位点预测

作品数：87被引量：82H指数：5
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基于LightGBM的蛋白质类泛素化修饰位点预测
《南京理工大学学报》2022年第2期156-163,共8页陈焕超 魏志森 於东军 杨敬民 杨静宇 
福建省自然科学基金(2020J01813);福建省教育厅中青年项目(JAT190362)。
蛋白质类泛素化修饰位点的准确识别对基础研究和药物开发都具有重要意义。该文提出了一种基于蛋白质序列特征的类泛素化修饰位点预测模型。该模型结合氨基酸的物理化学属性统计特征和氨基酸序列二元语法模式特征,训练一种轻量型梯度提升...
关键词：蛋白质翻译后修饰 蛋白质类泛素化修饰位点 基于序列的预测 轻量型梯度提升机 二元语法模式 
基于深度学习与领域规则建模的蛋白质信号肽及其切割位点预测被引量：8
《南京理工大学学报》2020年第3期278-287,共10页张维洵 潘小勇 沈红斌 
国家自然科学基金(61725302,61671288,61903248)。
为了提升蛋白质信号肽及其切割位点预测精度,有效区分3种不同类型的信号肽,提出基于位置特异性打分矩阵(PSSM)和同源检测迭代的隐马尔科夫(HMM)文件的深度学习预测方法。设计基于自注意力机制的神经网络模型用于信号肽预测,并使用基于...
关键词：深度学习 领域规则 蛋白质 信号肽 知识迁移 门控循环单元 条件随机场 
基于类不平衡学习的蛋白质与金属离子交互位点预测被引量：1
《南京理工大学学报》2018年第6期707-715,共9页乔梁 谢冬青 
国家自然科学基金(61772007)
为了提高蛋白质与金属离子的交互位点(PMIIS)预测的准确率,从解决数据分布不平衡问题出发,提出了1种结合下采样与上采样方法的类不平衡学习算法。同时对多数类样本与少数类样本进行采样,在补充少数类样本信息的同时,减少多数类样本的冗...
关键词：类不平衡学习 蛋白质与金属离子 交互位点 预测 支持向量机 
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