RNA二级结构预测

作品数:58被引量:116H指数:7
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相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
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相关机构:吉林大学国防科学技术大学清华大学福建农林大学更多>>
相关期刊:《生物物理学报》《浙江树人大学学报(自然科学版)》《计算机研究与发展》《软件学报》更多>>
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基于茎区组合的RNA二级结构预测算法被引量:2
《计算机应用》2010年第6期1694-1697,共4页骆嘉伟 陈涛 
国家自然科学基金资助项目(60873184);湖南省自然科学基金资助项目(07JJ5086)
RNA二级结构预测是生物信息学的研究热点和难点,特别是对于含假结的RNA二级结构的预测,已经被证明是NP问题。根据RNA折叠的特点,提出了一种基于茎区组合的智能优化算法来预测RNA的二级结构。该算法以RNA的茎区为基本单元,结合图论思想,...
关键词:RNA二级结构 茎区 假结 拟序集 极大链 
基于快速动态权重匹配的RNA二级结构预测算法被引量:2
《计算机应用》2008年第8期2006-2009,共4页骆嘉伟 彭政 
湖南省自然科学基金资助项目(06JJ4076)
在动态权重匹配算法的基础上提出了基于快速动态权重匹配的RNA二级结构预测算法。通过引入最大动态权重茎区搜索算法降低时间复杂度和扩大搜索假结的区域提高预测假结的能力,使得快速动态权重匹配算法与动态权重匹配算法相比,不仅具有O(...
关键词:RNA 假结 二级结构 动态权重 
迁徙差分进化算法集成及其在RNA二级结构预测中的应用
《计算机应用》2008年第4期931-934,941,共5页胡桂武 胡劲松 
国家自然科学基金资助项目(60574078);广东省自然科学基金资助项目(06301003)
对优化问题和游牧民族迁徙行为的比较研究表明,两者存在相似之处。模拟游牧民族迁徙机制提出了一种迁徙策略,并且与差分进化算法相结合,提高了算法摆脱局部极值的能力;通过集成技术,充分发挥各种差分进化算法的优点,实现协同进化,提高...
关键词:迁徙策略 核醣核酸 差分进化算法 协同进化 
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