转座酶

作品数:51被引量:78H指数:4
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染色质转座酶可及性测序技术在畜禽分子育种中的应用研究进展
《中国畜牧杂志》2025年第2期76-81,共6页丁晓玲 刘源 冯雪 刘爽 贺丽霞 冀国尚 冯兰 马云 
国家自然科学基金项目(U22A20506、32072720);宁夏回族自治区重点研发项目(2023BCF01006、2021BEF01002、2021NXZD1);自治区科技创新领军人才培养项目(2020GKLRLX02)。
染色质转座酶可及性测序(ATAC-seq)技术是在全基因组水平上揭示染色质可及性的有效方法,近年来在分析畜禽的染色质可及性后确定不同品种间基因表达调控机制的异同中展现了巨大潜力,为复杂的生物系统提供了许多有价值的见解。本文对ATAC-...
关键词:染色质可及性 畜禽 ATAC-seq 肌肉发育 脂肪沉积 育种及繁殖 疾病 
荧光转基因斑马鱼品系Tg(amh:mCherry)的构建及其性腺发育的示踪分析
《上海交通大学学报(医学版)》2024年第12期1587-1592,共6页吴婧 徐悦 凌诗颖 宋怀东 乔洁 董梅 
国家自然科学基金(82270826,82371873)。
目的·建立一种用于研究性腺发育及相关疾病的转基因斑马鱼品系Tg(amh:mCherry),并对斑马鱼性腺的发育过程进行示踪分析。方法·使用斑马鱼抗米勒管激素(anti-Müllerian hormone,amh)基因编码区的上游启动子序列和红色荧光蛋白的基因...
关键词:抗米勒管激素 Tol2转座酶 转基因 斑马鱼 性腺 
Y1转座酶关联转座子在大肠杆菌和沙门氏菌基因组中的分布和结构特征被引量:1
《生物信息学》2024年第3期217-224,共8页王冰清 关中夏 王亚丽 石莎莎 郭梦可 宋成义 高波 
国家自然科学基金项目(No.32271508)
Y1转座酶关联转座子(Y1ATs)的活性催化位点为一个酪氨酸,能够切割和连接单链DNA,在原核生物分布广泛。为探究Y1转座酶关联转座子在大肠杆菌(Escherichia coli,E.coli)与沙门氏菌(Salmonella enterica,S.ente)基因组中系统进化特性,通过H...
关键词:转座子 Y1 TnpB IS200 IS605 大肠杆菌(E.coli) 沙门氏菌(S.ente) 
基于非病毒方法的大片段外源DNA定点整合技术研究进展
《中国医药工业杂志》2024年第8期1045-1052,共8页崔佳 刘振华 
山西省基础研究计划(自由探索类)项目(20210302124230);长治医学院博士科研启动基金项目(BS202002、BS202121)。
基于非病毒方法的大片段DNA定点整合技术具有成本低、容量大、无免疫原性,以及可避免遗传毒性和癌基因表达等优点,在基因治疗、细胞治疗等领域应用广泛。根据作用机制,可将基于非病毒方法的DNA定点整合技术分为3种,即基于DNA损伤修复的...
关键词:定点整合 非病毒 CRISPR/Cas9 DNA损伤修复 重组酶/整合酶 转座酶 研究进展 
单细胞染色质转座酶可及性高通量测序技术及其应用
《生物技术通报》2023年第12期109-117,共9页赵若含 赵净颖 柏毅承 张瑞芳 贾俊静 豆腾飞 
国家自然科学基金项目(U1702232);云南省基础研究计划项目(202101AU070089)。
单细胞染色质转座酶可及性的高通量测序(single-cell assay for transposase-accessible chromatin with high-throughput sequencing,scATAC-seq)是利用转座酶研究单细胞染色质开放性的高通量测序技术,对于研究全基因组的表观遗传调控...
关键词:scATAC-seq 数据分析 应用 
Tn5转座酶融合蛋白在CUT&Tag实验中的优化及评价
《植物学报》2023年第4期602-611,共10页刘晟宇 刘晓斌 朱家富 苏京 董志诚 刘敏 
国家自然科学基金(No.31871289,No.31900463);广州大学研究生创新能力培养资助计划(No.2021GDJC-M23)。
Tn5是一种细菌转座子。经改造的Tn5能够高效地切割DNA,同时连接上特定的接头序列,因而广泛应用于高通量二代测序文库构建中。CUT&Tag(Cleavage Under Target&Tagmentation)是一种改进的研究蛋白质与DNA互作的技术,具有重复性好、信噪比...
关键词:CHIP CUT&Tag RNA聚合酶Ⅱ Tn5 
适用于多种禾本科植物染色质转座酶可及性测序的提核建库方法
《作物学报》2023年第7期1799-1807,共9页祁泽文 黄铭涵 张佳卉 刘艺 韩烈保 何航 
国家自然科学基金项目(31971770)资助。
为建立适用于多种禾本科植物染色质转座酶可及性测序(assay for transposase accessible chromatin with high-throughput sequencing, ATAC-seq)的细胞核提取和建库体系,本试验以水稻、小麦和结缕草的叶片及根系为研究材料,通过控制变...
关键词:禾本科 染色质可及性 ATAC-seq 细胞核 
转座酶可及性染色质测序法联合RNA测序探究解旋酶样转录因子基因的缺失对肝细胞癌的影响被引量:1
《肝癌电子杂志》2023年第2期7-15,共9页张艺旋 马亚锐 王小兵 焦宇辰 
国家自然科学基金面上项目(82172988)。
目的:探究解旋酶样转录因子(helicase like transcription factor,HLTF)基因在肝细胞癌(hepatocellular carcinoma,HCC)中潜在的调控机制。方法:构建HLTF基因稳定敲除的HCC细胞株。应用RNA测序法(RNA sequencing,RNA-seq)检测并分析肝...
关键词:转座酶可及性染色质测序法 RNA测序法 肝细胞癌 解旋酶样转录因子 
影响转座子介导耐药基因传播因素的研究进展被引量:1
《动物医学进展》2023年第5期81-85,共5页郭月婷 郭玉茹 谢佳彤 张杰 李志 王盈予 刘明春 
国家自然科学基金项目(31572564、31972736)。
转座子是一种可移动的遗传元件,它不仅是耐药基因的载体,还会使耐药基因在不同菌属之间水平转移,造成耐药多样性现象。转座子在细菌耐药性传播过程中发挥着重要的作用。因此,了解影响转座子介导细菌耐药性传播的因素,可为深度解析细菌...
关键词:转座子 转座单元 转座酶 插入序列 
CRISPR相关转座酶及其细菌基因组编辑应用
《生物技术通报》2023年第4期49-58,共10页周晓杰 杨思琪 张译文 徐佳琪 杨晟 
国家杰出青年科学基金项目(21825804);国家自然科学基金创新群体(31921006)。
CRISPR-Cas能够在RNA引导下靶向DNA或RNA的特定序列,改变RNA序列即可改变靶向位点,利用这一可重编程特性已开发出了各种强大的遗传学工具。最近发现CRISPR元件在进化过程中被Tn7转座子劫持,由此衍生出的CRISPR相关转座酶(CRISPR-associa...
关键词:CRISPR相关转座酶 移动遗传元件 基因组编辑 多重基因整合 
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