转录因子结合位点

作品数:84被引量:151H指数:6
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基于DAP-Seq方法鉴定玉米胚乳特异表达转录因子O2在全基因组水平上的结合位点被引量:1
《科学通报》2019年第24期2537-2548,共12页宁丽华 王建晖 时丕彪 伍楚善 董志诚 赵涵 
国家重点研究发展计划(2016YFD0101002);国家自然科学基金(31701453);江苏省重点研究开发项目(BE2017365)资助
Opaque2(O2)是一个调控玉米胚乳发育的重要转录因子.为了揭示O2的转录调控网络,利用DAP-Seq技术挖掘其在全基因组范围上结合位点共检测到11385个位点.通过结合已报道RNA-Seq数据,本研究DAP-Seq共检测到317个O2直接结合并调控的靶基因,...
关键词:Opaque2 转录因子 DAP-Seq 转录因子结合位点 调控网络 
非编码DNA序列的功能及其鉴定被引量:5
《遗传》2013年第11期1253-1264,共12页秦丹 徐存拴 
国家重点基础研究发展计划项目(973计划)(编号:2012CB722304);河南省基础与前沿技术研究计划项目(编号:102300413213)资助
非编码DNA序列是指基因组中不编码蛋白质的DNA序列。这些序列可以结合调节因子、转录为功能性RNA、单独或协同地调节生理活动和病理过程。文章围绕基因表达调控作用,总结了近几年非编码DNA序列的研究成果,对其结构、功能和可能的作用机...
关键词:非编码DNA序列 基因表达调控 功能元件 转录因子结合位点 非编码RNA 表观遗传学 
Associations between gene polymorphisms in two crucial metabolic pathways and growth traits in pigs被引量:3
《Chinese Science Bulletin》2012年第21期2733-2740,共8页YANG Fan WANG QiongPing WANG MingHui HE Kan PAN YuChun 
supported by the National Natural Science Foundation of China(31072003,31000992,and30871782);National High Technology Research and Development Program of China(2008AA101009and2006AA10Z1E3);the National Key Basic Research Program of China(2006CB102102)
Propanoate metabolism and fatty acid metabolism are crucial metabolic pathways in vivo that have been studied extensively and have shown a significant influence on the growth and diseases of animals.In order to identi...
关键词:生长性状 基因多态性 代谢途径 关联分析 转录因子结合位点 单核苷酸多态性  SNPS 
转录因子结合位点生物信息学研究进展被引量:28
《遗传》2009年第4期365-373,共9页侯琳 钱敏平 朱云平 邓明华 
国家自然科学基金项目(编号:30570425);国家重点基础研究发展计划项目(编号:2003CB715903);国家高技术研究发展计划项目(编号:2006AA02Z331;2008AA02Z306)资助
转录因子结合位点(Transcription factor binding site,TFBS)是与转录因子结合的DNA序列,它们与转录因子相互作用调控基因的转录过程。确定TFBS是理解转录调控机制,建立转录调控网络的关键问题。随着高通量实验技术的发展,结合ChIP-chi...
关键词:转录因子结合位点 生物信息学 ChIP—chip 位置权重矩阵 系统发育足迹分析法 
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