生物序列

作品数：109被引量：133H指数：6
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相关机构：大连理工大学中国科学院中国科学技术大学山东大学更多>>
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基于CUDA的生物序列数据算术编码并行压缩被引量：2
《计算机应用与软件》2016年第12期26-29,83,共5页许俊富 谢江 顾永立 束俊辉 项超娟 张武 
国家自然科学基金重大研究计划项目(91330116);教育部留学回国人员科研启动基金
随着下一代生物序列测序技术的发展,大文件生物序列数据越来越常见。虽然压缩序列数据能减少数据存储空间,但是传统的数据压缩的方法很难快速完成大规模的序列压缩,因此如何缩短数据压缩时间是当前压缩技术研究的一个重要方向。采用CUD...
关键词：算术编码 生物序列 数据压缩 CUDA 
一种用于多重生物序列比对的协同进化算法被引量：1
《计算机应用与软件》2010年第8期37-40,共4页张树波 
国家自然科学基金资助(60675016;60633030)
序列比对是生物序列分析的一项基础性工作,多重生物序列比对可以帮助预测未知序列的结构和功能。在传统遗传算法的基础上,提出了一种用于多重生物序列比对的协同进化算法,通过引进协同进化机制,使得保守区域和位点以较高的概率传给子代...
关键词：多重序列比对 协同进化算法 选择算子 交叉算子 变异算子 保守区域 
BioIndex:一种生物序列相似性查询的高效索引被引量：1
《计算机应用与软件》2009年第10期1-4,18,共5页邱伯仁 熊赟 朱扬勇 
国家自然科学基金项目(60573093)
有效管理生物数据并提供高效的查询方法是生物信息处理的重要研究内容。BioSeg是一个新的生物序列数据模型。查询优化研究是生物数据库管理系统开发的重要内容之一。研究当前生物数据索引技术,针对BioSeg数据模型的特点和生物序列相似...
关键词：索引 生物序列 生物数据库 数据模型 查询优化 
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