文库筛选

作品数:100被引量:331H指数:8
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利用CRISPR/Cas9 sgRNA文库筛选调控结直肠癌对奥沙利铂敏感性的表观遗传相关基因
《中国生物化学与分子生物学报》2024年第12期1698-1708,共11页付亚坤 贾林创 穆标 
天津市医学重点学科(专科)建设项目(No.TJYXZDXK-032A);天津医科大学朱宪彝纪念医院科研基金(No.ZXY-YJJ2021-1)资助。
结直肠癌是最常见的消化系统恶性肿瘤之一,以奥沙利铂(oxaliplatin,OXA)为基础的联合化疗方案是临床上治疗中晚期病人最常用的策略,但耐药性的产生极大限制了化疗的效果,是导致化疗失败的主要原因。因耐药发生机制未明,亟需一种高通量...
关键词:结直肠癌 奥沙利铂 肿瘤耐药性 CRISPR/Cas9文库筛选 
大豆抗花叶病毒病基因GmRHF1的克隆及功能分析被引量:1
《中国农业科学》2024年第23期4632-4643,I0002,I0003,共14页冯雯蜜 周芳雪 于哲 牟可欣 井妍 李海燕 
国家自然科学基金(32301921,32171937);海南省自然科学基金(323RC413);三亚“崖州湾”菁英人才科技专项(SCKJ-JYRC-2023-17);海南省研究生创新科研课题(Qhys2023-241)。
【目的】大豆花叶病毒(soybean mosaic virus,SMV)引起的大豆花叶病毒病严重制约着大豆的产量和品质,通过序列变异分析、病毒诱导的基因沉默(virus induced gene silencing,VIGS)等技术验证了大豆RING-H2型锌指蛋白基因GmRHF1的抗病功能...
关键词:大豆花叶病毒 锌指蛋白 表达模式分析 酵母文库筛选 荧光素酶互补试验 
CRISPR-Cas9蛋白激酶文库筛选胰腺癌多药耐药共同靶点的价值
《医学临床研究》2024年第12期1828-1832,共5页曾思媛 兰斌 王慧玲 张超杰 
国家自然科学基金(82403714);湖南省自然科学基金(2023JJ40375);湖南省卫生健康委员会科研课题(W20243025)。
【目的】分析CRISPR-Cas9蛋白激酶文库筛选胰腺癌(PDAC)多药耐药共同靶点的价值。【方法】在KPC小鼠模型衍生的PDAC细胞系TB32047中通过慢病毒转染全蛋白激酶组文库,分别使用IC90药物浓度的奥沙利铂、氟尿嘧啶、伊利替康连续处理上述细...
关键词:胰腺肿瘤 蛋白激酶类 抗药性 多药 基因文库 
北京大学田松海团队发表利用CRISPR筛选技术研究细菌毒素作用机制的实验方案
《Journal of Chinese Pharmaceutical Sciences》2024年第11期1097-1098,共2页 
2024年11月1日,北京大学药学院天然药物及仿生药物全国重点实验室田松海研究员团队在著名期刊Nature Protocols发表了题为“Design, performance, processing, and validation of a pooled CRISPR perturbation screen for bacterial to...
关键词:文库筛选 细菌毒素 重点实验室 筛选技术 筛选过程 评价准则 
基于Fosmid文库筛选山羊瘤胃微生物源蛋白酶基因及其表达验证
《西北农林科技大学学报(自然科学版)》2024年第4期28-38,共11页杨凯尧 刘功炜 李林芳 王智伟 崔雯元 杨雨鑫 
国家重点研发计划项目(2022YFD1300201,2021YFD1600704);陕西省重点研发计划项目(2021ZDLNY05-02);国家绒毛用羊产业技术体系项目(CARS-39-12)。
【目的】利用Fosmid文库功能筛选法,获得山羊瘤胃微生物源蛋白酶基因并进行原核表达。【方法】利用功能底物筛选法从山羊瘤胃微生物源Fosmid文库中筛选具有蛋白酶活性的克隆子,对其进行Illumina二代测序,对预测到的基因进行功能注释,根...
关键词:FOSMID文库 蛋白酶 L-天冬酰胺酶 原核表达 基因筛选 菌株生产 
基于Fosmid文库筛选山羊瘤胃源酯类水解酶基因及其原核表达验证
《中国畜牧杂志》2024年第2期346-355,共10页李林芳 刘功炜 杨凯尧 王智伟 崔雯元 杨雨鑫 
国家重点研发计划(2022YFD1300201、2021YFD 1600704);陕西省重点研发计划(2021ZDLNY05-02、2023-YBNY-105);国家绒毛用羊产业技术体系(CARS-39-12)。
试验旨在挖掘瘤胃微生物中潜在的酯类水解酶基因并进行原核表达,研究其酶学性质及对芥子碱的降解效果。利用功能筛选方法,从前期构建的山羊瘤胃微生物Fosmid文库中鉴定出潜在的酯类水解酶基因,并在大肠杆菌中异源表达,通过酶活测定及芥...
关键词:FOSMID文库 酯类水解酶 原核表达 酶学性质 芥子碱 
CRISPR-Cas9高通量文库筛选技术在胶质瘤中的应用进展
《医学综述》2023年第13期2568-2573,共6页濮蓓 张旭 熊晓星 简志宏 曾智 
胶质瘤是最常见的神经系统肿瘤,其治疗以手术切除、术后辅助放化疗为主,但效果不理想,预后较差。成簇间隔规律短回文重复序列(CRISPR)-CRISPR相关蛋白9(Cas9)高通量文库筛选技术以合成致死治疗策略为基础,通过CRISPR-Cas9技术对胶质瘤...
关键词:胶质瘤 成簇间隔规律短回文重复序列-CRISPR相关蛋白9 合成致死 高通量文库筛选 
基于文库筛选的方法确定SPINT3与胃腺癌转移之间的关联
《兰州大学学报(自然科学版)》2023年第3期406-414,共9页汪海锋 王浩浩 滕理送 
国家自然科学基金项目(81772853)。
通过胃腺癌肺转移模型确定SPINT3与胃癌转移之间的相关性.结果表明, SPINT3 sgRNA在胃腺癌肺部转移中的表达均为阳性;SPINT3的表达与转化生长因子β1(TGFβ1)的分泌密切相关.检测SPINT3与肿瘤细胞的凋亡、增殖、迁移、体内转移能力和肿...
关键词:TGFβ1结合通路 SPINT3 胃腺癌 肿瘤转移 
基于CRISPR-Cas9技术的鸡成纤维细胞系全基因组敲除文库的建立与初步应用被引量:2
《中国动物传染病学报》2022年第5期50-59,共10页徐娟 刘忠媛 刘彦峰 廖瑛 仇旭升 宋翠萍 谭磊 刘玮炜 孙英杰 丁铲 
国家自然科学基金项目(32122085,32030108)。
CRISPR-Cas9已被广泛证实是高效强大的第三代基因编辑工具。高通量且系统无偏的靶向全基因组水平编辑技术的应用对充分理解基因功能具有重要的意义。基于CRISPR-Cas9技术的大规模筛选方法已在哺乳动物研究领域取得重要进展,尽管鸡全基...
关键词:CRISPR-Cas9文库筛选 DF-1细胞 新城疫病毒 c-C基序趋化因子类26 
小麦酵母双杂交文库构建及文库质量的鉴定被引量:4
《西北农业学报》2022年第8期948-957,共10页李立群 王冰心 吕千 杨智全 
陕西省农业协同创新与推广联盟重大科技项目(LMZD202104);西北农林科技大学实验技术研究与实验室管理创新项目(SY20210227)。
以中国春小麦叶、茎、幼穗及花后3、6、9、12、15、20、25d的籽粒为材料,利用Gateway技术构建中国春小麦cDNA初级文库和次级文库,由次级文库质粒转化Y187酵母菌株构建出酵母双杂交文库。通过mating法筛选小麦粒质量基因TaDAR1的互作蛋白...
关键词:小麦 酵母双杂交文库 自激活检测 文库筛选 
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