可变数目串联重复序列

作品数：72被引量：172H指数：7
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甘肃省肃北蒙古族自治县喜马拉雅旱獭疫源地鼠疫耶尔森菌分子流行病学特征研究
《中国人兽共患病学报》2025年第2期158-163,170,共7页郭丽民 张晓玲 黄燕妍 赵存寿 张成鑫 付国明 
甘肃省自然科学基金(No.22JR11RA185)。
目的 研究肃北县鼠疫菌差异区段(DFR)、规律成簇的间隔短回文重复序列(CRISPR)及可变数目串联重复序列(VNTR)的基因多态性特征,指导突发鼠疫疫情的溯源。方法 对1973-2017年间肃北县鼠疫疫源地不同动物宿主分离的89株鼠疫菌进行培养,提...
关键词：肃北县 差异区段 规律成簇的间隔短回文重复序列 多位点可变数目串联重复序列 
可变数目串联重复序列和全基因组测序在一起学校结核传播中的应用
《中国热带医学》2024年第8期1011-1015,共5页张秀芝 赵爱兰 张爱洁 马聪兴 徐伟 
目的利用可变数目串联重复序列(variable number tandem repeats,VNTR)和全基因组测序(whole genome sequencing,WGS)分析一起学校结核病疫情的传播情况,探讨2种基因分型方法在处理学校结核传播中的作用。方法对2019年北京市首起学校耐...
关键词：学校 结核病 全基因组测序 可变数目串联重复序列 
基因分型方法在结核分枝杆菌分型中的应用进展
《山东医药》2024年第15期103-107,共5页方梓昊 赵文丽 徐雁南 郑佳雄 纪丽微 刘苏洋 林健雄 常巧呈 
结核分枝杆菌(Mtb)基因分型在结核病流行病学研究中应用广泛,对结核病疫情的监测、溯源和防控具有重要意义。Mtb基因分型方法中,IS6110限制性片段长度多态性分型曾经是国际公认的Mtb分型的“金标准”,但其缺陷明显,包括分型能力不足、...
关键词：结核分枝杆菌分型 基因分型 IS6110限制性片段长度多态性分型 间隔区寡核苷酸分型 长序列多态性分型 可变数目串联重复序列分型 单核苷酸多态性分型 
云南省昭通地区结核分枝杆菌临床分离株遗传多样性和耐药分子特征
《传染病信息》2024年第1期35-40,共6页钱源 范怀艳 何志坚 王梅 
云南省科技厅科技计划项目(202201AY070001-219)。
目的调查云南省昭通地区结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)临床分离株的遗传多样性和耐药分子特征。方法2022年9月—2023年8月从昆明医科大学附属昭通医院收治的298例涂阳肺结核患者中共采集了MTB 298株,用MeltPro TB测定...
关键词：云南省昭通地区 结核分枝杆菌 基因多样性 分枝杆菌散布重复单元-可变数目串联重复序列分型24位点分型 MTB间隔区寡核苷酸分型 
陕西省布鲁氏菌分离株MLVA分型研究被引量：4
《现代预防医学》2022年第3期522-526,共5页陈宝宝 聂守民 安翠红 范锁平 田国忠 孙养信 
陕西省重点研发计划项目(2018SF-001)。
目的对陕西省1952—2019年以来保存的布鲁氏菌分离株进行MLVA分型研究,了解陕西省布鲁氏菌遗传变异情况,为制定预防控制策略提供依据。方法基于MLVA技术对收集的121株布鲁氏菌分离株基因型进行研究,利用Bio Numerics 7.6软件进行聚类分...
关键词：陕西省 布鲁氏菌 多位点可变数目串联重复序列 分型研究 
2015-2019年四川省布鲁氏菌多位点可变数目串联重复序列基因分型研究被引量：3
《疾病监测》2021年第12期1281-1285,共5页李文博 周汉洪 闫国栋 胡馨月 罗春花 田国忠 杨小蓉 曾林子 廖虹瑜 祁腾 姜海 
四川省科技计划(No.2020YFS0581)。
目的使用多位点可变数目串联重复序列分析(MLVA)对四川省2015—2019年人间布鲁氏菌病(布病)分离菌株进行分型研究,为当地人间布病防控工作提供参考。方法选用MLVA-16方法对四川省布鲁氏菌株进行分型实验,通过在线数据库对比MLVA-8型别,...
关键词：布鲁氏菌病 多位点可变数目串联重复序列分析 羊种布鲁氏菌 
新疆鼠疫菌株多位点可变数目串联重复序列基因分型研究被引量：1
《中国媒介生物学及控制杂志》2021年第6期666-671,共6页李博 崔燕 刘遵季 古丽阿依·包凯西 罗勇军 麦迪娜·肖开提 王启果 雒涛 
新疆维吾尔自治区自然科学基金(2018D01C089)。
目的应用多位点可变数目串联重复序列基因分型方法,对新疆维吾尔自治区(新疆)4个类型鼠疫自然疫源地鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)分离株进行基因分型研究,探析新疆分离株与我国其他鼠疫疫源地分离株之间的遗传进化关系。方法收集2015-2019年新...
关键词：多位点可变数目串联重复序列分析 多色毛细管电泳 鼠疫耶尔森菌 新疆 
天津市监狱羁押人群结核病患者分离菌株的分子流行病学研究
《中国慢性病预防与控制》2021年第9期688-691,共4页赵慧 谢彤 王春花 巨韩芳 孙蕊 李旭 
天津市人事局企业博士后创新项目(2014030)。
目的研究天津地区监狱流行的结核分枝杆菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)菌株的主要基因型,菌株间的进化关系以及结核病在监狱羁押人员中传播的主要模式。方法选取天津市结核病控制中心参比实验室菌株库中保存的2013年1月至2016年6...
关键词：结核分枝杆菌 基因分型 分子流行病学 可变数目串联重复序列 差异区域 监狱 
甘肃省鼠疫耶尔森菌多位点可变数目串联重复序列基因分型及地区分布被引量：4
《中国人兽共患病学报》2021年第8期715-721,共7页郭丽民 席进孝 葛亚俊 王宇萌 苗克军 吴斌 徐大琴 
国家自然科学基金(No.81560541);甘肃省卫生行业计划项目(No.GSWSKY-2017-21)联合资助。
目的采用多位点可变数目串联重复序列(MLVA)对甘肃省鼠疫耶尔森菌(鼠疫菌)进行基因分型,探讨甘肃省鼠疫菌地区分布特征。方法选取1962-2014年间甘肃省各市县(区)不同生态型的鼠疫菌198株,培养并提取基因组DNA。采用14+12对引物进行PCR扩...
关键词：鼠疫耶尔森菌 MLVA 地区分布 
四川省鼠疫耶尔森菌多位点可变数目串联重复序列基因分型及流行病学研究被引量：2
《中国地方病防治》2021年第1期7-10,共4页李文博 祁腾 曾林子 廖虹瑜 梁莹 杨军 何树森 杨小蓉 周兴余 
国家科技重大专项(2018ZX10714002-003-008);四川省卫健委课题(19PJ109)。
目的使用多位点可变数目串联重复序列分析方法对四川省鼠疫耶尔森菌进行基因分型研究,为四川省鼠疫防控提供科学依据。方法选用14+12分级分型方案对四川省历年分离的132株鼠疫菌进行PCR扩增并计算重复拷贝数,通过Bio Numerics对各位点...
关键词：鼠疫 四川省 多位点可变数目串联重复序列分析 
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