引物开发

作品数：105被引量：568H指数：13
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黄精根状茎转录组SSR特点分析
《山东农业大学学报（自然科学版）》2024年第6期908-913,共6页李春霖 万小林 崔令军 肖强 李双龙 
中央财政林业科技推广示范项目“武陵山区林下经济模式推广示范”(鄂[2022]TG07号);湖北省自然科学基金项目“黄精黄酮合成分子机制解析与优质种质资源创新(2023AFD077)”;湖北省科技厅技术创新重大专项项目(2019ACA120)。
为了解黄精根状茎转录组中简单重复序列SSR的分布特点,充分开发SSR分子标记,本研究对黄精根状茎进行转录组测序,SSR位点分析与引物设计。以获得的61 116条Unigene为试材,采用MISA软件检索出黄精的SSR位点,利用Primer 3软件对检索到的SS...
关键词：黄精 转录组 SSR 序列特征 引物开发 
基于转录组测序的浙江楠EST-SSR分子标记开发
《南方林业科学》2024年第5期8-12,共5页郑永杰 廖枝锋 刘新亮 张月婷 涂白连 伍艳芳 
江西省林业科技创新项目(创新专项[2021]15号);江西省林业科学院青年人才培养项目(2023522701;2023522704)。
浙江楠是我国重要的珍稀濒危植物,开展浙江楠SSR位点分布特征及分子标记开发,可为浙江楠的资源评价和保护利用提供科学依据。研究基于高通量测序技术获得浙江楠转录组数据,利用生物信息学方法分析浙江楠转录组SSR位点,开发浙江楠SSR分...
关键词：浙江楠 SSR重复类型 引物开发 转录组 遗传多样性 
大叶栎SSR引物开发及育种群体指纹图谱构建
《基因组学与应用生物学》2024年第9期1521-1532,共12页周元杰 冯源恒 吴东山 聂海泉 刘海梅 杨章旗 
广西科技基地和人才专项(桂科AD19254004);广西八桂学者专项(2019A026)共同资助。
本研究基于大叶栎(Castanopsis fissa)转录组信息,开发大叶栎SSR分子标记,筛选及验证所开发SSR分子标记的有效性及多态性,对广西梧州大叶栎育种群体进行遗传多样性分析并构建指纹图谱。通过对大叶栎叶片的转录组测序结果进行分析,共挖掘...
关键词：大叶栎 SSR分子标记 遗传多样性 指纹图谱 
青钱柳全基因组SSR位点分析及多态性引物开发
《南京林业大学学报（自然科学版）》2024年第4期67-75,共9页刘莉 瞿印权 余延浩 王倩 洑香香 
国家自然科学基金项目(31971642);中央财政林业科技推广示范项目(皖[2023]TG13号)。
【目的】通过对青钱柳全基因组序列分析,开发基因组SSR分子标记;尝试构建19个青钱柳优良药用无性系的DNA分子身份证,为后续种质资源评价、遗传多样性和种质鉴定提供技术支撑。【方法】利用MISA(microsatellite identification tool)软...
关键词：青钱柳 简单重复序列(SSR) 全基因组 DNA分子身份证 
基于锈斑蟳简化基因组数据的微卫星DNA标记开发
《广西科学》2024年第4期763-772,共10页唐棣 杨明秋 邹雄 刘洪涛 
海南省重点研发项目(ZDYF2021XDNY278);2024年海南省科技条件平台专项(重点实验室)建设项目(ZDSYS202408)资助。
锈斑蟳(Charybdis feriata)是我国重要的海洋水产种质资源保护对象,具有较高的经济价值和遗传育种价值,开发微卫星DNA(Microsatellite DNA)标记有助于锈斑蟳种群生态、种质资源等方面研究。本研究基于简化基因组测序技术获得锈斑蟳简化...
关键词：锈斑蟳 简化基因组 微卫星 引物开发 遗传多样性 
基于白尾海雕粪便样品的SSR引物及性别鉴定引物的开发
《北京师范大学学报（自然科学版）》2024年第2期190-194,共5页袁嘉瞳 牛文会 张轶卓 贾婷 何绍纯 鲍蕾 
国家自然科学基金面上资助项目(32171654)。
白尾海雕(Haliaeetus albicilla),是鹰形目鹰科海雕属的一种大型猛禽、国家一级保护动物,位于食物链顶端,对于维持生态平衡和生物多样性具有重要作用.每年冬季,大批白尾海雕在我国吉林省珲春市敬信湿地越冬,形成了国内最大的越冬种群....
关键词：SSR分子标记 性别鉴定 引物开发 粪便样品 
基于转录组测序的黄枝油杉EST-SSR引物开发
《分子植物育种》2024年第7期2257-2264,共8页石远婷 赖柏玟 王晓洁 秦惠珍 柴胜丰 
广西自然科学基金项目(2018GXNSFAA281015)资助。
黄枝油杉是中国特有的珍稀濒危树种,具有较高的生态、经济和科研价值。本研究基于转录组测序结果对黄枝油杉进行EST-SSR标记开发,使用MISA软件对黄枝油杉132 191条unigenes进行SSR搜索,共获得6 903个SSR位点,出现频率为5.22%,平均12.015...
关键词：黄枝油杉 转录组 遗传多样性 SSR 引物开发 
基于牡丹涝害胁迫的转录组分析及SSR引物开发被引量：1
《浙江农业学报》2024年第3期544-558,共15页刘慧春 许雯婷 周江华 张加强 史小华 朱开元 
浙江省公益技术应用研究项目(LGN22C150015)。
涝害胁迫是限制牡丹种植、生长和高产的最主要的非生物胁迫之一。为了阐明牡丹在涝害胁迫下的作用机制,研究进行了转录组学分析,并开发了SSR标记。利用高通量测序对6个由涝害处理的幼苗和对照的mRNA构建的cDNA文库进行测序。通过组装总...
关键词：牡丹 涝害胁迫 转录组 高通量测序 SSR 
燕麦全基因组SSR位点鉴定及多态性标记开发被引量：1
《生物技术通报》2024年第2期120-129,共10页陈凯凌 武涛 徐逸群 高佳 张美俊 李欣 贾举庆 
杂粮种质资源创新与分子育种国家实验室(筹)自主研发项目(202204010910001-26);山西省回国留学人员科研资助项目(2020-067)。
【目的】了解燕麦基因组SSR位点分布情况并开发燕麦全基因组SSR标记,为燕麦皮裸基因克隆、遗传图谱构建、群体多样性分析等提供科学的参考依据。【方法】利用已公布的“三分三”裸燕麦参考基因组,通过TBtools软件对燕麦全基因组的SSR位...
关键词：燕麦 皮裸 SSR标记 引物开发 多态性 
望春玉兰基因组SSR引物开发与应用初探被引量：1
《林业科学》2023年第10期113-127,共15页徐正康 戴晓港 陈赢男 
国家自然基金(32071795);江苏省高等学校自然科学研究重大项目(21KJA220001)。
【目的】分析望春玉兰基因组微卫星序列和分布特征,开发多态性高和稳定性好的SSR引物,并构建玉兰商业品种指纹图,为玉兰属植物群体遗传结构和遗传多样性研究提供分子标记资源,也为玉兰优良品种的遗传真实性鉴别和育种工作者知识产权保...
关键词：望春玉兰 SSR 引物开发 玉兰商业品种 DNA指纹图 
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