系统发育进化树

作品数：40被引量：272H指数：7
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相关机构：中国农业科学院哈尔滨兽医研究所广西大学江苏省农业科学院广西水产研究所更多>>
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A型塞内卡病毒SVA/CH-GX01-2020株全基因组特征分析
《南方农业学报》2024年第11期3453-3462,共10页王睿敏 施开创 冯淑萍 尹彦文 龙凤 陆文俊 屈素洁 
国家自然科学基金项目(31772748);广西重点研发计划项目(桂科AB21238003);广西农业科技自筹经费项目(Z201954,Z202031)。
【目的】通过对A型塞内卡病毒(SVA)广西分离株全基因组特征进行深入分析,了解其病原特征和分子流行病学特点,为有效防止疫情暴发和流行提供理论依据。【方法】对2020年采集自广西的病料进行病毒分离,通过RTPCR检测和间接免疫荧光试验(I...
关键词：A型塞内卡病毒 病毒分离 系统发育进化树 基因组特征 遗传变异 
桑树热激转录因子(Hsf)基因家族克隆及MnHsfA1基因表达模式分析
《南方农业学报》2023年第8期2320-2329,共10页刘丹 邱长玉 韦伟 陆晓媚 黄胜 曾燕蓉 朱光书 张朝华 何骥 林强 
国家重点研发计划项目(2022YFD1601301);国家现代农业产业技术体系建设专项(CARS-18)。
【目的】克隆桑树热激转录因子(Hsf)基因家族成员,并分析MnHsfA1基因表达模式,为深入研究该家族在桑树热应激响应中的调控机制及桑树育种提供理论参考。【方法】以川桑幼苗为试验材料,克隆其MnHsfs基因,通过多序列比对、构建系统发育进...
关键词：桑树 热激转录因子(Hsf) 系统发育进化树 胁迫 顺式作用元件 
基于16S rRNA和gyrB基因串联DNA特征序列的气单胞菌鉴定方法被引量：2
《南方农业学报》2023年第6期1858-1867,共10页陈天楠 胡鲲 
国家重点研发计划“蓝色粮仓科技创新”重点专项(2019YFD0900102);国家淡水水产种质资源库建设项目(FGRC:18537)。
【目的】建立基于16S rRNA序列和gyrB基因串联DNA特征序列的属内菌种鉴定方法,为气单胞菌的种间区分提供技术支持。【方法】以2020—2021年在我国福建、江苏等地分离获得的水产源气单胞菌和NCBI已公布且完成全基因组测序的10种气单胞菌...
关键词：气单胞菌 16S rRNA序列 gyrB基因 串联DNA序列 系统发育进化树 
饲料串珠镰刀菌污染诱发蛋鸡吐水的探索被引量：1
《养禽与禽病防治》2023年第3期2-5,共4页常家高 袁好 刘阳 孙新沅 陈甫 高善颂 
山东省家禽产业技术体系岗位专家(SDAIT-11-07);山东省自然科学基金(ZR2021MC150);山东省科技型中小企业创新能力提升项目(2021tsgc1303)。
本文旨在对某蛋鸡场蛋鸡发生吐水的病例进行分析,确定其病因。通过剖检发生吐水症状的病鸡,检测饲料中霉菌毒素含量、饮水和饲料中微生物总数,对分离霉菌培养进行镜检,ITS基因扩增测序后进行核酸序列比对,绘制系统发育进化树。结果发现...
关键词：饲料 串珠镰刀菌 蛋鸡 吐水 系统发育进化树 
千金子叶绿体基因组的结构及特征分析被引量：1
《杂草学报》2022年第2期6-14,共9页田祥瑞 徐梦彬 王飞 叶凌凤 
江苏省重点研发计划(编号:BE2019396);江苏省“双创博士”及南京市留学人员科技创新计划。
千金子是稻田一年生禾本科恶性杂草,已成为威胁水稻生产的优势种群。采用Illumina HiSeq测序及生物信息分析方法对千金子叶绿体全基因组序列进行测定、组装、注释和解析。结果表明,千金子叶绿体基因组全长为135656 bp,GC含量为38.26%,...
关键词：千金子 叶绿体基因组 结构特征 功能基因注释 SSR 系统发育进化树 
基于叶绿体基因trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL序列的甘薯种质遗传多样性分析被引量：7
《南方农业学报》2021年第6期1536-1544,共9页王崇 焦春海 杨新笋 张文英 雷剑 柴沙沙 王连军 田小海 
国家重点研发计划项目(2019YFD1001300,2019YFD1001304);国家现代农业产业技术体系项目(CARS-11)。
【目的】利用叶绿体基因组(cpDNA)的间隔区序列(trnL-trnF、trnH-psbA和trnT-trnL)对甘薯种质进行遗传多样性分析,为其种质保护及开发利用提供理论依据。【方法】以从我国12个省份收集的52份甘薯种质为材料,从10个cpDNA间隔区序列的引...
关键词：甘薯 叶绿体基因组(cpDNA) TRNL-TRNF TRNH-PSBA trnT-trnL 遗传多样性 系统发育进化树 
金莲花绿变植原体的分子鉴定被引量：1
《植物保护》2020年第3期152-156,共5页王蓉 陈炳蔚 李勇 刘琨 王天佑 丁万隆 
中国医学科学院医学与健康科技创新工程(2016-I2M-3-017);中央本级重大增减支项目(2060302)。
本研究对河北省大面积发生的金莲花绿变病的病原进行检测和鉴定。以金莲花叶片的总DNA为模板,使用植原体16S rDNA和核糖体蛋白(ribosomal protein)基因rp的特异性引物进行PCR扩增,在感病金莲花样品中扩增到植原体的16S rDNA(1 432 bp)...
关键词：金莲花 绿变病 植原体 16S RDNA 核糖体蛋白 系统发育进化树 
大刺鳅生长激素基因克隆与表达分析被引量：4
《南方农业学报》2020年第1期194-201,共8页钟东明 黄小琪 何佩莹 周惠强 张明清 舒琥 
中国—东盟海上合作基金项目(外财函〔2017〕513号);广东省海洋渔业科技攻关与研发项目(A201601A05号);广东省海洋和渔业发展专项(2017A0007号)~~
【目的】揭示生长激素(GH)是否能以旁分泌或自分泌方式对大刺鳅(Mastacembelus armatus)的生长和发育起作用,为其生长调节研究积累基础数据。【方法】采用RACE克隆大刺鳅GH基因cDNA序列,并通过实时荧光定量PCR对大刺鳅不同组织及胚胎不...
关键词：大刺鳅 生长激素(GH) 基因克隆 保守区域 系统发育进化树 表达分析 
铁皮石斛热激转录因子(Hsf)基因家族鉴定及生物信息学分析被引量：7
《南方农业学报》2019年第4期677-684,共8页韩利红 刘潮 张维维 李发 邓发虎 阮子恒 
国家自然科学基金项目(31860005);云南省地方本科高校基础研究联合专项(2017FH001-034);国家级大学生创新创业训练计划项目(201710684012;201810684010)
【目的】鉴定铁皮石斛热激转录因子(Hsf)基因家族成员,并进行生物信息学分析,为深入研究该家族在铁皮石斛热应激响应中的调控机制提供理论参考。【方法】以拟南芥和水稻Hsf蛋白氨基酸序列为参考序列,在铁皮石斛蛋白数据中搜索其同源蛋...
关键词：铁皮石斛 热激转录因子(Hsf) 基因家族 系统发育进化树 胁迫 顺式作用元件 
甲型流感病毒株H1N1(09pdm)的分离及HA和NA基因分析被引量：1
《中国病原生物学杂志》2019年第1期64-68,共5页刘媛 王文博 何怡蓓 邹自英 胡宗海 朱紫衣 范泉水 熊杰 
中国博士后科学基金项目(No.2018T111157;2017M623427;2017M613427;2017T100820)
目的对成都某部人感染甲型流感病毒进行分离鉴定和基因突变分析。方法采集甲型流感患者咽拭子标本,通过MDCK细胞分离病毒毒株;采用免疫荧光法鉴定其感染细胞能力,采用基因分型特异性引物鉴定病毒亚型,PCR扩增血凝素基因(HA)和神经氨酸...
关键词：甲型流感病毒 H1N1 血凝素 神经氨酸酶 系统发育进化树 
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