单细胞

作品数：3146被引量：6102H指数：24
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应用图像转换与深度学习提升单细胞分类精度
《遗传》2025年第3期382-392,共11页高炳熙 吴华煊 杜志强 
安徽省畜禽联合育种改良项目(2021~2025)资助。
单细胞转录组测序(single-celltranscriptomesequencing,scRNA-seq)通过高通量获取单细胞转录丰度数据,能够深入揭示细胞类型、亚型组成、特异性基因标记及功能差异,广泛应用于动植物发育生物学和重要性状解析等领域。然而,scRNA-seq数...
关键词：单细胞测序 深度学习 图像化处理 细胞分类 
单细胞精度的表达数量性状位点研究进展被引量：1
《遗传》2024年第10期795-806,共12页徐晓鹏 范小英 
国家自然科学基金项目(编号:82202047);珠江青年人才计划(编号:2021QN02Y747);广州国家实验室专项项目(编号:GZNL2024A03001)资助。
表达数量性状位点(expression quantitative trait loci,eQTL)表示控制基因表达量的遗传变异位点。eQTL分析是后全基因组关联研究时代鉴定疾病相关遗传位点功能的重要方法,且取得了诸多重要发现。传统的eQTL分析基于全基因组测序结合整...
关键词：表达数量性状位点 全基因组关联研究 单细胞转录组测序 调控元件 细胞类型特异性 
单细胞DNA甲基化测序数据处理流程与分析方法被引量：1
《遗传》2024年第10期807-819,共13页王艳妮 李佳 
国家自然科学基金项目(编号:82370148);农村和社会发展科技处/广州医科大学/广州医科大学附属第一医院重点研发计划(编号:2024B03J0046);广州国家实验室专项项目(编号:GZNL2023A02003);呼吸疾病国家重点实验室自主开放课题项目(编号:J19112006202302);广州医科大学/附属肿瘤医院科研能力提升项目(编号:02-410-2302244XM);呼吸疾病全国重点实验室自主课题基金(编号:SKLRD-Z-202307)资助。
单细胞DNA甲基化测序技术近年来取得了飞速发展,在揭示细胞间异质性及表观遗传学调控机制方面发挥着重要作用。随着测序技术的进步,单细胞甲基化数据的质量与数量也在不断提高,标准化的预处理流程与合适的分析方法对确保数据的可比性与...
关键词：单细胞DNA甲基化测序 表观遗传学 预处理 数据分析 
单细胞转录组测序在少突胶质谱系细胞异质性与神经系统疾病中的应用被引量：2
《遗传》2023年第3期198-211,共14页韩熙 罗富成 
国家自然科学基金-地区基金(编号:82060234);云南省基础研究计划项目(编号:202101BE070001-065);云南省科技厅科技人才与平台计划(编号:202005AE160019)资助。
少突胶质细胞是中枢神经系统中形成髓鞘的高度特化的胶质细胞,由少突胶质前体细胞分化而来。长期以来,围绕少突胶质谱系细胞开展的研究主要集中在少突胶质细胞发育、髓鞘形成以及少突胶质谱系细胞在神经系统疾病中的作用等。新兴的单细...
关键词：少突胶质细胞 单细胞转录组测序 细胞异质性 神经系统疾病 
单细胞基因组测序技术新进展及其在生物医学中的应用被引量：13
《遗传》2021年第2期108-117,共10页王卓 申笑涵 施奇惠 
中国博士后科学基金面上项目(编号:2019M651377);上海市“超级博士后”激励计划项目(2018-2020)资助。
随着单细胞基因组测序技术的建立与发展,对细胞基因组特征的分析进入了单细胞水平。单细胞的基因组分辨率不但使研究人员能够在单细胞尺度上分析肿瘤细胞的异质性,也使得传统上难以检测的稀有细胞的基因组研究成为可能。这些稀有细胞往...
关键词：单细胞全基因组 高通量测序 异质性 循环肿瘤细胞 
基于单细胞ATAC测序技术对18-三体综合征染色质开放性区域转录因子的分析被引量：2
《遗传》2021年第1期74-83,I0002-I0006,共15页邱晓芬 汤冬娥 虞海燕 廖秋燕 胡芷洋 周俊 赵鑫 何慧燕 梁灼健 许承明 杨明 戴勇 
广东省科技计划项目(编号:2017B020209001);深圳市科技计划项目(编号:GJHZ20180413181714541);广西重点实验室建设项目(编号:20-065-76);桂林市科学研究与技术开发计划项目(编号:2016012702-1)资助。
18-三体综合征是常见的常染色体非整倍体疾病之一,长期以来人们对18-三体综合征疾病的临床表型(如智力障碍、心脏、肾脏异常等)发生及发展相关的基因调控知之甚少。为探索影响该疾病表型的调控因子,本研究利用单细胞ATAC测序技术,对18-...
关键词：18-三体综合征 单个核细胞 单细胞ATAC测序 转录调控 转录因子 
基于单细胞靶向测序探究基因碱基突变的方法被引量：2
《遗传》2020年第7期703-713,共11页赵利楠 王娜 杨国良 苏现斌 韩泽广 
上海交通大学科技创新专项资金项目(编号:2019TPA09);国家自然科学基金青年项目(编号:81802806)资助。
分析基因碱基突变是探究肿瘤细胞克隆演化的研究方法之一。目前,常取组织不同区域的群体细胞测序,基于群体水平的基因碱基突变频率等信息绘制出肿瘤的克隆演化过程。但是,该方法易遗失低频突变,并且组织群体细胞类型不单一,不能代表特...
关键词：肿瘤细胞 基因碱基突变 克隆演化 单细胞 
单细胞测序技术及其在乳腺癌研究中的应用被引量：7
《遗传》2020年第3期250-268,共19页张强 顾明亮 
国家重点研发计划“干细胞及转化研究”重点专项(编号:2018YFA0109500);山东省自然科学基金青年基金项目(编号:ZR2019QH009)资助。
乳腺癌是起源于乳腺各级导管和乳腺上皮细胞,由增生到不典型增生而逐步发展成原位癌、早期浸润癌至浸润性癌的一种恶性肿瘤。传统高通量测序技术对乳腺癌的研究主要是鉴定与乳腺癌发生发展相关的"驱动基因",但是对于乳腺癌基因组结构变...
关键词：单细胞测序 乳腺癌 肿瘤微环境 免疫治疗 
单细胞RNA测序技术在病毒研究中的应用被引量：2
《遗传》2020年第3期269-277,共9页屈亮 李素 仇华吉 
国家自然科学基金项目(编号:31630080,31672537)资助。
单细胞RNA测序(single-cell RNA sequencing, scRNA-seq)技术已经成为不同领域中研究细胞异质性的有效工具。在病毒研究领域中,利用该技术分析病毒和细胞的转录组,可以在单细胞水平上检测病毒感染的动态变化,了解病毒与细胞间复杂的相...
关键词：单细胞RNA测序技术 细胞异质性 病毒感染 
肺癌恶性胸腔积液中稀有肿瘤细胞的鉴定与单细胞测序分析被引量：8
《遗传》2019年第2期175-184,共10页吴保军 王卓 董宇 邓宇亮 施奇惠 
国家自然科学基金项目(编号:21775103;81501613);上海交通大学"医工交叉基金"项目(编号:YG2017QN54)资助~~
肿瘤细胞的异质性是指肿瘤细胞在基因组或表型水平上具有不同特征。在外界环境压力或人为杀伤因素刺激下,肿瘤细胞具有不同的响应方式,从而导致它们在细胞增殖、侵袭转移及耐药能力等方面产生差别,尤其是一部分具有转移能力的肿瘤细胞...
关键词：肺癌 胸腔积液 肿瘤细胞 单细胞测序 
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