ABEEM/MM

作品数:31被引量:76H指数:6
导出分析报告
相关领域:理学更多>>
相关作者:杨忠志宫利东赵东霞刘翠崔宝秋更多>>
相关机构:辽宁师范大学渤海大学济南大学更多>>
相关期刊:《分子科学学报》《Science Bulletin》《北华大学学报(自然科学版)》《河南科技大学学报(自然科学版)》更多>>
相关基金:国家自然科学基金辽宁省教育厅基金辽宁省高等学校优秀人才支持计划国家教育部博士点基金更多>>
-

检索结果分析

结果分析中...
条 记 录,以下是1-10
视图:
排序:
发展尿素与丙氨酸二肽相互作用的ABEEM/MM可极化力场
《分子科学学报》2023年第6期491-500,共10页胡端羽 刘林林 宫利东 杨忠志 
国家自然科学基金资助项目(22377048);辽宁省教育厅面上项目(LJKZ0983)。
基于ABEEM/MM浮动电荷模型,尝试建立了一个新的可合理描述尿素-丙氨酸二肽-水分子之间相互作用的可极化力场.采用量子力学(QM)ωB97X-D/6-311++G(3df, 2p)//MP2/aug-cc-pVTZ方法对(Urea)(Ala)2的结构、电荷分布及结合能进行计算,以及HF/...
关键词:ABEEM/MM 丙氨酸二肽 尿素  蛋白质变性 
光合释氧机理的ABEEM/MM/MD和BS-DFT理论研究被引量:1
《化学学报》2017年第9期903-913,共11页郭宇 姚远 李慧 赫兰兰 朱尊伟 杨忠志 宫利东 刘翠 赵东霞 
中国国家自然科学基金(Nos.21473083;21133005);辽宁省自然科学基金(No.2014020150)资助~~
建立了S_2态光合释氧络合物(OEC)的原子-键电负性均衡模型(ABEEMσπ)的电荷参数,并使用ABEEM/MM/MD可极化力场的分子动力学模拟和对称性破损的DFT研究了光合作用制造氧气的微观机制.HF/STO-3G(采用此基组的原因请见引用文献)水平下的...
关键词:光合释氧络合物 原子-键电负性均衡模型 分子动力学模拟 对称性破损密度泛函理论 异构化 底物水结合 释氧机理 自旋态 
应用QM与ABEEM/MM结合的方法研究NAMI-A的结构性质
《化学学报》2013年第11期1547-1552,共6页邹惠园 赵东霞 杨忠志 
中国国家自然科学基金(Nos.21133005;21073080)资助~~
应用量子力学(QM)与ABEEM浮动电荷力场(ABEEM/MM)相结合的方法研究了抗癌药物NAMI-A在水溶液中的结构性质.所有的结构优化都是在DFT的B3LYP方法下采用6-31G(d,p)和LanL2DZ基组完成的,没有加入任何限制性条件.结果表明,优化得到的NAMI-A...
关键词:ABEEM MM QM QM MM NAMI-A  
Development and applications of the ABEEM fluctuating charge molecular force field in the ion-containing systems被引量:11
《Science China Chemistry》2012年第12期2471-2484,共14页GONG LiDong 
supported by the National Natural Science Foundation of China(21133005 and 20703022)
The microscopic mechanisms of ion hydration and ion selectivity in biomolecular systems are long-standing research topics, in which the difficulty is how to reasonably and accurately describe the ion-water and ion-bio...
关键词:ion hydration METALLOPROTEINS fluctuating charge force field ABEEM/MM (atom-bond electronegativity equalizationmethod/molecular mechanics) quantum chemical calculation molecular dynamics simulation 
应用ABEEM/MM研究Al(Ⅲ)离子水分子体系
《当代化工》2012年第9期922-923,929,共3页彭楠 宫利东 
采用高水平的从头算方法,对铝离子水分子团簇Al3+-(H2O)n(n=1-6)在MP2/6-31++G(d,p)水平下进行了结构的研究。采用了BSSE校正且在MP2/6-311++G(2d,2p)水平下对能量进行了计算,并运用原子-键电负性均衡浮动电荷模型(ABEEM/MM),确定了Al3+...
关键词:铝离子水分子团簇 ABEEM/MM模型 结构优化计算 
Theoretical study on the hydration of hydrogen peroxide in terms of ab initio method and atom-bond electronegativity equalization method fused into molecular mechanics
《Frontiers of Chemistry in China》2011年第4期287-299,共13页Chunyang YU Lidong GONG Zhongzhi YANG 
supported by the grant from the National Natural Science Foundation of China(Nos.21133005 and 20703022);the Foundation of Education Bureau of Liaoning Province of China(No.2009T057).
In this paper,the interaction between hydrogen peroxide(HP)and water were systemically studied by atom-bond electronegativity equalization method fused into molecular mechanics(ABEEM/MM)and ab initio method.The result...
关键词:ABEEM/MM model ab initio calculation hydrogen peroxide water 
NH_4^+(H_2O)_n(n=1~9)的量子化学和ABEEM/MM的理论研究被引量:3
《化学学报》2011年第10期1141-1150,共10页赵飞耀 刘翠 宫利东 杨忠志 
国家自然科学基金(Nos.20633050;20703022;21011120087);辽宁省教育厅(No.2009T057)资助项目
运用量子化学和ABEEM/MM浮动电荷分子力场,构建描述铵离子-水体系相互作用的精密势能函数,对NH+4-(H2O)n(n=1~9)簇合物的结构和稳定性等性质进行了研究.对团簇的结合能和电荷布居分析发现,当n≤4时,随着水分子数目的增加,NH+4与水分子...
关键词:水合铵离子团簇 量子化学计算 ABEEM/MM模型 可极化分子力场 氢键 
水合锰(Ⅱ)结构的量子化学和ABEEM/MM研究被引量:6
《科学通报》2011年第19期1530-1538,共9页吕勤 刘翠 宫利东 杨忠志 
国家自然科学基金(20633050;20703022;21011120087);辽宁省教育厅基金(2009T057)资助项目
应用新一代可极化分子力场——原子-键电负性均衡浮动电荷分子力场ABEEM/MM,结合精密量子化学方法,构建了精确的Mn2+-H2O相互作用的势能函数,确定了相关参数.将该势能函数用于计算[Mn(H2O)n]2+(n=1~12)的结构和结合能,得到了与量子化...
关键词:水合锰离子 离子溶剂化 ABEEM/MM 量子化学计算 可极化分子力场 
应用ABEEM/MM模型研究异亮氨酸与水的氢键作用被引量:3
《辽宁师范大学学报(自然科学版)》2011年第1期54-58,共5页杨忠志 金子琳 
国家自然科学基金项目(20633050;20873055;20703022)
应用ABEEM/MM模型构建了异亮氨酸(Isoleucine)-水相互作用的势能函数,并将其运用到异亮氨酸与水组成的二聚体的研究中.在B3LYP/6-311++G(d,p)水平上,首先研究了异亮氨酸单体的几何构型,结果表明最稳定的构型是异亮氨酸的顺式结构,并用AB...
关键词:ABEEM/MM 异亮氨酸 氢键作用 从头算 结合能 
Sr^(2+)和Ba^(2+)水分子体系结构和结合能的从头算和ABEEM/MM研究被引量:11
《物理化学学报》2011年第2期379-387,共9页刘燕 王芳芳 于春阳 刘翠 宫利东 杨忠志 
国家自然科学基金(20633050;20703022;21011120087);辽宁省教育厅基金(2009T057)资助项目~~
应用从头算方法和ABEEM/MM浮动电荷分子力场,研究了水合碱土离子团簇Sr2+/Ba2+(H2O)n(n=1-6),构建了离子-水相互作用的ABEEM/MM势能函数,获得了水合离子团簇的稳定结构,计算了结合能.计算结果表明,ABEEM/MM方法的结果和从头算方法的结...
关键词:水合金属离子团簇 离子溶剂化 从头算方法 ABEEM/MM浮动电荷分子力场 相互作用能 
检索报告 对象比较 聚类工具 使用帮助 返回顶部