云南高校图书馆联盟文献共享服务平台- ABEEM

ABEEM: 作品数：50被引量：73H指数：5; 导出分析报告; 相关领域：理学更多>>; 相关作者：杨忠志赵东霞刘翠宫利东齐世飞更多>>; 相关机构：辽宁师范大学沈阳化工大学吉林大学大连海洋大学更多>>; 相关期刊：《分子科学学报》《北华大学学报（自然科学版）》《吉首大学学报（自然科学版）》《中国科学：化学》更多>>; 相关基金：国家自然科学基金辽宁省科技厅基金辽宁省高校创新团队支持计划辽宁省高等学校优秀人才支持计划更多>>

应用ABEEM极化力场研究核酸碱基和氨基酸侧链的相互作用: 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2023年第1期56-63,共8页卢丽男杨忠志赵东霞; 国家自然科学基金资助项目(22273033)。; 对ABEEM极化力场(ABEEM PFF)对核酸碱基、氨基酸侧链以及它们之间的相互作用进行研究.ABEEM PFF将体系的电荷密度分解到了原子区域、σ键区域、π键区域和孤对电子区域,各个区域的电荷可以随着体系结构的变化以及周围环境不同而浮动,很...; 关键词：ABEEM极化力场电荷分布氢键碱基和氨基酸侧链相互作用

ABEEM-σπ方法计算的电荷对烯烃亲电加成反应性的分析: 《分子科学学报》2022年第4期306-311,共6页丁艳丽; 沈阳化工大学基金资助项目(LQ2019017);国家自然科学基金资助项目(21403142).; 以烯烃亲电加成反应为例,探讨了原子键负性均衡和σπ(ABEEM-σπ)方法计算的电荷分布对反应性的影响,研究再一次证实了烯烃亲电加成反应由起始态烯烃电荷分布决定.研究了电荷分布与活化能、哈米特常量以及静电势等之间的关联,再次体现...; 关键词：ABEEM-σπ方法电荷分布反应性烯烃反应

受损腺嘌呤与氨基酸残基堆积复合物的ABEEM极化力场: 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2022年第1期58-64,共7页刘翠王洋郑明杰尚尉郑利; 国家自然科学基金资助项目(21603091);辽宁省大学生创新创业训练项目(S202010165038);辽宁师范大学创新训练项目(CX202101010)。; 修复酶能特异性识别受损DNA,碱基与氨基酸残基间的堆叠作用是特异性识别的重要因素,遗憾的是目前没有精准的模型进行模拟.本文工作的最大贡献是在ABEEM极化力场基础上添加堆叠作用函数,调节相关π键位点参数,精准模拟受损腺嘌呤与氨基...; 关键词：受损腺嘌呤氨基酸残基堆积作用 ABEEM极化力场

应用ABEEMσπ/GB-SA方法估算4个带电二肽的溶剂化自由能: 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2019年第4期471-476,共6页赵东霞张超孟祥娜; 国家自然科学基金资助项目（21133005;21473083）; 采用B3LYP/6-311++G(d,p)理论水平优化获得体系的稳定几何结构.在相同的理论水平下,使用SMD溶剂模型,计算这些分子在水溶剂中的溶剂化自由能,并以其作为标准值.将各分子的稳定结构作为初始结构,在298 K、NVT系综下,应用ABEEMσπ可极化...; 关键词：氨基酸侧链带电二肽分子原子电荷 ABEEMσπ可极化分子力场溶剂化自由能

(Urea)_n(n=2～5)内分子间相互作用的理论化学研究: 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2019年第4期477-485,共9页宫利东郑胜男卜聪明刘翠杨忠志; 国家自然科学基金资助项目（20703022;21603091）;辽宁省科技厅自然基金计划指导项目（20180550163）; 用MP2/6-311++^G**//B3LYP/6-311++G^**方法对(Urea)n(n=2~5)复合物进行结构优化、频率和结合能的计算,并考虑基组重叠误差.研究发现,(Urea)n(n=2~5)中存在N-H…O和N-H…N两种类型的氢键,其中,N-H…O型氢键键长较短,氢键角较大,作用强...; 关键词：尿素团簇氢键结合能电荷转移 ABEEM

Studies on Hydrolysis Mechanism of Anticancer Ruthenium Drug ImH[trans-Ru（Im）2Cl4] via ABEEMσπ Polarizable Force Field Combined with QM and MD-FEP: 《Chemical Research in Chinese Universities》2017年第2期239-247,共9页; We used ABEEMon（atom-bond electronegativity equalization method） polarizable force field（ABEEMσπ PFF） method combined with QM and molecular dynamics-free energy perturbation（MD-FEP） methods to investigatethe f...; 关键词：Atom-bond ELECTRONEGATIVITY equalization method(ABEEMσπ) polarizable force field Quantum mecha-nics/molecular mechanics(QM/MM) MOLECULAR dynamics-free ENERGY perturbation Hydrolysis mechanism Activationfree ENERGY

QM/MM（ABEEM） Study on the Ligand Substitution Processes of Ruthenium（Ill） Complex NAMI-A被引量：2: 《Chinese Journal of Chemistry》2017年第3期354-362,共9页Hui Li Ting-Ting Sun Chao Zhang Linlin Liu Dongxia Zhao Zhongzhi Yang

应用ABEEMσπ方法估算含有羟基的分子的pK_a值: 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2017年第1期52-57,共6页赵东霞马悦赵健; 国家自然科学基金资助项目(21133005;21473083); 使用B3LYP/6-311++G(d,p)方法,优化获得含有羟基的训练集分子的稳定几何结构,以HF/STO-3G方法所计算的Mulliken电荷为基准,采用线性回归和最小二乘法调试出ABEEMσπ方法计算电荷所需要的参数(价态电负性χ*和价态硬度η*).探讨拟合训...; 关键词：原子-键电负性均衡原理电荷 PKA 二肽 Trp-cage蛋白质

应用ABEEMσπ极化力场对Zn^(2+)水溶液配位微结构和水交换反应进行分子动力学模拟研究: 《物理化学学报》2016年第12期2921-2931,共11页赫兰兰郭宇赵健姜新蕊杨忠志赵东霞; 国家自然科学基金(21133005;21473083);辽宁省教育厅一般项目(L2014426);辽宁师范大学实验室开放项目(cx20160111)资助~~; 应用ABEEMσπ极化力场,对Zn^(2+)水溶液体系进行分子动力学模拟,探讨Zn^(2+)的配位微结构和配体水交换反应。水分子模型采用ABEEM-7P精细水模型。模拟后对体系结构、电荷及动力学性质进行细致分析。结构分析表明,平衡体系中Zn^(2+)的...; 关键词：ABEEMσπ极化力场分子动力学模拟水交换反应径向分布函数电荷分析平均配位驻留时间

含锌蛋白结构的电荷分布及蛋白质片段的结构优化: 《辽宁师范大学学报（自然科学版）》2016年第3期362-367,共6页杨忠志金宝鑫赫兰兰; 国家自然科学基金资助项目(21473083;21133005); 在PDB数据库中选取一系列的含锌蛋白模型分子并采用B3LYP/6-31+G*方法对氢原子进行部分优化,以Mulliken电荷为基准,利用线性回归和最小二乘法进行电荷分布计算,拟合出一套适用于含锌蛋白分子电荷计算的ABEEMσπ模型电荷参数.通过测试...; 关键词：含锌蛋白模型分子电荷分布 ABEEMσπ浮动电荷极化力场可转移性

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