基因组分析

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黄河高原鳅血红蛋白基因家族全基因组分析及低氧胁迫响应
《水生生物学报》2025年第5期62-72,共11页谭瑾 郭守全 刘丹 张存芳 聂苗苗 寇若彬 姚占雯 田菲 祁得林 
国家自然科学基金(32371578和31960127)资助。
为探究血红蛋白基因家族在黄河高原鳅(Triplophysa pappenheimi)低氧适应中的作用,研究基于黄河高原鳅基因组数据对血红蛋白基因家族进行了生物信息学分析,并开展低氧胁迫和基因表达检测。结果显示,黄河高原鳅血红蛋白基因家族由11个成...
关键词:血红蛋白基因家族 全基因组分析 低氧胁迫 黄河高原鳅 
中华蜜蜂肠道菌Gilliamella sp.G0441分离、鉴定及基因组分析
《环境昆虫学报》2025年第2期350-360,共11页彭烨华 高杨 张立富 黄少康 李文峰 
广州市科技计划项目(202103000009);广东省科学院科技发展专项(2022GDASZH-2022010106,2022GDASZH-2022010102);南岭国家公园生态系统与生物多样性监测(一期)(LC-2021124);广东省乡村振兴战略专项资金种业振兴项目(2022-440000-4301030211-9465,2024-XPY-00-014);广东省创新人才培养专项资金“海外名师”项目;广东省科学院动物研究所高级科研人员引进计划专项(GIABR-gjrc201702)。
蜜蜂肠道菌群由一组特定的细菌组成,在宿主营养代谢、免疫调节及解毒等方面发挥重要作用。本研究对一来自中华蜜蜂Apis cerana cerana工蜂肠道的菌株——G0441进行了分离、鉴定以及基因组分析。G0441菌体呈圆形,直径约1 mm,表面光滑,半...
关键词:中华蜜蜂 肠道菌群 Gilliamella 基因组分析 
11种铁皮石斛叶绿体基因组分析及分化时间推算
《浙江大学学报(农业与生命科学版)》2025年第2期291-302,共12页周宇 刘苑坤 方玉占 周坚宏 陈家悦 
研究不同产地来源的铁皮石斛(Dendrobium officinale)遗传差异性,有利于深入了解铁皮石斛物种起源与分化,为铁皮石斛种质资源的保护提供理论依据。本研究分析了11种不同产地来源的铁皮石斛叶绿体基因组结构及特征。结果表明:11种铁皮石...
关键词:铁皮石斛 叶绿体基因组 序列分析 分化时间 
一株新型海洋噬藻体QB2的分离、基因组学分析及生物地理分布
《海洋与湖沼》2025年第2期380-392,共13页苏畅 崔丹华 周洪艳 王天聪 王褚晓 陈鑫 邵红兵 郭萃 汪岷 
国家自然科学基金项目,42176149号,41906126号,41976117号,42120104006号。
在南海海盆区分离得到一株侵染海洋聚球藻的噬藻体QB2,分析表明其基因组全长为171898bp,GC含量为41.49%。在噬藻体QB2基因组中检测到212个开放阅读框(ORFs)和7个tRNA基因。所预测到的ORFs根据功能可分为病毒粒子结构模块、DNA复制与调...
关键词:噬藻体 聚球藻 基因组分析 辅助代谢基因 生物地理分布 
一株多重耐药性单增李斯特菌全基因组分析
《食品安全质量检测学报》2025年第6期261-265,共5页方小丽 张璟 
甘肃省自然科学基金项目(23JRRA1796)。
目的 从甘肃省市售冷冻鸡肉中分离到一株单增李斯特菌,分析其血清型、耐药表型及其基因组特征。方法 玻片凝集法进行血清学鉴定,微量肉汤法分析菌株对8种抗生素敏感性,测序分析其基因组特征。结果 该菌株经过16srDNA种属鉴定为单增李斯...
关键词:单增李斯特菌 毒力基因 耐药表型 耐药基因 
一株秸秆促腐枯草芽孢杆菌的筛选鉴定及全基因组分析
《微生物学通报》2025年第3期1134-1147,共14页安妮 徐瑞阳 吴锡 李娟 李冠华 张德建 
国家自然科学基金(22068028,21868018);国家重点研发计划(2022YFD1500902-3);内蒙古自治区科技计划(2022YFDZ0060)。
【背景】提高秸秆腐解效率是改善土壤质量、阻止土壤退化的重要途径。【目的】拟筛选抗逆性强秸秆腐解效率高的微生物,优化其培养条件,并分析功能基因。【方法】首先从北方低温干旱区获得土样,利用水解圈法、相对细胞密度法和酶活测定...
关键词:秸秆促腐菌 枯草芽孢杆菌 抗逆性 发酵优化 全基因组 
一株产纤维素酶菌株的筛选、鉴定及全基因组分析
《生物技术通报》2025年第3期294-307,共14页车建美 郑雪芳 王阶平 陈燕萍 陈冰星 刘波 
中央引导地方科技发展专项(2022L3020);农业高质量发展超越“5511”协同创新工程(XTCXGC2021019)。
【目的】筛选纤维素降解酶活性强的微生物菌株,用于青贮饲料的高效发酵。【方法】从已有菌种库中,利用羧甲基纤维素钠平板筛选产纤维素酶菌株,测定其纤维素酶活性;采用形态观察、生理生化及16S rRNA对菌株进行鉴定;测定该菌株的生长曲...
关键词:纤维素酶 藤黄微球菌 生长特性 全基因组 纤维素降解基因 
抗沙门氏菌后生元的筛选及其原始菌株全基因组分析
《食品工业科技》2025年第6期195-205,共11页黄燕 苏悦 李施扬 祁雪鹤 贾嫒 姜毓君 杨鑫焱 满朝新 
目的:筛选抗沙门氏菌效果良好的后生元,开发具有产业化价值的后生元原料。方法:测定30株乳酸菌后生元抑制鼠伤寒沙门氏菌生长的能力,筛选出效果最好的5株后生元。随后对这5株后生元抑制鼠伤寒沙门氏菌黏附和侵袭HT-29细胞的能力进行测定...
关键词:乳酸菌 后生元 鼠伤寒沙门氏菌 抗菌 全基因组 安全性评价 
高毒力肺炎克雷伯菌携带质粒泛基因组分析
《中华流行病学杂志》2025年第3期506-513,共8页吴鑫淼 李臻鹏 黄佳 王瑜昊 卢昕 阚飙 赵俊岭 
国家重点研发计划(2022YFC2303900)。
目的以全球高毒力肺炎克雷伯菌(hvKP)携带的质粒为研究对象,从质粒泛基因组、泛耐药基因、泛毒力基因及泛复制子等多个方面分析其特征及随时间演化趋势,从而为理解质粒遗传多样性、耐药基因、毒力基因等演化提供更全面的认识。方法从美...
关键词:肺炎克雷伯菌 泛基因组 耐药基因 毒力基因 复制子 
索斯诺夫斯基独活TPS基因家族全基因组分析
《中文科技期刊数据库(全文版)自然科学》2025年第3期029-034,共6页随梦齐 
为了探讨伞形科植物索斯诺夫斯基独活TPS基因家族的潜在功能,本研究基于生物信息学分析对其萜类合成酶基因家族的理化性质、进化关系、染色体定位、基因结构、保守基序、染色体定位以及基因功能能进行了系统性地分析。我们在索斯诺夫斯...
关键词:索斯诺夫斯基独活 萜类合酶 基因家族 生物信息学 
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