基因挖掘

作品数：373被引量：934H指数：13
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一种面向功能基因挖掘的动物多组学数据集
《农业大数据学报》2025年第1期96-106,共11页刘洪 窦婧文 王越 廖勇 刘小磊 李新云 赵书红 付玉华 
国家自然科学基金面上项目(32272841);湖北国际科技合作项目(2022EHB055)。
单一的组学数据难以全面揭示基因调控性状的复杂分子机制,整合不同类型和层次的生物组学数据对于理解生物体内复杂的分子网络具有重要的意义。本数据集提供了包含21个动物物种的61191个个体水平组学数据(WGS、RNA-Seq、ChIP-Seq和ATAC-S...
关键词：多组学数据 跨物种 功能基因挖掘 个体水平 深度学习 
融合遗传算法与XGBoost的玉米百粒重相关基因挖掘被引量：4
《智能系统学报》2022年第1期170-180,共11页杨帅 郭茂祖 赵玲玲 李阳 
国家自然科学基金项目(62031003,61871020);北京市属高校高水平创新团队建设计划项目(IDHT20190506);国家重点研发计划子课题(2020YFF0305501);北京市教委科技计划重点项目(KZ201810016019).
基于RNA-Seq的转录组测序数据特征维度较高,使用传统生信方法寻找表型相关基因需要大量计算资源,且差异分析所得候选基因范围较大,进一步筛选依赖已有的先验知识。针对这一问题,本文提出了融合遗传算法和XGBoost的转录组分析方法-GA-XGB...
关键词：遗传算法 极限梯度提升算法 机器学习 玉米 转录组分析 百粒重 基因本体 京都基因与基因组百科全书 
重用抗体优良片断的免疫进化算法
《上海交通大学学报》2012年第2期239-244,共6页杨观赐 马鑫 李少波 钟勇 于丽娅 
教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目(NCET09-0094);国家高技术研究发展计划(863)项目(2009AA043203);贵州省科学技术基金资助项目(黔科合J字[2010]2095号)
基于克隆选择原理与算法,通过分析具体现象阐述了改进克隆选择算法的思想来源,设计了挖掘抗体中优秀决定基因并生成记忆集、封装优秀决定基片段、用变异抗体群中亲和度高的抗体按概率替换记忆抗体群中低亲和度抗体的方法,获得了重用抗...
关键词：克隆选择 强度帕雷托进化算法 基因挖掘 
改进的克隆选择算法与SPEA相结合的进化算法被引量：1
《四川大学学报（工程科学版）》2011年第5期109-113,共5页杨观赐 马鑫 李少波 钟勇 于丽娅 
教育部新世纪优秀人才支持计划资助项目(NCET09-0094);贵州省科学技术基金资助项目(黔科合J字[2010]2095号)
为了使进化过程中子代的繁殖能够像生物繁殖那样继承进化信息,通过挖掘抗体中优秀决定基并生成记忆集、增加高斯变异、用变异抗体群中亲和度高的抗体按概率替换记忆抗体群中低亲和度抗体等策略,提出了一种改进的克隆选择算法(ICSA)。将I...
关键词：多目标优化 进化算法 克隆选择 基因挖掘 遗传信息 
集成SDA-GO-SVM基因挖掘方法
《电脑与电信》2010年第2期67-69,共3页杨德印 
在计算学基因挖掘方法的基础上引入基因本体论GO,从而提出一种融合GO的集成基因挖掘方法,即集成SDA-GO-SVM基因挖掘方法。通过两套基因芯片表达谱数据实验并和其它方法对比,该方法能挖掘出更优的特征基因。
关键词：Gene ONTOLOGY 集成决策 基因挖掘 
生物领域知识对基因挖掘方法的影响被引量：1
《电脑知识与技术》2010年第2期902-903,共2页杨德印 
该文在以基因本体论GO（Gene Ontology，GO）为例考察生物领域知识对基于机器学习的基因挖掘方法的影响。通过基因芯片表返谱数据实验，考察几种基因挖掘方法用与不用GO信息的效果，结果表明利用GO信息，基因挖掘方法都能得到改善。
关键词：生物领域知识 GENE ONTOLOGY 基因挖掘 机器学习 
特征基因挖掘的决策森林方法被引量：5
《哈尔滨工业大学学报》2004年第4期480-483,共4页李霞 张田文 饶绍奇 李丽 
国家自然科学基金资助项目(30370798;30170515);国家高技术研究发展计划资助项目 (2 0 0 3AA2Z2 0 51 );黑龙江省科技攻关项目 (GB0 3C6 0 2 -4)
基于决策树的基因芯片数据分析方法以追求样本最大分类正确率为目标,造成大量的部分相关基因被排除,不适用于挖掘复杂疾病的相关基因.为此,提出了特征基因挖掘的决策森林方法:从多组特征子集中识别重要疾病相关基因,每个子集根据自身对...
关键词：基因表达谱 基因树 特征识别 决策森林 特征基因 基因挖掘 DNA芯片 疾病 
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