RNA二级结构预测算法

作品数:11被引量:29H指数:3
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相关领域:自动化与计算机技术生物学更多>>
相关作者:朱大铭李恒武骆嘉伟黄旭慧蒋晓舟更多>>
相关机构:国防科学技术大学山东大学山东经济学院湖南大学更多>>
相关期刊:《计算机工程与应用》《小型微型计算机系统》《计算机技术与发展》《南京大学学报(自然科学版)》更多>>
相关基金:国家自然科学基金湖南省自然科学基金国家重点基础研究发展计划国家高技术研究发展计划更多>>
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CPU/GPU系统上存储高效的RNA二级结构预测算法被引量:2
《小型微型计算机系统》2014年第5期1080-1084,共5页郑明 钟诚 
国家自然科学基金项目(60963001)资助
通过建立映射变换函数来改进基于最小自由能的RNA二级结构预测计算模型,分析证明了改进后的计算模型与原计算模型的等价性,利用改进后的计算模型使得GPU每个warp线程束内的线程并行计算矩阵元素时其所需的数据处于全局存储器同一行中,...
关键词:RNA二级结构预测 GPU计算 并行算法 动态规划 最小自由能 
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