ABEEM/MM

作品数：31被引量：76H指数：6
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光合释氧机理的ABEEM/MM/MD和BS-DFT理论研究被引量：1
《化学学报》2017年第9期903-913,共11页郭宇 姚远 李慧 赫兰兰 朱尊伟 杨忠志 宫利东 刘翠 赵东霞 
中国国家自然科学基金(Nos.21473083;21133005);辽宁省自然科学基金(No.2014020150)资助~~
建立了S_2态光合释氧络合物(OEC)的原子-键电负性均衡模型(ABEEMσπ)的电荷参数,并使用ABEEM/MM/MD可极化力场的分子动力学模拟和对称性破损的DFT研究了光合作用制造氧气的微观机制.HF/STO-3G(采用此基组的原因请见引用文献)水平下的...
关键词：光合释氧络合物 原子-键电负性均衡模型 分子动力学模拟 对称性破损密度泛函理论 异构化 底物水结合 释氧机理 自旋态 
应用QM与ABEEM/MM结合的方法研究NAMI-A的结构性质
《化学学报》2013年第11期1547-1552,共6页邹惠园 赵东霞 杨忠志 
中国国家自然科学基金(Nos.21133005;21073080)资助~~
应用量子力学(QM)与ABEEM浮动电荷力场(ABEEM/MM)相结合的方法研究了抗癌药物NAMI-A在水溶液中的结构性质.所有的结构优化都是在DFT的B3LYP方法下采用6-31G(d,p)和LanL2DZ基组完成的,没有加入任何限制性条件.结果表明,优化得到的NAMI-A...
关键词：ABEEM MM QM QM MM NAMI-A 钌 
NH_4^+(H_2O)_n(n=1～9)的量子化学和ABEEM/MM的理论研究被引量：3
《化学学报》2011年第10期1141-1150,共10页赵飞耀 刘翠 宫利东 杨忠志 
国家自然科学基金(Nos.20633050;20703022;21011120087);辽宁省教育厅(No.2009T057)资助项目
运用量子化学和ABEEM/MM浮动电荷分子力场,构建描述铵离子-水体系相互作用的精密势能函数,对NH+4-(H2O)n(n=1～9)簇合物的结构和稳定性等性质进行了研究.对团簇的结合能和电荷布居分析发现,当n≤4时,随着水分子数目的增加,NH+4与水分子...
关键词：水合铵离子团簇 量子化学计算 ABEEM/MM模型 可极化分子力场 氢键 
水合氢离子团簇从头算和ABEEM/MM的理论研究被引量：6
《化学学报》2009年第18期2074-2080,共7页杨忠志 孟祥凤 赵东霞 宫利东 
国家自然科学基金(Nos20633050;20703022);辽宁省教育厅(NosLNET RC0503;2008S133;2007T091;20060494)资助项目
应用高水平的从头计算方法和ABEEM/MM模型,研究了水合氢离子团簇H3O+(H2O)n(n=1～6),优化得到了低能构象,探讨了其结合能和稳定性,显示出H3O+(H2O)3局域结构的优势存在.对H3O+(H2O)6VIa团簇的ABEEM电荷分布进行分析,表明第一水合层水分...
关键词：水合氢离子 从头计算方法 ABEEM/MM模型 
利用浮动电荷力场对N-甲基乙酰胺水溶液的分子动力学模拟被引量：2
《化学学报》2006年第24期2425-2430,共6页张强 张霞 杨忠志 
国家自然科学基金(No.20373021)资助项目.
利用原子键电负性均衡结合分子力场方法(ABEEM/MM)对N-甲基乙酰胺(NMA)分子的水溶液体系进行了分子动力学模拟.与经典的力场模型相比,该方法中的静电势包含了分子内和分子间的静电极化作用,以及分子内电荷转移影响,同时加入了化学键等...
关键词：原子键电负性均衡结合分子力场方法(ABEEM/MM) N-甲基乙酰胺 极化力场 分子动力学模拟 
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