癌症基因

作品数：230被引量：218H指数：6
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基于TCGA分析肝细胞癌组织miR-5003-3p表达变化及其与患者预后的关系
《山东医药》2021年第35期6-9,共4页别蓓蓓 白宏 方欢乐 吴梦迪 
陕西省自然科学基础研究计划(2019JQ-918);西安培华学院校级重点科研项目(PHKT2001)。
目的分析肝细胞癌(HCC)组织中miR-5003-3p的表达变化,探讨其与患者临床参数、预后的关系。方法利用癌症基因图谱(TCGA)数据库下载375例份HCC组织样本和50例份癌旁组织样本的微小RNA(miRNAs)测序数据,并收集375例患者的临床资料。采用生...
关键词：肝细胞癌 miR-5003-3p 生物信息学 癌症基因图谱数据库 预后 
基于生物信息学分析KNG1在胃癌中的表达变化及临床意义
《山东医药》2021年第28期47-51,共5页马腾达 屈才浩 王瑞 李晓梅 李玉民 
目的基于生物信息学,探讨KNG1在胃癌中的表达变化及临床意义。方法利用TCGA数据库分析KNG1在胃癌中的表达及生存差异。采用Cox回归分析影响胃癌患者预后的独立危险因素,进一步纳入多因素Cox回归分析结果,构建胃癌预后列线图。运用miRWal...
关键词：胃癌 激肽源-1 癌症基因组图集 预后 
基于细胞毒性T淋巴细胞相关基因肝细胞癌预后模型的构建及功能分析被引量：1
《山东医药》2021年第19期63-67,共5页叶必成 缪夏晔 刘树青 
目的构建基于细胞毒性T淋巴细胞(CTL)相关基因肝细胞癌(HCC)预后模型,并验证其对HCC患者预后预测的价值。方法从癌症基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)下载HCC患者mRNA基因表达谱数据及对应的临床信息,并使用Lasso-Cox回归构...
关键词：肝细胞癌 癌症基因组图谱 国际癌症基因组联盟 细胞毒性T淋巴细胞 预后模型 
基于铁死亡基因喉癌预后预测模型的构建被引量：2
《山东医药》2021年第19期71-73,共3页孙娟 杨莉娜 崔昊晶 胡文良 苏琳 
内蒙古自然科学基金资助项目(2017MS0838,2019LH08027);内蒙古医科大学附属医院一般项目(NYFY YB 027)。
目的基于美国癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析影响喉癌预后的铁死亡基因,建立喉癌预后预测模型。方法从TCGA下载喉癌样本的转录组数据及临床信息数据。用R语言limma包筛选喉癌差异表达基因,用R语言survival包筛选喉癌生存时间相关基因...
关键词：喉癌 铁死亡基因 预后 美国癌症基因组图谱数据库 模型 
DNAJC13在HCC中表达及其与预后的关系
《山东医药》2021年第7期78-81,共4页苏雨 田振华 罗丹丹 齐祥宇 刘鲁娜 管庆波 
目的探讨DNAJC13在肝细胞癌(HCC)中表达及其与预后的关系。方法应用生物信息学方法从癌症基因组图集(TCGA)、国际癌症基因组联盟(ICGC)及基因表达集(GEO)数据库中收集HCC mRNA表达数据,分析DNAJC13在HCC组织和对应癌旁组织中的表达差异...
关键词：肝细胞肝癌 DNAJC13 癌症基因组图集 国际癌症基因组联盟 
基于TCGA数据库建立胆管癌自噬相关基因预后预测模型及其应用被引量：4
《山东医药》2021年第2期6-11,共6页史华帝 左瑜芳 钟富兰 易小琼 徐祖敏 
广东省自然科学基金(2020A1515010048);广东省中医药管理局科研项目(20201179);湛江市非资助科技攻关项目(2019B01021)。
目的利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库构建胆管癌自噬相关基因(ARGs)预后预测模型。方法通过人类自噬数据库和分子特征数据库获得531个胆管癌ARGs。从TCGA数据库中选择CHOL队列的转录组和临床数据进行下载,包含胆管癌组织36例、正常胆管...
关键词：胆管癌 预后风险模型 列线图 癌症基因组图谱数据库 自噬相关基因 
生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中的表达差异被引量：5
《山东医药》2018年第48期13-16,共4页邱梦君 熊枝繁 何晓晓 毕柠瑞 汪朦朦 杨盛力 
国家自然科学基金资助项目(81702885);湖北省自然科学基金资助项目(2017CFB178);中央高校基本科研业务费专项资金项目(0118530328);中国肝炎防治基金会-天晴肝病研究基金科研课题(TQGB20170005)
目的探讨生物钟基因在腹部恶性肿瘤组织中的表达差异。方法利用癌症基因组图谱数据库对14个生物钟基因(Per1、Per2、Per3、Cry1、Cry2、Timeless、CLOCK、BMAL1、NPAS2、NR1D1、NR1D2、DEC1、DEC2和RORA)的RNA-Seq在6种腹部恶性肿瘤(肝...
关键词：腹部恶性肿瘤 生物钟基因 昼夜节律 癌症基因组图谱数据库 
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