高变区

作品数:163被引量:383H指数:10
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无籽刺梨及其近缘种叶绿体基因组序列比较分析被引量:2
《福建农林大学学报(自然科学版)》2024年第1期39-47,共9页纵丹 黄嘉城 段晓盟 张晓琳 冯家玉 甘沛华 何承忠 
云南省专家工作站项目(202005AF150020);云南省产业技术领军人才项目(YUWR-CYJS-2020-018);云南省农业基础研究联合专项面上项目(202101BD070001-127)。
【目的】探讨无籽刺梨及其近缘种之间的系统发育关系,为蔷薇属植物后期分子鉴定和群体遗传研究奠定基础。【方法】从NCBI数据库下载了6种植物的叶绿体基因组序列,包括无籽刺梨和其近缘种。利用生物信息学方法对这些基因组序列进行了研究...
关键词:无籽刺梨 叶绿体基因组 高变区 系统发育 
遵义地区HIV/AIDS患者mtDNA HVSⅠ序列多态性分析
《中文科技期刊数据库(全文版)医药卫生》2022年第12期155-158,共4页谌宏运 
通过检测HIV/AIDS患者线粒体基因(mtDNA)高变Ⅰ区(HVSⅠ)单核苷酸多态性,探讨HIV/AIDS患者功能下降和耐药机制。方法:选择中国遵义市CDC提供的HIV/AIDS患者56例,采集其外周血,提取全血基因组,mtDNA HVSⅠ序列进行PCR扩增,将测序结果与...
关键词:HIV/AIDS 线粒体DNA 高变区Ⅰ 多态性 
益生菌Nissle 1917鞭毛蛋白高变区随机缺失及鞭毛展呈外源抗原的构建
《西南农业学报》2022年第3期707-711,共5页杨颖 金正雨 邓永军 区炳明 文明 
贵州省科学技术厅联合基金项目[黔科合LH字(2017)7268号];贵州大学引进人才项目[贵大人基合字(2016)77号];广东省基础与应用基础研究基金联合基金青年基金项目(2019A1515111186)[粤基金字(2020)6号]。
【目的】探索益生菌Nissle 1917无质粒克隆菌株(EcNc)鞭毛蛋白高变区展呈外源抗原的位点,为EcN靶向投递外源抗原提供操作策略,为优化构建遗传稳定、定植力强的功能性益生菌疫苗打下基础。【方法】以重组质粒pBR322-fliC为模板,构建EcNc ...
关键词:EcNc 鞭毛蛋白 鞭毛展呈 
联合应用线粒体SNP和线粒体DNA高变区测序排除同一母系鉴定1例
《法医学杂志》2021年第4期602-604,共3页钱雪松 
1案例1.1简要案情因申报户口需要,养父母携养女来本所,要求对养父母与养女之间是否存在亲生血缘关系进行鉴定。鉴于养父母各有一个姐姐,还要求对养父母与养女是否来源于同一母系进行鉴定。
关键词:法医遗传学 亲子鉴定 DNA测序 线粒体DNA 单核苷酸多态性 高变区 
利用猪源SUMO3标签蛋白可溶性表达猪腺病毒3型的Hexon基因高变区蛋白被引量:1
《畜牧与兽医》2020年第3期107-111,共5页李志要 孙阳阳 鲍恩东 吕英军 
江苏高校优势学科建设工程资助项目(PAPD)。
利用猪源小泛素化相关修饰蛋白可溶性表达猪腺病毒3型(PADV-3)的主要衣壳蛋白六邻体蛋白(Hexon)基因的高变区蛋白,为检测试剂盒和亚单位疫苗的开发奠定基础。本试验扩增出猪腺病毒3型的Hexon基因中的超变区(HVR1~HVR6)片段,并在其N端添...
关键词:猪腺病毒3型 六邻体蛋白高变区 SUMO3 可溶性表达 
不同16S rDNA高变区选择对细菌性阴道病菌群研究差异比较被引量:4
《现代妇产科进展》2019年第11期804-807,共4页刘瑛 张琼琼 张蕾 王颖 吕涛 陶址 黄振宇 廖秦平 
国家自然科学基金(No:81671409);北京市医院管理局临床医学发展专项经费(No:XMLX201605)
目的:分析不同16S rDNA高变区对细菌性阴道病菌群研究的差异,为选择合适的高变区扩增细菌性阴道病菌群提供理论依据。方法:选取2017年10月至2018年5月于北京清华长庚医院妇科门诊就诊的28例健康女性和10例细菌性阴道病患者,收集患者的...
关键词:16S rDNA高通量测序 引物 阴道菌群 菌群多样性 
猪流行性腹泻病毒流行株S蛋白高变区B细胞线性表位肽的鉴定
《微生物学通报》2019年第7期1772-1784,共13页刘英杰 李凤平 董世娟 王瑞阳 于瑞嵩 王燕 李震 
国家重点研发计划项目(2016YFD0500101);国家自然科学基金(31402219,31572519);上海市科技兴农重点攻关项目(沪农科攻字(2015)第6-1-9号)~~
【背景】对猪流行性腹泻病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV)经典毒株与流行毒株S蛋白氨基酸序列比对显示,变异位点主要集中在S蛋白的N端。【目的】鉴定PEDV流行毒株S蛋白高变区(S10A,1-496 aa)的B细胞线性表位肽,特别是流行毒...
关键词:猪流行性腹泻病毒 纤突蛋白高变区 多克隆抗体 B细胞线性表位 
人腺病毒六邻体高变区蛋白的亚克隆表达及纯化
《国际免疫学杂志》2019年第3期229-234,共6页李烨 曲丽欣 董妥 王迎晨 张哲 杜溪乔 路冰 高虹 商蕾 李宇 O.N.Reva V.I.Zlobin 曲章义 
国家自然科学基金(31370074);黑龙江省医学科学院转化专项(201621,201717);哈尔滨医科大学中俄医学中心成果转化专项(人呼吸道腺病毒重组疫苗的转化研究).
目的克隆表达人腺病六邻体高变区片段,了解其结构和功能,为研发腺病毒基因工程重组疫苗奠定基础。方法根据生物信息学软件预测的腺病毒六邻体的高变区域,选择目标基因,设计其对应的引物,并以团队保存的人腺病毒六邻体核酸序列为模板,聚...
关键词:人腺病毒 六邻体高变区片段 蛋白质表达 蛋白质纯化 
基于线粒体DNA控制区高变区的黄河流域光泽黄颡鱼群体遗传学分析被引量:4
《中国海洋大学学报(自然科学版)》2018年第8期20-26,共7页宋娜 周伟 金斌松 高天翔 
公益性行业(农业)科研专项(201303050;201303048)资助~~
光泽黄颡鱼(Pelteobagrus nitidus)是广泛分布在我国黑龙江至闽江水系的一种中小型经济鱼类。为了解黄河水系光泽黄颡鱼群体遗传变异规律,本研究采用线粒体DNA控制区高变区序列对采自黄河水系光泽黄颡鱼样品进行分析。研究显示:光泽黄颡...
关键词:光泽黄颡鱼 线粒体DNA控制区 遗传多样性 黄河流域 群体历史动态 
适用于二代测序技术的细菌DNA提取方法的比较研究被引量:4
《检验检疫学刊》2018年第2期55-60,29,共7页陈佩 岳巧云 刘德星 陈利伟 邱德义 何秋星 
国家重点研发计划项目(2016YFF0203205);国家质量监督检验检疫总局科技计划项目(2017IK165);广东检验检疫局科技计划项目(2017GDK63)
为建立用于二代测序技术的最适细菌DNA提取方法。分别用磁珠法、热裂解法、试剂盒法(有溶菌酶处理和无溶菌酶处理)、超声波法、超声+热裂解法共6种方法提取等量混合的细菌DNA,特异性扩增其16S r RNA的V3-V4高变区基因,经二代测序并分析...
关键词:二代测序技术 细菌DNA提取方法 16S r RNA V3-V4高变区 
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