模体识别

作品数：23被引量：50H指数：4
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有向加权网络的重要模体识别及其应用
《复杂系统与复杂性科学》2024年第2期38-44,共7页侯喜妹 王高峡 杨帆 王怡珂 
宜昌市大学科学研究与应用项目(A213018)。
为识别有向加权网络中的重要加权模体,采用边权定性为强弱标签的方式将有向加权网络转换为标签网络、简单模体拓展至标签模体。对于三节点的标签模体类型,用模体在随机网络中出现相应次数的概率估计值代替模体遍历的含时过程,引入与标...
关键词：有向加权网络 标签网络 标签模体 篮球传球网络 运动表现分析 
基于含时网络数据的卫星网络模体识别方法研究
《复杂系统与复杂性科学》2024年第1期51-57,共7页胡博仁 裴忠民 罗章凯 丁杰 
复杂电子系统仿真重点实验室基础研究项目(DXZT-JC-ZZ-2020-001)。
鉴于开展卫星网络局部结构研究是理解网络性质的重要手段,考虑星间链路天线可见性约束等条件,提出了一种基于含时网络数据的卫星网络模体识别方法,建立了从TLE文件输入到子结构识别输出的模体识别流程。以GPS卫星网络的三节点三边模体...
关键词：卫星网络 模体识别 子图浓度 
基于零模型的含时网络模体识别方法被引量：1
《计算机应用》2023年第8期2505-2510,共6页胡博仁 裴忠民 罗章凯 丁杰 
复杂电子系统仿真重点实验室资助项目(DXZT-JC-ZZ-2020-001)。
在带有时间属性的含时网络中,常规的基于频繁子图统计的网络模体识别方法容易受网络规模与结构差异的影响。而与实证网络具有相同规模和某些相同性质的零模型网络能为实证网络的特性挖掘提供了准确的基准,于是提出一种基于零模型的含时...
关键词：含时网络 模体识别 零模型 成功置乱次数 卫星网络 
空中交通网络模体识别及子图结构韧性评估被引量：7
《航空学报》2021年第7期551-561,共11页王兴隆 石宗北 陈仔燕 
国家重点研发计划(2016YFB0502405);中央高校基本科研业务经费专项资金(3122019191)。
研究空中交通网络的结构特征是理解网络性质的重要手段。从局部角度出发,以构成空中交通网络的子图结构为研究对象,对其模体特性进行识别。通过对子图浓度在外界扰动下的变化情况进行分析,提出子图结构韧性概念以表征网络拓扑结构的动...
关键词：航空运输 空中交通 网络韧性 模体识别 子图结构 韧性评估 
差分隐私DNA模体识别安全共享平台的设计与实现被引量：2
《计算机测量与控制》2018年第12期234-237,共4页魏裕阳 马凯 吴响 毛亚青 
江苏省高等学校自然科学研究面上项目(18KJB520049);徐州市科技计划项目(XM13B021);国家安全生产重大事故防治关键技术科技项目(Jiangsu-0006-2016AQ)
在数据共享平台进行DNA模体识别的过程中,如何防止个体信息泄露已成为该领域发展的研究热点;对此,设计并实现了基于差分隐私的DNA模体识别安全共享平台,内置多种满足差分隐私保护模型的DNA模体识别算法,实现数据源选择、算法选择、隐私...
关键词：DNA模体识别 差分隐私 安全共享 
基于显露子串挖掘的基因序列模体识别算法被引量：2
《现代电子技术》2017年第12期6-10,共5页张懿璞 闫茂德 侯俊 阚丹会 
国家自然科学青年基金(61501058);陕西省自然科学青年基金(2016JQ6075);中央高校基本业务费(310832161008)
染色质免疫共沉淀技术将模体识别问题拓展到了全基因组范围,但因数据量过大,传统的模体识别算法往往运算过慢从而无法很好地解决此问题。为了解决传统算法的缺点,提出一种用于Ch IP-seq数据的替换显露子串寻找问题的算法Fast ESE,通过...
关键词：染色质免疫共沉淀 显露子串 模体识别 FastESE 
HashESU:一种生物网络模体识别高效方法被引量：2
《小型微型计算机系统》2015年第9期2042-2046,共5页赵静 钟诚 
国家自然科学基金项目(61462005)资助;广西自然科学基金项目(2014GXNSFAA118396)资助;广西研究生教育创新计划项目(YCSZ2014034)资助;广西教育厅-广西大学博士点建设基金项目(P11900119)资助
通过模体识别可以获得生物网络结构和功能,生物网络模体识别过程涉及到子图枚举和子图同构的问题,计算量非常大.提出一种高效的网络模体识别算法Hash ESU,它使用经典算法ESU枚举子图,采用Hash表结构保存生成的子图,利用每个新增结点与...
关键词：生物网络 模体识别 子图枚举 子图同构 HASHING 
AP聚类算法求解植入(l,d)模体识别问题
《郑州大学学报（工学版）》2015年第3期110-114,共5页陈昆 张小骏 
中央高校基本科研项目(K50513100011)
模体识别是运用计算机算法寻找一系列功能相近且形式相似的DNA序列片段,从而找出生物信息学中控制基因表达调控机制的转录因子结合位点,将这种问题转化为AP聚类算法可处理的模型,然后用AP聚类得到稳定的候选模体聚类,最终利用贪心算法...
关键词：基因转录 模体识别 AP聚类算法 
MCL聚类算法求解植入(l,d)模体识别问题被引量：2
《河南大学学报（自然科学版）》2015年第1期102-107,共6页陈昆 张小骏 
模体识别是指寻找一系列功能相近且形式相似的基因片段.为此将MCL聚类算法引入模体识别应用,设计出一种适用于这个问题的新算法,在一组目标DNA序列中找到拟识别的模体.该方法基于马尔科夫链原理,构建概率转移矩阵,按随机游走方式对矩阵...
关键词：模体识别 MCL聚类算法 马尔科夫链 
基于多态并行处理器的生物计算并行实现
《计算机技术与发展》2014年第8期55-58,62,共5页刘玉荣 李涛 
国家自然科学基金重点资助项目(61136002);陕西省科学技术研究发展计划资助项目(2011K06-47)
针对传统的生物计算中DNA序列保守序列的识别(模体识别)和最长公共子序列计算需要较大的数据量、计算量,以及功耗大等问题,文中提出了两种基于PAAG多态并行处理器的并行算法,该并行处理器能够支持数据、线程、指令多种并行。通过编程在P...
关键词：PAAG多态并行处理器 并行算法 模体识别 最长公共子序列 
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