生物合成基因

作品数:281被引量:563H指数:10
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泉州湾红树林根际土壤放线菌的分离鉴定及链霉菌W444次级代谢产物的鉴定
《微生物学报》2025年第2期597-613,共17页张文州 陈琳琳 林水森 林阳君 庄月娥 谢志新 江红 连云阳 骆祝华 彭飞 
泉州市科技计划(2023NS082);泉州医学高等专科学校校级课题重点科技项目(XJK2210A);泉州医学高等专科学校研究型教学项目(XJJK2308);自然资源部第三海洋研究所开放基金(HY202304)。
【目的】从泉州湾2种红树林的根际土壤中分离并鉴定放线菌,进行抗真菌活性初筛以获取目标菌株,并对链霉菌属(Streptomyces)W444的次级代谢产物进行分离与鉴定。【方法】从泉州湾洛阳江采集2种不同红树林植物的根际土壤样品,采用稀释涂...
关键词:泉州湾红树林 放线菌 吲哚类化合物 生物合成基因簇 
一株产灵菌红素黏质沙雷氏菌的分离鉴定及其基因组分析
《微生物学报》2024年第11期4290-4307,共18页张雨欣 王美燕 李殿怡 司军 卞小莹 牛国清 刘蓉 
国家重点研发计划(2020YFA0907700)。
【目的】对甘蓝根际微生物进行分离,从中选择具有优良性状的菌株,对其次级代谢产物合成能力进行评估,为甘蓝根际微生物资源的发掘利用奠定基础。【方法】采集重庆市武隆区仙女山镇仙女山村甘蓝根,分离培养根际微生物菌株,从中选择一株...
关键词:甘蓝 黏质沙雷氏菌 灵菌红素 基因组分析 生物合成基因簇 异源表达 
三烷基取代芳香聚酮gombapyrones生物合成基因簇的确认及其生物合成推导
《微生物学报》2023年第12期4671-4685,共15页杨名 李晚露 张文禹 林厚文 周永军 
国家自然科学基金(32070070)。
【目的】本研究旨在确认链霉菌Streptomyces rubellomurinus ATCC 31215来源芳香聚酮化合物(gombapyrones,GOMs)的生物合成基因簇(biosynthetic gene cluster,BGC),并对其生物合成途径进行推导。【方法】对链霉菌S.rubellomurinus ATCC ...
关键词:天然产物生物合成 芳香聚酮 聚酮合酶 P450单氧化酶 
Nonomuraea candida HMC10^(T)中新结构套索肽noncaromin生物合成基因簇的克隆及异源表达被引量:2
《微生物学报》2022年第12期4927-4942,共16页韩舒婷 马婧贤 盛勇 王珩瑜 邢利 罗晓霞 白林泉 邓子新 康前进 
国家重点研发计划(2021YFC2100600);国家自然科学基金(31770034,31830104);上海市自然科学基金(19ZR1475600)。
【目的】本研究旨在通过定向克隆菌株Nonomuraea candida HMC10^(T)中一个新的Ⅱ型套索肽类生物合成基因簇,通过在放线菌底盘宿主中的异源表达,获得新结构套索肽noncaromin,并完成其抑菌活性分析。【方法】通过anti SMASH软件分析菌株N....
关键词:念珠状野野村氏菌 套索肽 异源表达 结构鉴定 活性检测 
染色体DNA琼脂糖包埋法辅助的ExoCET技术克隆放线菌天然产物生物合成基因簇
《微生物学报》2022年第12期4964-4980,共17页马婧贤 韩舒婷 盛勇 王珩瑜 邢利 罗晓霞 白林泉 康前进 邓子新 欧一新 
国家重点研发计划(2021YFC2100600);国家自然科学基金(31770034,31830104);上海市自然科学基金(19ZR1475600)。
【目的】本研究旨在通过将琼脂糖包埋染色体DNA的方法与ExoCET重组技术相结合,建立放线菌天然产物生物合成基因簇的捕获方法。然后将克隆基因簇导入通用底盘宿主中,实现目标生物合成基因簇的异源表达。【方法】首先,利用低熔点琼脂糖包...
关键词:染色体DNA的琼脂糖包埋方法 ExoCET技术 林可霉素 羊毛硫肽 异源表达 质谱 
茎瘤芥根际一株产紫色杆菌素杜擀氏菌的分离鉴定及其基因组分析被引量:1
《微生物学报》2022年第11期4122-4140,共19页邹莹 吴嘉炳 张雨欣 李殿怡 牛国清 司军 
重庆市技术创新与应用发展专项项目(cstc2021jscx-cylh X0001);西南大学“聚贤工程”启动项目(SWU117015)。
【目的】对茎瘤芥根际微生物进行分离鉴定,分析微生物菌群构成,选择具有优良特性的菌株,评估其次级代谢产物合成能力,为茎瘤芥根际微生物多样性和菌种资源的挖掘利用奠定基础。【方法】采集重庆市涪陵区二渡村和邓家村的茎瘤芥根,分离...
关键词:根际微生物 杜擀氏菌 紫色杆菌素 基因组测序 生物合成基因簇 异源表达 
福林霉素生物合成基因簇的组装和异源表达被引量:3
《微生物学报》2022年第1期291-304,共14页李兴 韩舒婷 马婧贤 陶美凤 康前进 白林泉 邓子新 
国家重点研发计划(2019YFA0905400);国家自然科学基金(31770034,21661140002,31830104);上海市自然科学基金(19ZR1475600)。
【目的】本研究旨在以来源于林可链霉菌NRRL2936中的nosokomycin B_(2)的生物合成基因簇(noso-BGC)为基础,组装获得完整的福林霉素生物合成基因簇(pho-BGC),再利用异源表达策略,激活pho-BGC的表达并通过底盘宿主的优选实现福林霉素发酵...
关键词:林可链霉菌NRRL2936 福林霉素 链霉菌宿主 异源表达 二级质谱分析 
珠江口沉积物来源链霉菌SCSIO 40020中bafilomycins的鉴定及其生物合成基因簇的异源表达
《微生物学报》2021年第12期3991-4005,共15页翟诗岚 刘威 吴正超 朱义广 张文军 张长生 马亮 
广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515010839);广州市科技计划(202102020513);国家自然科学基金(21907098,41706181);国家重点研发计划(2019YFC0312503);王宽诚教育基金(GJTD-2020-12)。
【目的】从珠江口沉积物来源的菌株SCSIO 40020中分离bafilomycins,并对其生物合成基因簇进行克隆和异源表达研究。【方法】通过分析菌株SCSIO 40020的16S rRNA基因序列并构建系统发育树以鉴定菌种,以柱层析法和制备色谱法对次级代谢产...
关键词:链霉菌 bafilomycins 生物合成基因簇 异源表达 
珊瑚来源真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11中聚酮化合物的发现及其生物合成途径分析被引量:1
《微生物学报》2021年第11期3631-3641,共11页周晓雪 杨佳凡 李明哲 宋永相 鞠建华 李晓帆 王立岩 
深圳市科技计划(JCY20180305123659726)。
海洋来源真菌的天然产物因其独特的结构与生物学活性而备受关注,而利用基因组信息对其代谢产物进行深入挖掘也成为研究策略之一。【目的】本文以一株南海珊瑚来源的真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11为目标菌株,挖掘其生产聚酮类...
关键词:Parengyodontium album SCSIO SX7W11 sydowinin A 生物合成基因簇 基因组 海洋真菌 
萘醌-氧吲哚生物碱coprisidins生物合成途径的研究
《微生物学报》2021年第5期1184-1199,共16页林飞燕 段颖异 江晶洁 黄婷婷 林双君 邓子新 
国家重点研发计划(2018YFA0901903);国家自然科学基金(21632007,31900043);上海交通大学“新进青年教师启动计划”。
【目的】新颖结构的天然萘醌-氧吲哚类生物碱coprisidins(A和B)分离自昆虫肠道相关链霉菌,具有预防癌症的活性。作为首例具有萘醌-氧吲哚骨架的生物碱,对其独特生物合成机理的研究可为II型聚酮类化合物生物合成途径提供新的认知。【方...
关键词:coprisidins 萘醌-氧吲哚类生物碱 芳香聚酮 生物合成基因簇 合成生物学 
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