系统发育基因组学

作品数：24被引量：228H指数：8
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相关作者：李德铢朱瑞良张亚平周旭明杨光更多>>
相关机构：中国科学院大学云南大学中国科学院南京师范大学更多>>
相关期刊：《广西植物》《昆虫学报》《中国科学：生命科学》《河北大学学报（自然科学版）》更多>>
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不同组装软件在系统发育基因组学中的应用比较
《河北大学学报（自然科学版）》2023年第2期171-178,共8页王耀卓 张文强 张俊霞 
国家自然科学基金资助项目(32070422);河北大学高层次人才科研启动项目(521000981324)。
为了筛选出最适合于超级保守元件(ultra-conserved elements,UCE)序列组装的软件,分别使用5款组装软件SPAdes、ABySS、Velvet、Trinity和Minia对17个UCE捕获测序文库进行组装.结果发现:5款组装软件对UCE数据的组装结果不同,Trinity组装...
关键词：数据分析 超级保守元件 系统发育基因组学 
昆明植物所揭示新生代气候变化背景下亚热带常绿阔叶林的动态演化历史
《高科技与产业化》2023年第3期50-50,共1页
近期,中国科学院昆明植物研究所李德铢专题组在基于山茶科系统发育基因组学探讨东亚常绿阔叶林起源与演化研究的基础上,以东亚常绿阔叶林的优势类群—樟科木姜子复合属群(Litsea complex)为研究材料,对该属群97种植物进行取样,以樟族、...
关键词：系统发育基因组学 亚热带常绿阔叶林 昆明植物研究所 山茶科 木姜子 中国科学院 樟科 动态演化 
菌物学研究的几点思考被引量：3
《菌物研究》2023年第1期10-13,共4页刘杏忠 戴玉成 
随着测序技术的进步和组学发展,给传统菌物学研究带来了挑战,也为现代菌物学发展提供了机遇。分子系统学及环境DNA序列对菌物学经典分类造成了极大的冲击,基因组时代的物种概念还没有很好地建立,极早期分化真菌成为了新的研究热点,基因...
关键词：分类 物种形成 物种概念 系统发育基因组学 
白花刺续断野生居群的叶绿体全基因组特征解析被引量：3
《广西植物》2022年第10期1750-1761,共12页张倩 张德全 
国家自然科学基金(32060091);云南省中青年学术和技术带头人后备人才项目(202105AC160063);大理大学中药资源与民族药创新团队项目(ZKLX2019318);云南省李剑专家工作站(202005AF150013)。
白花刺续断在中国西藏是一种常用的药用植物,但其叶绿体全基因组的相关研究较少。为揭示该物种叶绿体全基因组的基本特征并探讨其谱系遗传结构,该研究利用Illumina测序平台对来自5个野生居群的10个白花刺续断个体进行二代测序,经组装、...
关键词：白花刺续断 叶绿体全基因组 药用植物 基因 系统发育基因组学 
中国苔藓植物多样性研究进展被引量：28
《生物多样性》2022年第7期82-93,共12页朱瑞良 马晓英 曹畅 曹子寅 
国家自然科学基金(31970215);华东师范大学“幸福之花”先导研究基金项目。
苔藓植物是生物多样性的重要组成部分,包括角苔植物、苔类植物和藓类植物三大类群,其物种数量仅次于被子植物,是高等植物的第二大类群。我国是世界苔藓植物多样性最丰富的国家。自2017年以来,我国苔藓学者在世界范围发现了10个新属, 40...
关键词：新分类群 多样性和分布 系统发育基因组学 环境适应 气候变化 保护 
有瓣蝇类分类、系统发育及演化被引量：5
《昆虫学报》2021年第6期757-768,共12页闫利平 裴文娅 张东 
国家自然科学基金项目(31572305,31872964);北京林业大学杰出青年人才培育计划(2019JQ03018);博士后创新人才支持计划(BX20190042);中国博士后科学基金项目(2020M670177)。
有瓣蝇类(Calyptratae)隶属于昆虫纲(Insecta)四大超适应辐射类群之一的双翅目(Diptera),占双翅目已知物种多样性的近20%。有瓣蝇类分布广泛,生物学习性极为多样,在维系生态系统稳定中发挥着重要作用,是媒介、法医、传粉和天敌昆虫学研...
关键词：双翅目 有瓣蝇类 分类学 系统发育学 支序系统学 系统发育基因组学 演化历史 适应辐射 
科技名刊精选
《科学中国人》2020年第7期10-15,共6页
千种植物转录组与绿色植物的系统发育基因组学。nature封面:达尔文在《物种起源》结尾所描绘的各个物种交错生长的“枝蔓缠绕的河岸”示例。nature杂志第7780期封面文章报道了“千种植物转录组”计划的科学家们报道的1124种植物的转录组...
关键词：系统发育基因组学 《物种起源》 有花植物 维管植物 转录组 基因组变化 封面文章 绿色植物 
植物生命之树重建的现状、问题和对策建议被引量：6
《生物多样性》2020年第2期176-188,共13页王伟 刘阳 
中国科学院战略性科技先导专项B类(XDB31030000);国家自然科学基金(31770233,31770231,31470315).
生命之树的概念源自1859年达尔文的《物种起源》,但利用分子数据重建植物生命之树的研究则在20世纪90年代才开始兴起。近年来,随着测序技术、分析方法和计算能力的快速发展,植物生命之树重建研究取得了显著成果。本文首先概述了当前以...
关键词：分子系统学 系统发育基因组学 形态学 超大树 生命之树 
石松类和蕨类植物质体基因组结构演化研究进展被引量：5
《生物多样性》2019年第11期1172-1183,共12页杜新宇 卢金梅 李德铢 
中国科学院重大科技基础设施开放研究项目(2017-LSF-GBOWS-02);云南省科技领军人才培养计划(2017HA014)。
近年来,随着测序技术的发展,石松类和蕨类植物的核基因组、质体基因组以及线粒体基因组研究发展迅速,质体基因组研究工作更是呈爆发式增长。截至2019年3月1日,GenBank公布的石松类和蕨类植物的175个质体基因组中,约3/4为最近两年新增。...
关键词：石松类 蕨类 质体基因组 基因组结构变异 RNA编辑 长片段非编码序列插入 系统发育基因组学 
系统发育基因组学方法研究进展被引量：8
《中国科学：生命科学》2019年第4期456-471,共16页李佳璇 梁丹 张鹏 
系统发育基因组学是系统发育学与基因组学融合产生的一个交叉学科,主要通过分析基因组水平的大规模分子数据来解析生物之间的系统进化关系.本文简述了5种常用的基于高通量测序技术的系统发育基因组学数据获取方法:扩增子测序(targeted a...
关键词：高通量测序 系统发育基因组学 系统发育分析 系统误差 系统发育信号 
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