细胞通讯

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单细胞转录组解析HER2+乳腺癌的免疫微环境重塑及细胞通讯特征
《生物过程》2025年第1期58-66,共9页王浩波 李志豪 于鸿浩 岳鹏鹏 
国家自然科学基金项目(32160147, 32460152)
目的:本研究旨在利用单细胞转录组测序(scRNA-seq)分析HER2+乳腺癌(PT组)与正常乳腺组织(NM组)之间的细胞组成及细胞通讯差异,以探讨乳腺癌微环境的变化及其潜在的分子机制。方法:数据来源于Gene Expression Omnibus (GEO)数据库的GSE16...
关键词：HER2+乳腺癌 单细胞RNA测序 细胞通讯 免疫微环境 
单细胞测序分析脊髓损伤修复的关键基因和细胞通讯
《中华骨科杂志》2025年第5期302-309,共8页安岩 朱祥 王博 张琳 于世炎 
北京积水潭医院学科新星(XKXX202105);北京积水潭医院院级科研基金(ZR202203)。
目的通过转录组测序和单细胞测序分析揭示脊髓损伤修复过程中的关键基因和细胞通讯。方法通过基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载2个脊髓损伤相关的转录组测序数据集和1个单细胞测序数据集。使用R软件中的limma包分析...
关键词：脊髓损伤 基因 转录组测序 高通量核苷酸序列分析 细胞间通讯 
单细胞测序结合机器学习算法揭示心力衰竭病人细胞间通讯及关键调控基因
《中西医结合心脑血管病杂志》2025年第4期525-538,共14页王学付 饶晋 张立 刘旭雯 张宇峰 
上海市曙光计划基金资助项目(No.21SG37)。
目的:基于单细胞测序和机器学习算法构建心力衰竭(HF)的诊断模型,并探索HF病人中细胞间通讯。方法:使用Seurat包对单细胞转录组测序(scRNA-seq)数据质控、降维、聚类和注释。通过AUCell评估各细胞亚群的免疫活性,选择免疫活性最高的细...
关键词：心力衰竭 单细胞测序 机器学习 诊断模型 细胞通讯 
基于单细胞测序数据分析微环境中配体-受体对对IDH突变型脑胶质瘤预后的预测价值
《神经疾病与精神卫生》2025年第1期26-35,共10页张莹 孙志延 陈乔冬 曾凡 王志亮 
国家自然科学基金(82102764,82272870);国家资助博士后研究人员计划(GZC20231749)。
目的分析异柠檬酸脱氢酶(IDH)突变型脑胶质瘤微环境中细胞通讯的特征及意义。方法利用Seurat和clusterProfiler分析IDH突变型脑胶质瘤组织中细胞类型、占比及功能,采用CellphoneDB分析细胞-细胞通讯特征并筛选有显著差异的配体-受体(LR)...
关键词：神经胶质瘤 异柠檬酸脱氢酶突变 细胞通讯 配体-受体对 预后 肿瘤微环境 
基于单细胞测序技术探讨动物骨骼肌卫星细胞与生态位细胞之间的“对话”
《畜牧兽医学报》2024年第12期5340-5348,共9页曹官从 马露 任灵芝 李杨 史新娥 杨公社 李晓 
科技创新2030—重大项目(2023ZD0404702)。
单细胞测序技术是在单个细胞水平上对基因组、转录组、表观组进行高通量测序分析的一项前沿技术。它能够揭示细胞群体差异和细胞发育谱系关系,反映细胞群体的异质性及细胞间的相互作用,在肿瘤发生、干细胞生物学等多个领域发挥重要作用...
关键词：骨骼肌 单细胞测序 肌卫星细胞 细胞通讯 
基于单细胞转录组学分析胰岛缺血性损伤分子机制及核心转录因子的鉴定
《器官移植》2024年第6期920-927,共8页董博清 王颖 王晨鸽 毕焕京 王婧雯 马睿阳 郑瑾 薛武军 丁小明 李杨 
国家自然科学基金(82370802、82400935);创新药物上市后临床研究科研专项(WKZX2023CX190002);陕西省卫生健康科研创新能力提升计划平台建设项目(2023PT-06);中国器官移植发展基金课题。
目的探讨胰岛移植损伤过程中的分子机制和细胞间相互作用。方法使用炎症因子处理的小鼠胰岛的单细胞转录组数据,基于Seurat包进行数据处理,并通过整合数据以去除批次效应。根据已知标志物对各个细胞亚群进行注释。基于CellChat包对炎症...
关键词：胰岛移植 1型糖尿病 单细胞转录组 细胞通讯 转录因子 冷缺血 早期生长反应因子 转录激活因子 
基于单细胞测序探究去势抵抗性前列腺癌肿瘤微环境及细胞间通讯相关信号分子
《江苏大学学报（医学版）》2024年第6期497-506,共10页朱孝仁 陈敏斌 姜鉴倬 薛孟恩 刘媛媛 
国家自然科学基金资助项目(82273055,82072712)。
目的:探究去势抵抗性前列腺癌(castration-resistant prostate cancer,CRPC)的肿瘤微环境中相关信号分子,并分析其与肿瘤发生发展之间的关系。方法:通过基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)中CRPC患者的单细胞RNA测序(scRN...
关键词：去势抵抗性前列腺癌 单细胞测序 肿瘤微环境 细胞通讯 DLL3 
成骨细胞发育中的关键转录因子及细胞通讯分析
《空军军医大学学报》2024年第11期1278-1283,共6页刘遇安 刘妍 杨柳 郑超 
国家自然科学基金面上项目(82372361);空军军医大学西京医院学科助推计划项目(XJZT240N54,XJZT21CM12,XJZT24QN51)。
目的使用成骨细胞单细胞测序数据分析发育调控关键转录因子和细胞通讯。方法对GEO数据库中成骨细胞单细胞测序数据集进行降维、聚类、注释,对注释好的成骨细胞亚群使用pySCENIC软件包,分析转录因子调控网络和调控活性,使用二值化函数bin...
关键词：成骨细胞 骨细胞 单细胞测序 转录因子 细胞通讯 
单细胞测序揭示心脏移植物中树突状细胞和B细胞的抗原提呈特性
《器官移植》2024年第5期789-798,共10页朱越星 陈超 徐晔 范玉玺 郑新国 罗秋琳 汤周琦 张和栋 李腾芳 彭龙开 代贺龙 
国家自然科学基金面上项目(82070776、82270796、82200849、82370761);湖南省科技创新领军人才计划项目(2022RC3071);湖南省自然科学基金项目(2023JJ40872);中南大学高等教育教学改革项目(2023jy110)。
目的探讨心脏移植物中树突状细胞(DC)和B细胞的抗原提呈特性。方法将BALB/c小鼠的心脏移植到C57BL/6J小鼠腹腔内,术后5 d(急性排斥反应早期)提取并流式分选心脏移植物中的CD45+细胞,进行单细胞RNA测序。以心脏移植物中的DC和B细胞的亚...
关键词：心脏移植 抗原提呈 B细胞 树突状细胞 单细胞测序 急性排斥反应 细胞通讯 T细胞 
外泌体的生物学功能及临床应用的进展
《每周文摘·养老周刊》2024年第16期0296-0298,共3页郭洪晨 
外泌体是由多种细胞分泌释放到细胞外环境的一类纳米级脂质双层囊泡,是细胞间通讯和信号传递的重要载体。外泌体携带有大量功能性蛋白质及各类核酸,具有免疫调节、抗炎症反应、增强组织修复等功能。外泌体在细胞间通讯、生殖系统调节、...
关键词：外泌体 细胞通讯 血管新生 免疫调节 细胞凋亡 药物载体 
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