可变数目串联重复序列

作品数:72被引量:174H指数:7
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MLVA基因分型方法研究世界多地区布鲁氏菌的流行病学特征被引量:5
《中华流行病学杂志》2019年第6期676-681,共6页田国忠 路殿英 朴东日 赵鸿雁 杨晓雯 姜海 
国家重点研发计划(2017YFC1200403).
目的通过多位点串联重复序列分析(MLVA)研究世界多国家和地区分离的布鲁氏菌分子流行病学特征。方法选择11个可变数目串联重复序列位点,使用BioNumerics软件,采用非加权配对算术平均法,对1953-2013年全球48个国家和地区分离的布鲁氏菌V...
关键词:布鲁氏菌 可变数目串联重复序列 
不同可变数目串联重复序列组合对中国流行结核分枝杆菌分辨力的评价研究被引量:4
《中华流行病学杂志》2017年第6期794-799,共6页陈海霞 蔡超 刘静仪 张治国 原梅 贾俊楠 孙照刚 黄海荣 高基民 李卫民 
国家自然科学基金(81273144);北京市自然科学基金B类重点项目(Kz201510025024);北京市结核病临床数据和样本资源库项目(D131100005313012)
目的 在规范化的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)可变数目串联重复序列(variable number of tandem repeats,VNTR)基因分型的基础上,构建我国31个省(自治区、直辖市)VNTR数据库,每个省优化一套VNTR位点组合,...
关键词:结核分枝杆菌 可变数目串联重复序列 基因分型 分辨率 成簇率 
青海省结核分枝杆菌临床分离株可变数目串联重复序列基因多态性研究被引量:5
《中华流行病学杂志》2015年第10期1158-1161,共4页李斌 刘海灿 王兆芬 马永成 苏效东 蒋明霞 万康林 刘寿 赵秀芹 瞿述根 
国家自然科学基金(81160356);国家科技重大专项(2013ZX10003006-002-001)
目的 初步了解青海省结核分枝杆菌临床分离株基因多态性和基因分型特征.方法 2009-2012年收集青海省疾病预防控制中心分离的结核分枝杆菌临床分离株,提取DNA,对15个可变数目串联重复序列(VNTR)位点进行PCR扩增和产物电泳分析,使用BioN...
关键词:结核分枝杆菌 基因分型 多位点数目可变串联重复序列 Hunter-Gaston指数 
贵州省一起人间布鲁氏菌病疫情的菌株鉴定及遗传特征分析被引量:7
《中华流行病学杂志》2013年第7期717-720,共4页李世军 王月 王定明 田克诚 刘英 马青 刘昭宾 龚晓俊 唐光鹏 陈贵春 
贵州省高层次人才科研条件特助经费项目(TZJ-2010-100)
目的鉴定贵州省一起人间布鲁氏菌病(布病)疫情来源菌株(GzzA)并分析其遗传特征。方法应用传统方法和聚合酶链反应(PCR)鉴定菌株,采用多位点可变数目串联重复序列(MLvA)-16分析其遗传特征。结果菌株(GzzA)采用传统方法和PCR...
关键词:布鲁氏菌 聚合酶链反应 多位点可变数目串联重复序列 
福建省结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列基因分型研究被引量:4
《中华流行病学杂志》2012年第11期1167-1170,共4页梁庆福 陈求扬 林淑芳 林建 逄宇 赵永 魏淑贞 王玉锋 郑金凤 赵雁林 
福建省自然科学基金(2010J01116);福建省卫生厅青年科研课题(2009-2-36)
目的了解福建省结核分枝杆菌的多位点可变数目串联重复序列基因分型(MLVA)的特征。方法选择15个可变数目串联重复位点(VNTR),检测福建省30个耐药监测点临床分离的结核菌株,结果使用BioNumerics(Version4.5)软件进行聚类分析。...
关键词:结核分枝杆菌 多位点可变数目串联重复序列 基因分型 
45个可变数目串联重复序列位点用于中国结核分枝杆菌基因型鉴定的分辨力评价被引量:11
《中华流行病学杂志》2009年第1期58-62,共5页吕冰 李兆娜 刘梅 刘志广 赵秀芹 万康林 
国家自然科学基金资助项目(30771853).
目的评价结核分枝杆菌基因组中串联重复序列(VNTR)位点在中国结核分枝杆菌临床分离株的分型鉴定的分辨力。方法参考http://minisatellites.u-psud.fr/网站记载的位点选取其中VNTR位点,参照H37Rv结核分枝杆菌标准株全基因序列,利...
关键词:结核分枝杆菌 可变数目串联重复序列 基闪分型 
结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列分型方法标准化操作程序的建立被引量:29
《中华流行病学杂志》2008年第9期919-924,共6页吕冰 Christine Pourcel 刘敬华 董海燕 张媛媛 蒋毅 刘志广 赵秀芹 万康林 
国家自然科学基金资助项目(30771853)
目的建立结核分枝杆菌多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)的标准化方法,评价该方法的分型能力、应用价值。方法选取15个位点,采用核酸提取、PCR和琼脂糖凝胶电泳等技术,结合BioNumerics(Version5.0)软件,对中国54株结核分...
关键词:结核分枝杆菌 多位点可变数目串联重复序列分析 标准化操作程序 
可变数目串联重复序列技术用于中国C群脑膜炎奈瑟菌基因分型的研究被引量:1
《中华流行病学杂志》2006年第7期595-599,共5页田国忠 邵祝军 李马超 高源 徐丽 崔志刚 任红宇 王艳华 
国家科技部攻关课题资助项目(2005BA711A09)
目的利用脑膜炎奈瑟菌基因组中可变数目串联重复序列(VNTR)特征,对中国C群脑膜炎奈瑟菌菌株进行基因分型。方法中国C群脑膜炎奈瑟菌菌株109株,选择脑膜炎奈瑟菌DNA中4个VNTR位点,PCR扩增含有串联重复序列的DNA片段,选择每一个VNTR位点...
关键词:C群脑膜炎奈瑟菌 可变数目串联重复序列 基因分型 
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