生物合成基因簇

作品数:182被引量:366H指数:9
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早期描述物种的模式标定及基因组解析:以中国第一个被描述的真菌新种五棱散尾鬼笔为例
《菌物学报》2025年第4期14-28,共15页梁俊敏 王科 杜卓 赵明君 蔡磊 戴玉成 
中华人民共和国科学技术部基础资源调查专项(2021FY100900)。
五棱散尾鬼笔Lysurus mokusin(L.f.)Fr.,又名中华散尾鬼笔,于1774年由法国传教士西博特(Cibot PM)描述与发表,是首个被科学描述的中国真菌新物种,为稳定该名称的准确使用,本研究依照现用命名法规对该物种开展了模式标定和分类学研究,指...
关键词:附加模式 DNA条形码 HiFi测序 双速基因组 生物合成基因簇 
红树林来源链霉菌中2-羟基苯基噻唑啉衍生物及其生物合成基因簇分析
《热带海洋学报》2025年第2期64-72,共9页刘思妮 白猛 朱义广 罗小卫 高程海 刘永宏 徐新亚 蒋晓东 
广西科技基地和人才专项(桂科AD22035167);广西自然科学基金项目(2023GXNSFBA026139、2023GXNSFAA026313);广东省海洋药物重点实验室开放基金课题项目(LMM2022-4);广西中医药大学博士科研启动基金项目(2021BS022);广西中医药大学《桂派中医药传承创新团队》项目(2022A007);广西中医药大学第三批“岐黄工程”高层次人才团队培育项目(202407);广西八桂学者专项基金项目(05019055)。
文章探讨和分析了海南红树林沉积物来源链霉菌Streptomyces ardesiacus GXIMD 03502的次级代谢产物及相应生物合成基因簇。通过比对16S rDNA序列信息对菌株进行初步鉴定。综合运用多种色谱分离技术分离其次级代谢产物,结合波谱数据分析...
关键词:红树林放线菌 链霉菌 2-羟基苯基噻唑啉 生物合成基因簇 
泉州湾红树林根际土壤放线菌的分离鉴定及链霉菌W444次级代谢产物的鉴定
《微生物学报》2025年第2期597-613,共17页张文州 陈琳琳 林水森 林阳君 庄月娥 谢志新 江红 连云阳 骆祝华 彭飞 
泉州市科技计划(2023NS082);泉州医学高等专科学校校级课题重点科技项目(XJK2210A);泉州医学高等专科学校研究型教学项目(XJJK2308);自然资源部第三海洋研究所开放基金(HY202304)。
【目的】从泉州湾2种红树林的根际土壤中分离并鉴定放线菌,进行抗真菌活性初筛以获取目标菌株,并对链霉菌属(Streptomyces)W444的次级代谢产物进行分离与鉴定。【方法】从泉州湾洛阳江采集2种不同红树林植物的根际土壤样品,采用稀释涂...
关键词:泉州湾红树林 放线菌 吲哚类化合物 生物合成基因簇 
一株产灵菌红素黏质沙雷氏菌的分离鉴定及其基因组分析
《微生物学报》2024年第11期4290-4307,共18页张雨欣 王美燕 李殿怡 司军 卞小莹 牛国清 刘蓉 
国家重点研发计划(2020YFA0907700)。
【目的】对甘蓝根际微生物进行分离,从中选择具有优良性状的菌株,对其次级代谢产物合成能力进行评估,为甘蓝根际微生物资源的发掘利用奠定基础。【方法】采集重庆市武隆区仙女山镇仙女山村甘蓝根,分离培养根际微生物菌株,从中选择一株...
关键词:甘蓝 黏质沙雷氏菌 灵菌红素 基因组分析 生物合成基因簇 异源表达 
喷他霉素新生产菌的发现及产量提高被引量:1
《微生物学通报》2024年第8期2888-2904,共17页孙佳宁 王海燕 范可强 何信 廖振翔 王立艳 黄英 任晋玮 孟大利 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32270081)。
【背景】喷他霉素(pentamycin)是一种多烯大环内酯类抗生素,对白色念珠菌(Candida albicans)、阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)和其他几种病原菌有显著的抑制活性,在瑞士已被注册用于治疗阴道念珠菌病、滴虫病和混合感染。【目的】...
关键词:次级代谢产物 喷他霉素 生物合成基因簇 基因工程改造 
环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2全基因组测序及序列分析被引量:1
《微生物学通报》2024年第8期3085-3102,共18页阮文伟 付建红 崔凤真 铁瑞岚 徐国燕 阿依卡买尔·艾克拜尔 
国家自然科学基金(32260226);新疆维吾尔自治区“天山”创新团队计划(2022D14004);新疆维吾尔自治区自然科学基金(2021D01A122)。
【背景】环圈链霉菌(Streptomyces anulatus)89-2-2是一株中度嗜盐放线菌,其次级代谢产物具有抑制蘑菇酪氨酸酶活性、抑制小鼠黑色素瘤B16细胞内酪氨酸酶活性及黑色素合成的作用。目前S.anulatus 89-2-2基因组序列分析尚未见报道,这限...
关键词:中度嗜盐链霉菌 酪氨酸酶抑制剂 全基因组测序 生物合成基因簇 
糖丝菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立被引量:1
《微生物学通报》2024年第7期2614-2629,共16页李栋 范可强 胡会涛 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32070067)。
【背景】稀有放线菌是发掘天然产物的“新矿藏”。糖丝菌(Saccharothrix)作为典型的稀有放线菌,其天然产物生产潜能尚需进行系统分析和发掘。此外,针对糖丝菌的基因编辑体系也鲜有报道。【目的】揭示糖丝菌属稀有放线菌合成不同结构类...
关键词:糖丝菌 次级代谢 天然产物 生物合成基因簇 基因编辑 
链霉菌次级代谢产物生物合成的调控研究进展
《中草药》2024年第14期4917-4929,共13页孟俊华 张少航 鲁曼霞 厉晓 龚婕 王炜 崔培梧 
国家自然科学基金资助项目(81973211/C0033375);湖南中医药大学研究生创新课题(校行研字[2022]20号-87);湖南中医药大学“十四五”重点学科-生物工程学科(校行发规字[2023]2号)。
链霉菌属微生物是生产抗生素的优势菌群,也是一些维生素和酶的重要来源,具有广阔的开发前景;然而,链霉菌代谢网络和调控机制的复杂性,及大量基因簇的沉默限制了其次级代谢产物的高效合成。快速发展的代谢工程技术为人为干预、调控链霉...
关键词:链霉菌 次级代谢产物 代谢调控 生物合成基因簇 非靶向调控 靶向调控 
拟无枝酸菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立被引量:1
《微生物学通报》2024年第5期1713-1731,共19页杨英哲 范可强 王海燕 向丽军 张书平 赵燕 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32270080)。
【背景】拟无枝酸菌属作为一类重要的稀有放线菌,是抗菌、抗癌类药物的重要来源,其合成天然产物的潜能尚待系统分析及发掘。【目的】揭示拟无枝酸菌属不同结构类型次级代谢产物合成潜能,并建立两个代表性菌株的遗传操作体系,为结构新颖...
关键词:拟无枝酸菌属 次级代谢 天然产物 生物合成基因簇 基因编辑 
玉米大斑病菌铁载体合成基因簇鉴定及表达分析被引量:1
《农业生物技术学报》2024年第5期1121-1131,共11页岳浩峰 赵天益 李海笑 闫秋静 徐雅迪 孟亚南 曹志艳 刘宁 董金皋 
国家现代农业产业技术体系(CARS-02);国家自然科学基金(32072370;31901827);河北省自然科学基金(C2020204183);中央引导地方科技发展资金(226Z6502G)。
铁是微生物生长必需的元素,在氧代谢、电子转移以及DNA和RNA合成等过程中发挥重要作用,微生物主要依赖于铁载体吸收环境中的铁离子。铁载体作为微生物分泌的低分子量铁螯合物,协助机体运输铁离子。真菌主要利用非核糖体多肽合成酶编码...
关键词:玉米大斑病菌 铁载体 次级代谢产物生物合成基因簇 基因表达 
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