生物合成基因簇

作品数：182被引量：366H指数：9
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早期描述物种的模式标定及基因组解析:以中国第一个被描述的真菌新种五棱散尾鬼笔为例
《菌物学报》2025年第4期14-28,共15页梁俊敏 王科 杜卓 赵明君 蔡磊 戴玉成 
中华人民共和国科学技术部基础资源调查专项(2021FY100900)。
五棱散尾鬼笔Lysurus mokusin(L.f.)Fr.,又名中华散尾鬼笔,于1774年由法国传教士西博特(Cibot PM)描述与发表,是首个被科学描述的中国真菌新物种,为稳定该名称的准确使用,本研究依照现用命名法规对该物种开展了模式标定和分类学研究,指...
关键词：附加模式 DNA条形码 HiFi测序 双速基因组 生物合成基因簇 
红树林来源链霉菌中2-羟基苯基噻唑啉衍生物及其生物合成基因簇分析
《热带海洋学报》2025年第2期64-72,共9页刘思妮 白猛 朱义广 罗小卫 高程海 刘永宏 徐新亚 蒋晓东 
广西科技基地和人才专项(桂科AD22035167);广西自然科学基金项目(2023GXNSFBA026139、2023GXNSFAA026313);广东省海洋药物重点实验室开放基金课题项目(LMM2022-4);广西中医药大学博士科研启动基金项目(2021BS022);广西中医药大学《桂派中医药传承创新团队》项目(2022A007);广西中医药大学第三批“岐黄工程”高层次人才团队培育项目(202407);广西八桂学者专项基金项目(05019055)。
文章探讨和分析了海南红树林沉积物来源链霉菌Streptomyces ardesiacus GXIMD 03502的次级代谢产物及相应生物合成基因簇。通过比对16S rDNA序列信息对菌株进行初步鉴定。综合运用多种色谱分离技术分离其次级代谢产物,结合波谱数据分析...
关键词：红树林放线菌 链霉菌 2-羟基苯基噻唑啉 生物合成基因簇 
喷他霉素新生产菌的发现及产量提高被引量：1
《微生物学通报》2024年第8期2888-2904,共17页孙佳宁 王海燕 范可强 何信 廖振翔 王立艳 黄英 任晋玮 孟大利 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32270081)。
【背景】喷他霉素(pentamycin)是一种多烯大环内酯类抗生素,对白色念珠菌(Candida albicans)、阴道毛滴虫(Trichomonas vaginalis)和其他几种病原菌有显著的抑制活性,在瑞士已被注册用于治疗阴道念珠菌病、滴虫病和混合感染。【目的】...
关键词：次级代谢产物 喷他霉素 生物合成基因簇 基因工程改造 
糖丝菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立被引量：1
《微生物学通报》2024年第7期2614-2629,共16页李栋 范可强 胡会涛 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32070067)。
【背景】稀有放线菌是发掘天然产物的“新矿藏”。糖丝菌(Saccharothrix)作为典型的稀有放线菌,其天然产物生产潜能尚需进行系统分析和发掘。此外,针对糖丝菌的基因编辑体系也鲜有报道。【目的】揭示糖丝菌属稀有放线菌合成不同结构类...
关键词：糖丝菌 次级代谢 天然产物 生物合成基因簇 基因编辑 
拟无枝酸菌属次级代谢潜能分析及代表菌株基因编辑体系建立被引量：1
《微生物学通报》2024年第5期1713-1731,共19页杨英哲 范可强 王海燕 向丽军 张书平 赵燕 潘国辉 
国家重点研发计划(2022YFC2303100);国家自然科学基金(32270080)。
【背景】拟无枝酸菌属作为一类重要的稀有放线菌,是抗菌、抗癌类药物的重要来源,其合成天然产物的潜能尚待系统分析及发掘。【目的】揭示拟无枝酸菌属不同结构类型次级代谢产物合成潜能,并建立两个代表性菌株的遗传操作体系,为结构新颖...
关键词：拟无枝酸菌属 次级代谢 天然产物 生物合成基因簇 基因编辑 
后基因组时代微生物天然产物高效发掘体系设计与展望被引量：1
《微生物学杂志》2022年第3期1-14,共14页潘华奇 
国家自然科学基金面上项目(31872036,41576136);中国科学院战略性先导科技专项A类(XDA28090300);中科院青年创新促进会会员项目(2018229);辽宁省兴辽英才计划项目(XLYC1807268)。
微生物天然产物具有丰富的化学结构多样性和诱人的生物活性,持续启迪着创新医药和农药的发现。近年来,随着高通量测序技术的快速发展,巨大的微生物基因组数据揭示了多样生物合成和新颖天然产物的潜能远高于以前的认知。然而,如何高效地...
关键词：潜力菌株 先导化合物 泛生物合成基因簇 沉默基因簇 基因组挖掘 代谢组学 次级代谢产物 合成生物学 
珠江口沉积物来源链霉菌SCSIO 40020中bafilomycins的鉴定及其生物合成基因簇的异源表达
《微生物学报》2021年第12期3991-4005,共15页翟诗岚 刘威 吴正超 朱义广 张文军 张长生 马亮 
广东省基础与应用基础研究基金(2021A1515010839);广州市科技计划(202102020513);国家自然科学基金(21907098,41706181);国家重点研发计划(2019YFC0312503);王宽诚教育基金(GJTD-2020-12)。
【目的】从珠江口沉积物来源的菌株SCSIO 40020中分离bafilomycins,并对其生物合成基因簇进行克隆和异源表达研究。【方法】通过分析菌株SCSIO 40020的16S rRNA基因序列并构建系统发育树以鉴定菌种,以柱层析法和制备色谱法对次级代谢产...
关键词：链霉菌 bafilomycins 生物合成基因簇 异源表达 
CRISPR/Cas9基因编辑系统在获取放线菌天然产物中的应用被引量：3
《有机化学》2021年第11期4279-4288,共10页乔怡 张庆林 陈单丹 刘美娜 刘文 
国家自然科学基金(Nos.21977109,32030002,21750004);国家重点研发计划(No.2019YFA0905400);中国科学院战略性先导科技专项(No.XDB20020200);中国科学院青年创新促进会(No.2017303)资助项目.
作为临床药物的重要来源,放线菌天然产物及其衍生物已被大规模开发并应用于临床.为了实现放线菌来源活性天然产物的高效合成、新型天然产物的结构衍生以及未知天然产物的定向挖掘,往往需要聚焦于生物合成基因簇,运用生物学技术开展理性...
关键词：放线菌 天然产物 生物合成基因簇 基因编辑 规律性间成簇间隔的短回文重复序列及相关蛋白9(CRISPR/Cas9) 
珊瑚来源真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11中聚酮化合物的发现及其生物合成途径分析被引量：1
《微生物学报》2021年第11期3631-3641,共11页周晓雪 杨佳凡 李明哲 宋永相 鞠建华 李晓帆 王立岩 
深圳市科技计划(JCY20180305123659726)。
海洋来源真菌的天然产物因其独特的结构与生物学活性而备受关注,而利用基因组信息对其代谢产物进行深入挖掘也成为研究策略之一。【目的】本文以一株南海珊瑚来源的真菌Parengyodontium album SCSIO SX7W11为目标菌株,挖掘其生产聚酮类...
关键词：Parengyodontium album SCSIO SX7W11 sydowinin A 生物合成基因簇 基因组 海洋真菌 
海鞘来源放线菌Streptomyces pratensis SCSIO LCY05中skyllamycins的发现及其生物合成分析
《中国海洋药物》2021年第3期1-14,共14页李艳青 凌春耀 易湘茜 高程海 鞠建华 马俊英 
国家自然科学基金项目(31870046,82022067);国家自然科学基金-山东省联合基金项目(U1706206);广东省促进经济发展专项资金(海洋经济发展用途)项目(GDME-2018C003,GDNRC[2020]070);广东省自然科学基金项目(2018A0303130005);“广东特支计划”本土创新创业团队项目(2019BT02Y262);南方海洋科学与工程广东省实验室(广州)人才团队引进重大专项(GML2019ZD0406)资助。
目的挖掘海鞘来源放线菌Streptomyces pratensis SCSIO LCY05生产含肉桂酰独特结构单元的skyllamycins类环肽的潜能,并深入分析skyllamycins生物合成基因簇的新特征。方法利用Illumina Hiseq和Pacbio SMRT测序平台对S.pratensis SCSIO L...
关键词：S.pratensis SCSIO LCY05 肉桂酰结构单元 skyllamycins 生物合成基因簇 缩合/异构化结构域 
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