 祝绪礼 曹译戈 任翔宇 邬荣领 
国家自然科学基金项目(32071796);中国博士后科学基金面上项目(2019M660496)。
【目的】以拟南芥株高性状及上位性网络模型为研究基础,通过构建不同层次的互作调控网络,探究、揭示植物生长发育过程中多基因在复杂网络中相互作用的过程或规律。【方法】以拟南芥的84个重组自交系为实验材料,共获得417 495个单核苷酸...
关键词:复杂性状 遗传方差 统计模型 基因上位性网络 拟南芥 
木本植物中microRNA的研究进展被引量:2
《植物生理学报》2023年第5期817-828,共12页陈静 孟剑桥 侯思佳 张倩倩 杜俊红 王聪 梁丹 邬荣领 郭允倩 
国家自然科学基金(31370669);林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学)开放基金(K2013104)。
MicroRNAs(miRNAs)是一类非编码小RNA,长度为20~24 nt,通过降解靶基因的mRNA和抑制翻译过程在转录后水平调控植物的生理过程。miRNAs已被证明在植物的生长发育中起重要调控作用,但在木本植物中的研究较少。本文将对非编码RNA的分类、miR...
关键词:MIRNAS 功能 植物生长 木本植物 
胡杨WINDs基因克隆及功能初步分析
《中国生物工程杂志》2022年第10期9-20,共12页侯思佳 陈静 孟剑桥 杜俊红 王聪 梁丹 邬荣领 郭允倩 
国家自然科学基金(31370669)资助项目。
目的:WIND(WOUND INDUCED DEDIFFERENTIATION),是属于ERF/AP2(ETHYLENE RESPONSE FACTOR/APETALA 2)家族的一种重要转录因子,该类基因最早被发现在拟南芥中可以与乙烯响应元件GCC-BOX和脱水响应元件DRE结合,响应干旱信号和调节乙烯水平...
关键词:植物再生 胡杨 PeWIND 伤口响应 
多维功能作图在胡杨幼苗生长QTL的应用
《植物科学学报》2022年第3期365-377,共13页穆帅成 祝绪礼 叶梅霞 邬荣领 
国家自然科学基金(32071796);中国博士后科学基金(2019M660496);北京林业大学科技创新计划(BLX201912)。
功能作图框架能够表征复杂动态性状背后的数量性状位点(Quantitative trait locus,QTL)或核苷酸。此前,功能作图广泛应用于单个性状或两个性状的QTL定位当中,多个相关性状功能作图的研究相对匮乏。本研究通过对SAD(Structured antedepen...
关键词:多维功能作图 数量性状位点 结构前依赖模型 胡杨 关联分析 
WIND转录因子在植物响应伤口胁迫和器官生长发育中的研究进展被引量:1
《中国生物工程杂志》2022年第4期85-92,共8页侯思佳 张倩倩 孙振美 陈静 孟剑桥 梁丹 邬荣领 郭允倩 
国家自然科学基金(31370669)资助项目。
伤口诱导的去分化因子(WOUND INDUCED DEDIFFERENTIATION,WIND)是AP2/ERF家族成员之一。植物AP2/ERF(APETALA2/ETHYLENE RESPONSE FACTOR)是一个庞大的转录因子基因家族,存在于所有的植物中。目前大部分关于WIND转录因子的研究都局限在...
关键词:AP2/ERF基因家族 转录因子 WIND 生物学功能 
CUC转录因子研究进展被引量:1
《植物生理学报》2021年第10期1852-1862,共11页张倩倩 侯思佳 孙振美 陈静 孟剑桥 梁丹 邬荣领 郭允倩 
国家自然科学基金(31370669);林木遗传育种国家重点实验室(东北林业大学)开放基金(K2013104)。
CUC (CUP-SHAPED COTYLEDON)是植物中特有的一类转录因子,属于NAC (NAM/ATAF/CUC)超家族的一个亚族。该家族成员在植物器官边界分离、茎尖分生组织形成、叶片形态和花器官发育中发挥重要作用。本文主要对CUC亚家族基因的起源、进化、结...
关键词:CUC 分子代谢通路 生物学功能 
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