转录因子结合位点

作品数:84被引量:151H指数:6
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基于碱基关联二联体位置权重矩阵预测酵母转录因子结合位点被引量:3
《生命科学研究》2008年第2期115-120,共6页杨科利 许强 
宝鸡文理学院硕士科研启动项目(ZK0791;ZK0792)
基于已知的酵母转录因子结合位点数据资料,构建转录因子结合位点碱基关联二联体位置权重矩阵,整合碱基关联二联体位置权重矩阵和碱基保守性参量M2i,提出一种新的预测转录因子结合位点的方法(PWMSA).利用self-consistency和cross-validat...
关键词:转录因子结合位点(TFBS) 位置权重矩阵(PWM) 碱基保守性 
转录因子结合位点的计算预测方法研究进展被引量:2
《生命科学研究》2006年第S1期24-31,共8页杜耀华 王正志 
国家自然科学基金资助项目(60471003)
转录因子结合位点的计算预测是研究基因转录调控的重要环节,但现有算法的预测特异性偏低.在深入分析转录因子结合位点生物特征的基础上,对当前基于保守模体和基于比较基因组学的两类计算预测方法进行了综述,指出了方法各自的优点和不足...
关键词:转录因子结合位点 计算预测 模体 比较基因组学 
利用序列保守模体和局部构象信息预测转录因子结合位点被引量:4
《生命科学研究》2006年第3期215-223,共9页杜耀华 倪青山 王正志 
国家自然科学基金资助项目(60471003)
转录因子结合位点的计算预测是研究基因转录调控的重要环节,但常用的位置特异得分矩阵方法预测特异性偏低.通过深入分析结合位点的生物特征,提出了一种综合利用序列保守模体和局部构象信息的结合位点预测方法,以极大相关得分矩阵作为保...
关键词:转录因子结合位点 计算预测 保守模体 极大相关得分矩阵 局部构象 二次判别分析 
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