RNA二级结构预测

作品数：58被引量：116H指数：7
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相关期刊：《生物物理学报》《浙江树人大学学报（自然科学版）》《计算机研究与发展》《软件学报》更多>>
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基于词汇化随机文法模型的RNA二级结构预测被引量：4
《计算机工程与科学》2009年第3期128-131,共4页唐四薪 周勇 邹赛 
衡阳师范学院科研基金资助项目(2006B63)
针对经典的随机文法模型预测RNA二级结构存在精度不高的问题,本文给出了一种词汇化随机文法模型预测RNA二级结构的方法。首先,用最大熵模型获取RNA序列中的词条信息,通过Viterbi算法搜索每个词条被标注为某种二级结构类型的最大概率;然...
关键词：RNA二级结构 随机文法 词汇化 结构预测 
RNA二级结构预测算法的设计与实现被引量：1
《计算机工程与科学》2006年第7期82-84,94,共4页李恒武 朱大铭 纪秀花 
国家自然科学基金资助项目(60273032)
本文提出了一个预测RNA二级结构的计算模型和动态规划算法。该算法采用子序列的组合策略和RNA二级结构的内在特性,计算多个平面伪结点和一个非平面伪结点结构。与Rivas算法相比,该算法减少了2n4的空间,并将时间复杂度由O(n6)降为O(n5)...
关键词：RNA二级结构 动态规划 热动力学 
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