SSR分子

作品数：1069被引量：5822H指数：31
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基于SLAF-Seq技术的辣椒抗炭疽病QTL定位分析及SSR分子标记开发
《南方农业学报》2025年第2期633-642,共10页李怡斐 段敏杰 黄任中 黄启中 王春萍 张世才 
重庆市川渝联合实施重点研发项目(cstc2021jscx-cylhX0002);重庆市自然科学基金面上项目(CSTB2022NSCQMSX0591);2023年院市级财政专项重大核心技术攻关项目(cqaas2023sjczhx002)。
【目的】利用SLAF-Seq技术对辣椒抗炭疽病QTL进行定位分析,开发与炭疽病抗性QTL紧密连锁的分子标记,为辣椒抗炭疽病分子标记辅助选择育种提供理论参考。【方法】以抗病材料PPTC26-3-1-1-1-1-1和感病材料1287为亲本构建F2代群体,并采用SL...
关键词：辣椒 SLAF-Seq 遗传图谱 炭疽病 QTL SSR分子标记 
基于三代全长转录组测序的极边扁咽齿鱼SSR分子标记开发
《南方农业学报》2023年第9期2525-2532,共8页吴晓雲 陈叶雨 龚全 刘亚 宋明江 李飞扬 李鹏程 邹巧林 欧军 赖见生 
四川省科技计划项目(2021YFYZ0015);国家现代农业产业技术体系四川淡水鱼创新团队建设专项(2019-2023)。
【目的】基于三代全长转录组测序数据,开发极边扁咽齿鱼SSR分子标记,积累和丰富该物种遗传信息,为后期指导和优化人工繁殖技术提供理论参考。【方法】基于极边扁咽齿鱼三代全长转录组测序结果(PRJNA792686),分析SSR分布情况,筛选出具有...
关键词：极边扁咽齿鱼 转录组 SSR分子标记 遗传多样性 
球茎甘蓝SSR分子标记开发及指纹图谱构建被引量：5
《南方农业学报》2023年第1期22-33,共12页李晓娟 赵文菊 赵孟良 郭怡婷 马一栋 马雪杰 任延靖 
国家重点研发计划项目(2022YFD1602400);国家大宗蔬菜产业技术体系项目(CARS-23-G26);青海省科技重点研发与转化项目(2021-NK-124);青藏高原种质资源研究与利用实验室开放课题项目(2022-ZJ-902)。
【目的】开发球茎甘蓝SSR分子标记,并构建球茎甘蓝的指纹图谱,以期从分子水平了解球茎甘蓝品种间的遗传多样性及亲缘关系,为球茎甘蓝育种材料选择提供参考。【方法】基于转录组数据,利用生物信息学方法开发球茎甘蓝的SSR标记并分析其分...
关键词：球茎甘蓝 转录组 SSR分子标记 聚类分析 指纹图谱 
云南同名地方稻种资源主要表型性状及遗传变异的比较分析被引量：3
《南方农业学报》2022年第7期1796-1808,共13页陈越 陈玲 钟巧芳 张敦宇 李婷婷 程在全 
云南省应用基础研究面上项目(202001AT070005);云南省万人计划产业技术领军人才培养计划项目(YNWR-CYJS-2018-002);云南省科技人才与平台计划项目(202005AM070029);云南省农科院科技创新及成果转化试点专项(202102AE090036-06)。
【目的】比较分析云南同名地方稻种资源主要表型性状及遗传变异,为云南地方稻种质资源的保存、研究及利用提供科学依据。【方法】以133份云南同名地方稻种资源为材料,将同名或相似名资源划为1组,共分为11组,调查其13个表型性状,计算各...
关键词：云南同名地方稻 种质资源 表型性状 SSR分子标记 
基于转录组测序的棘胸蛙SSR和SNP分子标记开发被引量：5
《南方农业学报》2022年第3期759-767,共9页魏朝宇 谢永广 魏秀英 罗华辉 陈敦学 
贵州省科技计划项目(黔科合支撑〔2019〕2344号)。
【目的】基于转录组开发SSR和SNP分子标记用于评价棘胸蛙(Quasipaa spinosa)遗传多样性,为其种质资源的创新利用提供理论支撑。【方法】采用TRIzol试剂盒提取棘胸蛙肝脏、肌肉和肾脏组织总RNA,构建cDNA文库后利用Illumina HiSeq 2500测...
关键词：棘胸蛙 SSR分子标记 SNP分子标记 分布特征 转录组测序 
云南沟谷雨林建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性被引量：3
《南方农业学报》2022年第3期850-858,共9页陈少瑜 李江 陈伟 冯弦 
中央财政林业科技推广示范项目(云2021-TG02号);云南省林业和草原科学院团队建设项目(LKYTD-2020-003)。
【目的】了解云南特有的沟谷雨林主要建群种绒毛番龙眼居群的遗传多样性及遗传结构特征,为雨林植被恢复的采种规划和恢复效果评估提供重要参考。【方法】采用SSR分子标记技术,检测分析云南省西双版纳州和普洱市思茅区的绒毛番龙眼3个天...
关键词：绒毛番龙眼 SSR分子标记 珍稀濒危树种 沟谷雨林建群种 遗传多样性 
水稻细菌性条斑病抗性基因bls2 SSR分子标记开发被引量：6
《南方农业学报》2021年第5期1167-1173,共7页罗登杰 万瑶 覃雪梅 施力军 张慧 李容柏 刘芳 
国家自然科学基金项目(32060473);广西自然科学基金项目(2019GXNSFAA185043)。
【目的】开发水稻细菌性条斑病(简称细条病)抗性基因bls2 SSR分子标记,为利用分子标记辅助选择培育水稻细条病抗性品种提供技术支撑。【方法】基于本课题组前期对细条病抗性基因bls2初定位结果,设计SL03与SL04分子标记区间的SSR引物,从...
关键词：水稻 细菌性条斑病 bls2基因 分子标记辅助选择 
广西原产和引种荔枝种质资源的遗传多样性分析及核心种质构建被引量：10
《南方农业学报》2020年第7期1537-1544,共8页李冬波 徐宁 秦献泉 李鸿莉 侯延杰 邱宏业 张树伟 朱建华 彭宏祥 
国家荔枝龙眼产业技术体系建设专项(CARS-33-03);广西自然科学基金项目(2016GXNSFAA380128);广西农业科学院科技发展基金项目(桂农科2015YT50,桂农科2016ZX06)。
【目的】利用SSR分子标记对广西荔枝种质资源进行遗传多样性分析并构建核心种质,为广西荔枝种质资源的保存、遗传改良及创新利用提供理论依据。【方法】以广西原产和引种的88份荔枝种质资源为研究对象,利用40对SSR引物对其进行遗传多样...
关键词：荔枝 SSR分子标记 遗传多样性 遗传相似系数 核心种质 聚类分析 
卵形鲳鲹基因组调研及其SSR分子标记的开发应用被引量：16
《南方农业学报》2020年第5期983-994,共12页张永德 文露婷 罗洪林 林勇 杜雪松 余艳玲 韦孜娜 黄姻 
广西创新驱动发展专项(桂科AA17204080-3,桂科AA18242031-2);广西公益性科研院所基本科研业务费专项(CXIF-2016-03)。
[目的]通过高通量测序技术调研卵形鲳鲹基因组数据并开发SSR分子标记,为卵形鲳鲹全基因组测序与组装、种质资源保护利用及良种选育提供技术支撑。[方法]通过Illumina Hiseq 2500测序平台对卵形鲳鲹基因组进行调研,采用K-mer方法对基因...
关键词：卵形鲳鲹 基因组 核苷酸重复基元 SSR分子标记 遗传多样性 
罗氏沼虾不同群体世代遗传多样性的SSR分析被引量：11
《南方农业学报》2020年第2期421-428,共8页董丁健 戴习林 
上海市虾类产业技术体系建设项目(沪农科产〔2014〕第5号)。
【目的】明确罗氏沼虾不同群体世代的遗传多样性,为其专门化选育系的选育及遗传改良提供参考依据。【方法】利用25对多态性良好的SSR分子标记对罗氏沼虾泰国群体、生长快专门化选育群体和抗病专门化选育群体的不同世代进行遗传多样性分...
关键词：罗氏沼虾 遗传多样性 泰国群体 专门化选育系 SSR分子标记 
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